| 查看: 5434 | 回复: 25 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
初学者请教几个关于VASP计算分子动力学的问题
|
|||
之前一直用VASP做基础的构型优化、表面吸附等基态性质计算 最近开始尝试进行AIMD计算 主要模拟矿物表面溶剂化和离子分子水合构型。现有如下几个疑问 还望不吝赐教 1. 现用VASP版本为5.2.2 进行AIMD计算需要重新编译软件或修改makefile文件吗？ 2. 按照http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4915756&fpage=1&target=blank 提供的算例输入文件尝试模拟了一个10倍体H2O分子簇 分别设置了1000步和3000步 一直未达到收敛 求分析（INCAR如下） 3. 针对我的主要计算内容，VASP-AIMD的一般计算步骤是什么？数据结果分析一般如何进行？ 多谢各位！！！  QQ截图20150515020058.jpg |
回复此楼» 本帖@通知
» 猜你喜欢
288求调剂
已经有14人回复
-
一志愿厦大生物学332求调剂
已经有7人回复
-
085600，321分求调剂
已经有17人回复
-
一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂
已经有16人回复
-
材料化工总分334求调剂
已经有11人回复
-
288求调剂，一志愿华南理工大学071005
已经有13人回复
-
复试调剂，一志愿郑州大学材料与化工289分
已经有20人回复
-
一志愿中科大070300化学，314分求调剂
已经有4人回复
-
285求调剂
已经有9人回复
-
材料调剂
已经有7人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Vasp相比经典分子动力学的优缺点
已经有11人回复
- 请教一个vasp分子动力学计算的问题
已经有9人回复
- 关于分子动力学的一些问题，恳请各位赐教
已经有7人回复
- vasp 计算单分子/原子 时晶胞大小的选取
已经有6人回复
- 关于VASP计算得到CHGCAR文件的数据处理以及数据单位的
已经有16人回复
- vasp计算单个氧原子和分子的能量
已经有20人回复
- 分子动力学入门
已经有19人回复
- 【任务征集】VASP跑分子动力学数据处理方法
已经有20人回复
- 【活动】vasp计算分子动力学讨论合集及专贴（筹划中）
已经有33人回复
- 【求助】VASP 计算分子解离能问题，为什么总是出错
已经有6人回复
- 【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助
已经有12人回复
- 【求助】新手求助vasp计算氧分子结合能的问题
已经有12人回复
- 【求助】请教vasp计算恒温第一原理分子动力学
已经有9人回复
- 【求助】vasp做分子动力学 升温或降温模拟问题
已经有5人回复
- 【求助】vasp分子动力学模拟求助
已经有15人回复
6楼2015-05-15 07:51:47
2楼2015-05-15 02:06:26
阿Q~~
至尊木虫 (文坛精英)
- 应助: 77 (初中生)
- 金币: 33343.6
- 红花: 107
- 帖子: 36186
- 在线: 1028.1小时
- 虫号: 3237212
- 注册: 2014-05-27
- 性别: MM
- 专业: 宇宙学
5楼2015-05-15 07:34:09
magicmonk
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 172 (高中生)
- 金币: 11451.3
- 红花: 24
- 帖子: 1124
- 在线: 3108.8小时
- 虫号: 1191315
- 注册: 2011-01-17
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
苦逼牛逼: 金币+5 2015-05-15 09:06:22
ljw4010: 金币+5, 谢谢指导解答！ 2015-05-15 20:09:37
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
苦逼牛逼: 金币+5 2015-05-15 09:06:22
ljw4010: 金币+5, 谢谢指导解答！ 2015-05-15 20:09:37
|
1. 现用VASP版本为5.2.2 进行AIMD计算需要重新编译软件或修改makefile文件吗？ 一般不用，除非你要用NPT系综或其他加速动力学方法；不过最好还是编译一下Gamma点版本，因为MD的体系一般比较大。 2. 按照http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4915756&fpage=1&target=blank 提供的算例输入文件尝试模拟了一个10倍体H2O分子簇 分别设置了1000步和3000步 一直未达到收敛 求分析（INCAR如下） 未收敛是离子步未收敛还是电子步没收敛？最好把结果文件给出来。 3. 针对我的主要计算内容，VASP-AIMD的一般计算步骤是什么？数据结果分析一般如何进行？ 一般步骤是先弛豫，在进行动力学模拟。数据分析可以用VMD或者自己编一些脚本处理 |
7楼2015-05-15 08:09:34
