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苦逼牛逼

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 初学者请教几个关于VASP计算分子动力学的问题

之前一直用VASP做基础的构型优化、表面吸附等基态性质计算  最近开始尝试进行AIMD计算  主要模拟矿物表面溶剂化和离子分子水合构型。现有如下几个疑问  还望不吝赐教

1. 现用VASP版本为5.2.2   进行AIMD计算需要重新编译软件或修改makefile文件吗?

2. 按照http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4915756&fpage=1&target=blank 提供的算例输入文件尝试模拟了一个10倍体H2O分子簇  分别设置了1000步和3000步  一直未达到收敛  求分析(INCAR如下)


3. 针对我的主要计算内容,VASP-AIMD的一般计算步骤是什么?数据结果分析一般如何进行?


多谢各位!!!

初学者请教几个关于VASP计算分子动力学的问题
QQ截图20150515020058.jpg
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界面吸附计算化学
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苦逼牛逼

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 阿Q~~ at 2015-05-15 07:34:09
路过的看了一下,帮顶,祝福你好运!~~~~~~~~~~~~~~~~~~

hahaha。。。。好MM
界面吸附计算化学
6楼2015-05-15 07:51:47
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查看全部 26 个回答

苦逼牛逼

铁杆木虫 (著名写手)

先自顶
界面吸附计算化学
2楼2015-05-15 02:06:26
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阿Q~~

至尊木虫 (文坛精英)

★ ★
苦逼牛逼: 金币+2 2015-05-15 07:51:44
路过的看了一下,帮顶,祝福你好运!~~~~~~~~~~~~~~~~~~
自强不息,厚德载物;独立精神,自由思想。
5楼2015-05-15 07:34:09
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
苦逼牛逼: 金币+5 2015-05-15 09:06:22
ljw4010: 金币+5, 谢谢指导解答! 2015-05-15 20:09:37
1. 现用VASP版本为5.2.2   进行AIMD计算需要重新编译软件或修改makefile文件吗?
一般不用,除非你要用NPT系综或其他加速动力学方法;不过最好还是编译一下Gamma点版本,因为MD的体系一般比较大。

2. 按照http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4915756&fpage=1&target=blank 提供的算例输入文件尝试模拟了一个10倍体H2O分子簇  分别设置了1000步和3000步  一直未达到收敛  求分析(INCAR如下)
未收敛是离子步未收敛还是电子步没收敛?最好把结果文件给出来。


3. 针对我的主要计算内容,VASP-AIMD的一般计算步骤是什么?数据结果分析一般如何进行?
一般步骤是先弛豫,在进行动力学模拟。数据分析可以用VMD或者自己编一些脚本处理
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
7楼2015-05-15 08:09:34
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