应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 关于VASP计算得到CHGCAR文件的数据处理以及数据单位的
171/1返回列表
查看: 5503  |  回复: 16
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lsh1986914

新虫 (小有名气)

[交流] 关于VASP计算得到CHGCAR文件的数据处理以及数据单位的

大家好：
       本人在处理vasp计算得到的CHGCAR文件时发现一个问题。我们从vasp的手册上可以知道，CHGCAR里面的数据是指 p(r)*Vcell     前面的P(r)是指电荷密度，单位是e / A^3, 而后面的Vcell是指自己计算体系的原胞体积，当然Vcell的单位就是A^3了——前面的这一段话，不要质疑，是我通过积分验证了的。其实就是将CHGCAR里面的所有数据除以CHGCAR中网格的数目
          （NG(X,y,Z)F  —— p(r)*Vcell /(NGXF*NGYF*NGZF)   然后再求和这样就等于体系的价电子数。
      那么我想问的是大家在处理CHGCAR的数据时，是直接将CHGCAR里面的数据读出来转换成MS可视化的数据，还是把CHGCAR中的数据除以了一个Vcell 然后再转换成MS可视化的数据？这两种的单位分别是什么呢？我们作图的时候，有总电荷密度，差分电荷密度，自旋电荷密度，那么分别在处理数据时采用前面的那种方法？  组里面前任编的Fortran，总电荷密度和自旋电荷密度是直接读取然后就用了，但是在差分电荷密度的时候，又除以了原胞体积Vcell, 很不统一。然后去看他们的那些文献，发现当涉及到介绍这些图片时，单位都是很含糊，有的是
  eV/（au）^3, 也有说成这样的eV / A^3。 这里面的单位在作图时切一个面，面电荷 和 直接使用体电荷密度的 一致吗？ 不一致的话区别在哪里？
       求高人指点！！！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理相关文档

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

refors

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-06-20 10:34:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

lsh1986914

新虫 (小有名气)
这么多人都是来混金币的，对小木虫很失望！！！
赞一下(2人) 回复此楼
9楼2012-06-20 22:43:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

phd-xu

金虫 (小有名气)
★
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
个人认为尺度一样就可以了，我们用eV / A^3
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2012-06-21 10:35:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

userhung

禁虫 (文学泰斗)
★
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
看看文献哦，祝福好运~~~~~~~~~~
赞一下 回复此楼
4楼2012-06-20 16:30:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangy1220

新虫 (职业作家)
★
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
祝福楼主
回复此楼
8楼2012-06-20 17:03:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenyuchen

木虫 (正式写手)
★
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
eV/（au）^3和eV / A^3这两个单位量纲是一样的，肯定都是除了Vcell的啊。只相差一个单位换算常数而已。
电荷密度图从定义上应该是要除以Vcell的，面电荷密度应该是除以面积吧。我也没太注意这方面，你可以在经典文献里面找找看。
ps：混金币的你可以点通知版主处理，版主会帮你返还的，不要对小木虫失望哟！
赞一下 回复此楼
11楼2012-06-23 11:28:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsh1986914

新虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by chenyuchen at 2012-06-23 11:28:51
eV/（au）^3和eV / A^3这两个单位量纲是一样的，肯定都是除了Vcell的啊。只相差一个单位换算常数而已。
电荷密度图从定义上应该是要除以Vcell的，面电荷密度应该是除以面积吧。我也没太注意这方面，你可以在经典文 ...

哈哈！这几个金币不算什么滴，我说“都是来混金币的，对小木虫很失望”，这是在用激将法嘛，好让高手们都出来给我指点指点啊~
       还是很感谢所有 回帖的同志们，至少知道大家在关注着别人，谢谢大家~~~~
赞一下 回复此楼
12楼2012-06-27 21:34:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

逗号1218

新虫 (初入文坛)
★
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
我们从vasp的手册上可以知道，CHGCAR里面的数据是指 p(r)*Vcell     前面的P(r)是指电荷密度，单位是e / A^3, 而后面的Vcell是指自己计算体系的原胞体积，当然Vcell的单位就是A^3了
这句话我也看到了，不是很理解，新手呢，求指教~~~
赞一下 回复此楼
14楼2014-05-29 19:46:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaozhibin

铜虫 (正式写手)
★
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
请问下lz，为什么我对CHGCAR 求和得不到体系的价电子总数？

In CHGCAR file, the format is: WRITE(IU,FORM) (((C(NX,NY,NZ),NX=1,NGXC),NY=1,NGYZ),NZ=1,NGZC) according to the manual.
However, I made a summation of the total charge is largely different from the electrons in my system. My script is:

c--- read the charge density
open(4,file='CHGCAR',status='old')
read(4,*) (((C(NX,NY,NZ),NX=1,NGXC),NY=1,NGYC),NZ=1,NGZC)

c---- I have opened the CHGCAR file and on each axis, there are 160 grids.
do Nx=1,160
do Ny=1,160
do Nz=1,160
totalcharge = totalcharge + C(Nx,Ny,Nz)/volume
enddo
enddo
enddo

open(15,file='Charge_total.dat')
write(15,*) totalcharge

My result is 40959.9999. But in fact, my system only has two atoms. It is a CO module. I am very confused about my result but I cannot figure it out. I just read the data and make a summation. Could someone give me a hint or suggestion? Thanks!
赞一下 回复此楼
15楼2017-09-20 08:35:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

0Reliance

银虫 (正式写手)
★
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
15楼: Originally posted by gaozhibin at 2017-09-20 08:35:08
请问下lz，为什么我对CHGCAR 求和得不到体系的价电子总数？

In CHGCAR file, the format is: WRITE(IU,FORM) (((C(NX,NY,NZ),NX=1,NGXC),NY=1,NGYZ),NZ=1,NGZC) according to the manual.
However, I made a su ...

请问 你的问题解决了吗？我也在进行CHGCAR文件的数据处理，也遇到了相似的问题？
赞一下 回复此楼
16楼2019-01-09 14:50:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

refors

木虫 (小有名气)
★
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
送红花一朵
楼主， 请教下你前半段的积分过程，我做了一个12个C和16个N的体系，NGX NGY NGZ 分别为96 96 280，体系体积为880.3埃的三次方，我的电荷文件是关于一条能带的partial charge，也是说体系的电荷应该是2个电子，其中charge文件部分的积分为512000e，按照你的计算方法我得到的体系电荷是0.2个电子，刚好差了一个数量级
赞一下 回复此楼
17楼2019-02-26 11:25:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
shanly2楼
2012-06-20 16:06   回复  
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
syhorchid3楼
2012-06-20 16:27   回复  
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
icebergwu5楼
2012-06-20 16:31   回复  
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
sesame_oil6楼
2012-06-20 16:39   回复  
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
hr6307楼
2012-06-20 16:52   回复  
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
showtimexh13楼
2013-09-25 21:01   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 lsh1986914 的主题更新
171/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭