24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 5664  |  回复: 16

lsh1986914

新虫 (小有名气)


[交流] 关于VASP计算得到CHGCAR文件的数据处理以及数据单位的

大家好:
       本人在处理vasp计算得到的CHGCAR文件时发现一个问题。我们从vasp的手册上可以知道,CHGCAR里面的数据是指 p(r)*Vcell     前面的P(r)是指电荷密度,单位是e / A^3, 而后面的Vcell是指自己计算体系的原胞体积,当然Vcell的单位就是A^3了——前面的这一段话,不要质疑,是我通过积分验证了的。其实就是将CHGCAR里面的所有数据除以CHGCAR中网格的数目
          (NG(X,y,Z)F  —— p(r)*Vcell /(NGXF*NGYF*NGZF)   然后再求和这样就等于体系的价电子数。
      那么我想问的是大家在处理CHGCAR的数据时,是直接将CHGCAR里面的数据读出来转换成MS可视化的数据,还是把CHGCAR中的数据除以了一个Vcell 然后再转换成MS可视化的数据?这两种的单位分别是什么呢?我们作图的时候,有总电荷密度,差分电荷密度,自旋电荷密度,那么分别在处理数据时采用前面的那种方法?  组里面前任编的Fortran,总电荷密度和自旋电荷密度是直接读取然后就用了,但是在差分电荷密度的时候,又除以了原胞体积Vcell, 很不统一。然后去看他们的那些文献,发现当涉及到介绍这些图片时,单位都是很含糊,有的是
  eV/(au)^3, 也有说成这样的eV / A^3。 这里面的单位在作图时切一个面,面电荷 和 直接使用体电荷密度的 一致吗? 不一致的话区别在哪里?
       求高人指点!!!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理相关文档

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

lsh1986914

新虫 (小有名气)


这么多人都是来混金币的,对小木虫很失望!!!
9楼2012-06-20 22:43:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

phd-xu

金虫 (小有名气)



lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
个人认为尺度一样就可以了,我们用eV / A^3
10楼2012-06-21 10:35:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

userhung

禁虫 (文学泰斗)



lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
看看文献哦,祝福好运~~~~~~~~~~
4楼2012-06-20 16:30:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangy1220

新虫 (职业作家)



lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
祝福楼主
8楼2012-06-20 17:03:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenyuchen

木虫 (正式写手)



lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
eV/(au)^3和eV / A^3这两个单位量纲是一样的,肯定都是除了Vcell的啊。只相差一个单位换算常数而已。
电荷密度图从定义上应该是要除以Vcell的,面电荷密度应该是除以面积吧。我也没太注意这方面,你可以在经典文献里面找找看。
ps:混金币的你可以点通知版主处理,版主会帮你返还的,不要对小木虫失望哟!
11楼2012-06-23 11:28:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsh1986914

新虫 (小有名气)


引用回帖:
11楼: Originally posted by chenyuchen at 2012-06-23 11:28:51
eV/(au)^3和eV / A^3这两个单位量纲是一样的,肯定都是除了Vcell的啊。只相差一个单位换算常数而已。
电荷密度图从定义上应该是要除以Vcell的,面电荷密度应该是除以面积吧。我也没太注意这方面,你可以在经典文 ...

哈哈!这几个金币不算什么滴,我说“都是来混金币的,对小木虫很失望”,这是在用激将法嘛,好让高手们都出来给我指点指点啊~
       还是很感谢所有 回帖的同志们,至少知道大家在关注着别人,谢谢大家~~~~
12楼2012-06-27 21:34:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

逗号1218

新虫 (初入文坛)



lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
我们从vasp的手册上可以知道,CHGCAR里面的数据是指 p(r)*Vcell     前面的P(r)是指电荷密度,单位是e / A^3, 而后面的Vcell是指自己计算体系的原胞体积,当然Vcell的单位就是A^3了
这句话我也看到了,不是很理解,新手呢,求指教~~~
14楼2014-05-29 19:46:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaozhibin

铜虫 (正式写手)



lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
请问下lz,为什么我对CHGCAR 求和得不到体系的价电子总数?

In CHGCAR file, the format is: WRITE(IU,FORM) (((C(NX,NY,NZ),NX=1,NGXC),NY=1,NGYZ),NZ=1,NGZC) according to the manual.
However, I made a summation of the total charge is largely different from the electrons in my system. My script is:

c--- read the charge density
open(4,file='CHGCAR',status='old')
read(4,*) (((C(NX,NY,NZ),NX=1,NGXC),NY=1,NGYC),NZ=1,NGZC)

c---- I have opened the CHGCAR file and on each axis, there are 160 grids.
do Nx=1,160
do Ny=1,160
do Nz=1,160
totalcharge = totalcharge + C(Nx,Ny,Nz)/volume
enddo
enddo
enddo

open(15,file='Charge_total.dat')
write(15,*) totalcharge

My result is 40959.9999. But in fact, my system only has two atoms. It is a CO module. I am very confused about my result but I cannot figure it out. I just read the data and make a summation. Could someone give me a hint or suggestion? Thanks!
15楼2017-09-20 08:35:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

0Reliance

银虫 (正式写手)



lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
15楼: Originally posted by gaozhibin at 2017-09-20 08:35:08
请问下lz,为什么我对CHGCAR 求和得不到体系的价电子总数?

In CHGCAR file, the format is: WRITE(IU,FORM) (((C(NX,NY,NZ),NX=1,NGXC),NY=1,NGYZ),NZ=1,NGZC) according to the manual.
However, I made a su ...

请问 你的问题解决了吗?我也在进行CHGCAR文件的数据处理,也遇到了相似的问题?
16楼2019-01-09 14:50:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

refors

木虫 (小有名气)



lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
送红花一朵
楼主, 请教下你前半段的积分过程,我做了一个12个C和16个N的体系,NGX NGY NGZ 分别为96 96 280,体系体积为880.3埃的三次方,我的电荷文件是关于一条能带的partial charge,也是说体系的电荷应该是2个电子,其中charge文件部分的积分为512000e,按照你的计算方法我得到的体系电荷是0.2个电子,刚好差了一个数量级
17楼2019-02-26 11:25:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
shanly2楼
2012-06-20 16:06   回复  
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
syhorchid3楼
2012-06-20 16:27   回复  
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
icebergwu5楼
2012-06-20 16:31   回复  
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
2012-06-20 16:39   回复  
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
hr6307楼
2012-06-20 16:52   回复  
lsh1986914(金币+1): 谢谢参与
showtimexh13楼
2013-09-25 21:01   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 lsh1986914 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 081700,311,求调剂 +14 冬十三 2026-04-04 15/750 2026-04-06 01:57 by BruceLiu320
[考研] 301求调剂 +5 细胞相关蛋白 2026-04-02 9/450 2026-04-05 20:14 by lys0704
[考研] 复试调剂 +8 春日来信- 2026-04-03 8/400 2026-04-05 18:58 by 蓝云思雨
[考研] 26考研调剂0710 0860 +9 补补不补 2026-04-03 14/700 2026-04-04 23:32 by 果冻大王
[考研] 282电子信息0854专硕调剂 +4 202451007219 2026-04-02 6/300 2026-04-04 21:55 by laoshidan
[考研] 306求调剂 +3 hyb上名工 2026-04-02 3/150 2026-04-04 18:12 by 热情沙漠
[考研] 一志愿东北大学085901土木专硕345求调剂 +3 zxt11111 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:21 by 土木硕士招生
[考研] 一志愿北京科技大学材料工程085601,求调剂 +17 cdyw 2026-04-02 18/900 2026-04-04 11:14 by w_xuqing
[考研] 调剂0855-288 +5 x熊二a 2026-04-03 5/250 2026-04-04 00:19 by 猪会飞
[考研] 考研调剂 +5 小sun要好运 2026-04-03 5/250 2026-04-03 21:43 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +13 hanamiko 2026-04-01 13/650 2026-04-03 18:30 by ls刘帅
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:06 by arrow8852
[考研] 英一数一408,总分284,二战真诚求调剂 +13 12.27 2026-03-30 15/750 2026-04-03 14:41 by 氮气气气
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +3 cs0106 2026-04-02 5/250 2026-04-02 11:37 by olim
[考研] 279求调剂 +7 莫xiao 2026-04-01 7/350 2026-04-01 22:05 by 客尔美德
[考研] 292求调剂 +17 木虫er12138 2026-04-01 17/850 2026-04-01 21:37 by 七度不信任
[考研] 求调剂,一志愿北林食品与营养095500,301分,已过六级,有科研经历 +4 快乐储蓄罐 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:26 by JourneyLucky
[考研] 085601 329分调剂 +6 yzsa12 2026-03-31 6/300 2026-03-31 15:23 by yanflower7133
[考研] 求调剂 +8 11ggg 2026-03-30 8/400 2026-03-31 13:56 by nanaliuyun
[考研] 吉大生物学326分求调剂 +3 sunnyupup 2026-03-31 3/150 2026-03-31 09:28 by longlotian
信息提示
请填处理意见