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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 求详细方法MS模拟晶体形貌和对应的晶面
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xuezheng6533

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 求详细方法MS模拟晶体形貌和对应的晶面 已有1人参与

想得到下面图片1-C和图片2-B、C的图，但是对MS什么都不懂，求详细方法，万分感谢！

求详细方法MS模拟晶体形貌和对应的晶面
图片2.jpg


求详细方法MS模拟晶体形貌和对应的晶面-1
图片1.jpg
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1楼 2015-05-21 15:40:49
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 应助指数+1 2015-05-22 18:18:04
月只蓝: 金币+10, 感谢指导 2015-05-22 18:18:11
morphology模块的说明先看看，如果是高分子晶体只能用BFDH方法，help里有专业术语必须了解——B、C、c图

b图在crystalmaker的singlecrystal可以模拟，d图可以是crystalmaker的diffraction或者ms的powder模块
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2015-05-22 08:15:14
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xuezheng6533

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2015-05-22 08:15:14
morphology模块的说明先看看，如果是高分子晶体只能用BFDH方法，help里有专业术语必须了解——B、C、c图

b图在crystalmaker的singlecrystal可以模拟，d图可以是crystalmaker的diffraction或者ms的powder模块

麻烦问一下，实在是对这个完全不懂，软件都是刚刚装好的，就是附件的这个分子，想模拟一下B、C的那种图，具体怎么做啊？需要什么前期的数据支持吗？
求详细方法MS模拟晶体形貌和对应的晶面-2
图片1.jpg
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3楼2015-05-22 16:06:30
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
xuezheng6533(月只蓝代发): 金币+5, 感谢指导 2015-05-22 18:17:56
月只蓝: 应助指数+1 2015-05-22 18:17:59
xuezheng6533: 金币+95, ★★★★★最佳答案 2015-05-23 10:27:42
引用回帖:
3楼: Originally posted by xuezheng6533 at 2015-05-22 16:06:30
麻烦问一下，实在是对这个完全不懂，软件都是刚刚装好的，就是附件的这个分子，想模拟一下B、C的那种图，具体怎么做啊？需要什么前期的数据支持吗？

图片1.jpg
...

morphology模块的输入文件需要晶体结构
help里有教程案例，可以先看看help的案例熟悉下操作
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xuezheng6533
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2015-05-22 16:47:43
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by xuezheng6533 at 2015-05-22 16:06:30
麻烦问一下，实在是对这个完全不懂，软件都是刚刚装好的，就是附件的这个分子，想模拟一下B、C的那种图，具体怎么做啊？需要什么前期的数据支持吗？

图片1.jpg
...

赞同pigrass。
图片2-B、C的图可以用MS Morphology 模块，操作比较简单的。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
5楼2015-05-22 18:20:20
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xuezheng6533

铁杆木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2015-05-22 16:47:43
morphology模块的输入文件需要晶体结构
help里有教程案例，可以先看看help的案例熟悉下操作...

麻烦问一下，还是这个分子，如果只知道晶胞参数a，b，c，α，β，γ，能做同样的模拟晶体形貌吗？具体怎么做呢？
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6楼2015-06-02 09:43:02
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
6楼: Originally posted by xuezheng6533 at 2015-06-02 09:43:02
麻烦问一下，还是这个分子，如果只知道晶胞参数a，b，c，α，β，γ，能做同样的模拟晶体形貌吗？具体怎么做呢？...

就我所知道的 没有完整的晶体结构模拟不了

你可以找找那个文献中关于那个结构引用的文献，一般会有完整信息
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xuezheng6533
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
7楼2015-06-02 09:49:58
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xuezheng6533

铁杆木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by pigrass at 2015-06-02 09:49:58
就我所知道的 没有完整的晶体结构模拟不了

你可以找找那个文献中关于那个结构引用的文献，一般会有完整信息...

好吧，我有这个分子的CIF文件，但是像有机分子这种并不能保证我的晶体和文献中的晶体是一样的啊，貌似有人小分子生长晶体，一个瓶子里有时间就可能长出几种，看来我只能用文献中的CIF文件来模拟了
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8楼2015-06-02 21:20:47
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
8楼: Originally posted by xuezheng6533 at 2015-06-02 21:20:47
好吧，我有这个分子的CIF文件，但是像有机分子这种并不能保证我的晶体和文献中的晶体是一样的啊，貌似有人小分子生长晶体，一个瓶子里有时间就可能长出几种，看来我只能用文献中的CIF文件来模拟了...

morphology 模拟的是围观的晶体形貌，不是宏观肉眼看到的样子，所以你瓶子里看到虽然不一样，但是围观形貌可能是一样的

同样的分子可能有α、β、γ等不同晶型，不确定的话尽可能找出所有的cif，模拟XRD与实验XRD比对，选择相同的模拟形貌
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9楼2015-06-03 09:12:21
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