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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 个人文集 » 【neweroica个人文集】操作VASP的CHGCAR文件的程序：chgcarman（v0.0）
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neweroica

木虫 (著名写手)

[资源] 【neweroica个人文集】操作VASP的CHGCAR文件的程序：chgcarman（v0.0）

在前面的帖子中，我发布将CHGCAR转换为cube文件的程序：chgcar2cube。见：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1809216

有时候，我们需要对多个CHGCAR文件进行加减乘除等操作（比如计算电荷密度的变化）。Gaussian提供了cubeman程序用于操作cube文件，但我发现有时会出现bug。所以，我干脆编写了这个chgcarman程序，用于直接对CHGCAR文件进行进行操作。

目前chgcarman的主要功能有：

1. 输出CHGCAR文件的属性，包括：最大值，最小值，平均值，RMS值，正负值的RMS值。这样在绘制等值面图时，有助于选取合适的等值面的数值。
2. 将两个CHGCAR文件相加。
3. 将两个CHGCAR文件相减。
4. 将CHGCAR文件乘以一个缩放因子。
5. 将CHGCAR文件平方。
6. 将CHGCAR文件取常用对数（以10为底）。


建议在Linux下进行编译和使用，则可用标准C编译器进行编译，如：
gcc -o chgcarman -lm chgcarman.c

如果你非要用Windows的话，请先设置源文件中的MS_Window值为1，然后再用C编译器进行编译。这很重要！！！否则程序虽然编译通过，但转换结果会发生严重错误。

注意：目前该程序只在Linux下测试通过，Windows下我还没有测试过，也欢迎大家测试后向我反馈结果。


程序使用帮助：
        chgcarman [option] [ file ...]
        Options:
            -a
                   Add two CHGCAR files to produce a new one.
            -h
                   Show information and usage of this program and exit.
            -l
                   Compute the logarithm of a CHGCAR file to produce a new one.
            -p
                   Get properties of a CHGCAR file  without producing a new one.
            -q
                   Compute the square of a CHGCAR file to produce a new one.
            -s
                   Substract two CHGCAR files to produce a new one.
            -x factor
                   Scale a CHGCAR file by a scaling factor to produce a new one.
        Input files:
            VASP's CHGCAR or LOCPOT files

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-16 at 21:41 ]
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1楼2010-01-24 10:45:41
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wangzg9292

木虫 (正式写手)

★★★ 三星级,支持鼓励

good!顶了
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2楼2010-01-24 12:13:46
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hookah

木虫 (正式写手)

★★★ 三星级,支持鼓励

鼓励这样的小程序,试算一下哦!
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3楼2010-01-24 19:55:19
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bingmou

金虫 (著名写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢了，用linux的shell在这一点还是不行，awk只能进行单个文件的处理（或者我不懂），所以这个软件太棒了！一定要学习一下，以后自己可以写。希望看不懂问lz，lz可以回复。谢谢
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5楼2010-01-26 15:41:50
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dsagfds

银虫 (小有名气)

★★★ 三星级,支持鼓励

顶 值得推荐
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6楼2010-02-06 21:35:50
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happyjwx

木虫 (小有名气)

★★★ 三星级,支持鼓励

下载试试看，先支持一下
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7楼2010-02-28 09:41:23
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greatqi

木虫 (正式写手)

★★★ 三星级,支持鼓励

谢谢，下来看看。
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9楼2010-05-21 15:49:37
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

如果做自旋极化的计算，还需考虑spin density= charge density (spin-up) - charge density (spin-down)。

如果楼主有兴趣，可以将你的处理vasp输出结果的c代码整合成一个类似lev00的工具。
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10楼2010-05-22 09:01:56
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bigcontinent

金虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主勇猛
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11楼2010-07-05 22:13:09
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youzhizhe

荣誉版主 (职业作家)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《材料计算模拟实用技巧》
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13楼2011-08-30 14:38:18
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stefsui

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by bingmou at 2010-01-26 15:41:50:
谢了，用linux的shell在这一点还是不行，awk只能进行单个文件的处理（或者我不懂），所以这个软件太棒了！一定要学习一下，以后自己可以写。希望看不懂问lz，lz可以回复。谢谢

awk可以处理，单纯相减的话
awk很强大.....
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14楼2011-11-26 00:52:01
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neweroica

木虫 (著名写手)
awk可以处理多个文件的
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18楼2012-02-06 03:27:28
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chuzhaonan

铁杆木虫 (著名写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主您好，编译过程中出现，“undefined reference to `sqrt'”应该如何处理呢，谢谢您！
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20楼2012-05-20 20:12:21
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chuzhaonan

铁杆木虫 (著名写手)
已解决谢谢楼主
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21楼2012-05-20 20:24:34
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qinye87

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
26楼2012-12-29 21:56:09
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ppshuang

新虫 (初入文坛)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

太赞了！！！
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32楼2014-04-25 18:09:31
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fox-fox4楼
2010-01-26 12:30   回复  
 
qzhaosdu8楼
2010-05-06 10:27   回复  
 
xh51212楼
2011-08-29 09:06   回复  
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thinkllh15楼
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huyuxiav16楼
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