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375642546

木虫 (正式写手)

[交流] 固体物理和MS学习 已有28人参与

化学出身,学习固体物理和MS有二十来天了,感觉比较迷茫,特此开贴:一来记录自己的学习历程,二来请各位老师同学指点,三来敦促自己加快进度。老板布置下任务要研究无机晶体异质结。初期感觉毫无头绪,后来听说需要固体物理知识,便买了黄昆先生的《固体物理学》,由于本人数学物理基础较差,看了两章多就完全看不懂了。于是,跑到图书馆借了本阎守胜先生的《固体物理导论》,更看不明白了。后来,有网友推荐了kittel的《Introduction to solid state physics》,我分别得到了中英文版本,最近对照着看这两本书,暂时还没遇到不可逾越的困难。因为后面有老板追着,《固体物理》只能抽空学,文献和MS也不敢落下。经过一番焦头烂额,最近终于知道该干点啥了,大体浏览了MS的help,就开始学习castep模块了。
(一)学习搭建初始结构。
(1)先跟着MS->Tutorials->CASTEP tutorials下做了一遍“Predicting the lattice parameters of AlAs from first principles”这个练习,基本上无脑下一步,收获甚微。参考说明书,自己动脑重做一遍。AlAs的space group是F-43m(需要补充空间群的知识),建好的晶格属于立方晶系。接下来需要add atoms了,这一步的困难是不理解fractional coordinates,只能先死搬硬套说明书了。加入Al原子后发现,该体系的布拉伐格子为“面心立方”。加入As后发现,通过对称操作,显示了本单元胞内所有原子和相邻单元胞的一些相关原子。相邻晶胞的原子需要通过rebuild crystal来除掉。除掉相邻晶胞的原子后的晶体单元看起来漂亮多了,看来,Rebuild Crystal这个工具不可小觑哦。现在得到了一个类似Zinc blende的结构。将惯用晶胞转化为原胞。Ok了,一个简单的AlAs原胞已经搭建成功。
(2)为了加强理解与记忆,决定搭建一个与MS说明书中练习的AlAs晶体差别较大的晶体,于是选定了纤锌矿ZnS结构。首先,从文献progress in Materials Science, 2011,56,175-287中找到了它的lattice parameters:a=b=3.82埃,c=6.26埃,Z=2(space group=P63mc),其中Z=2表示一个晶胞中有两个不对称单元。后来发现,Wikipedia中也可以查到纤锌矿ZnS的lattice parameters。依葫芦画瓢搭建了一个Wurtzite Zinc结构,Fig 1。在搭建过程中,感觉好像理解了什么是分数坐标(见段尾)。为了便于其它虫虫指正或者参考,这里给出纤锌矿ZnS的分数坐标,Zn(1/3,2/3,0),S(1/3,2/3,3/8)。我这些分数坐标都是通过初等几何算出来的,不知道其他虫虫有没有其它高明的手段,还请赐教。老实说,如果不参考ICSD数据库,这个构型我是搭不出来的。总的来说,搭建构型是一个非常基础,看起来简单实际上需要大量练习的活儿。
固体物理和MS学习
Fig 1.PNG
PS: Fractional coordinates:我的理解是在以a,b,c为基矢的坐标系统中,原子的中心位置相对于origin的坐标。也可以参考Wikipedia中的解释。
(3)搭建hBN。看到求助帖http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6121829&fpage=1。拿来作为练习吧。这位网友想必是个粗心的人,给出来的晶格参数诸多笔误。首先建立一个project,点击File->new建立一个3d文档。点击主菜单build->crystal->build crystal,打开build crystal对话框,在space group选项卡下的enter group选项下输入194按Tap键,在lattice parameters选项卡下的lengths下的a和c选项框内分别输入2.505和6.625(不知道网友jycyz2008给出的结构参数是否准确),点击build建立晶格。建好晶格后,如图2所示,分别加入B和N原子,即可得到hBN的晶体结构,对其进行rebuild,即得到如图3a所示的结构。建立一个2x2x1的超晶胞。如图3b所示。
固体物理和MS学习-1
图2.PNG
固体物理和MS学习-2
图3.PNG
(4)如果想用MS研究表面或者界面问题就得学习layer builder了。这个例子在MS->Tutorials->Visualizer totorials下,标题为“using the layer builder”。想要学习的童鞋,可以找这个例子跟着做。第一个例子是,搭建一个Si的孪晶,只需要四步即可。第一,搞清楚是哪两个晶面相互连接,然后使用build->surface->cleave surface劈出想要的晶面。第二步,使用build layers工具,将得到的两个晶面放到同一个.xsd文件内。第三步,将放在同一个.xsd文件内的两个晶面摆放或者对齐,为下一步将它们链接起来做准备。第四步,将两个晶面链接起来,删去多余原子。ok
第二个例子是Fe-polymer-Fe layer,大同小异。
(5) 文献JPCC 2012,116,6383里的Ag掺杂ZnO的例子还不错,比较简单。学着搭建了interstitial site(间隙位)掺杂的情况。
固体物理和MS学习-3
Fig 4.PNG



[ Last edited by 375642546 on 2013-7-29 at 16:27 ]
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正经小太郎

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也是刚开始学MS     顶你      写下去
I_come.I_compete.I_conquer.
10楼2013-08-29 12:16:24
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普通回帖
2楼2013-07-05 12:19:54
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usamwx

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
黄坤的《固体物理》还是很经典的,不一定要全部看懂,最起码得知道一些基础理论
要保持一颗感恩的心~~
3楼2013-07-05 12:46:15
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
好好写下去 这个帖子一定会成为金矿
4楼2013-07-07 22:04:52
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回①如糖

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也在学习MS,求指导啊!!!
5楼2013-07-08 22:18:11
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Sophie631001

铁杆木虫 (知名作家)

学习了
还是要做科研
6楼2013-07-08 23:37:40
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susz

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
写的非常好,多谢分享心得与经验。
7楼2013-07-17 10:15:04
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15056947440

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

8楼2013-08-27 10:14:00
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080908010

铁杆木虫 (著名写手)

继续努力
既然选择了,我们都已无法全身而退。
9楼2013-08-27 15:39:11
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