24小时热门版块排行榜    

查看: 4340  |  回复: 43
【奖励】 本帖被评价37次,作者neweroica增加金币 28.3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

neweroica

木虫 (著名写手)


[资源] 【neweroica个人文集】操作VASP的CHGCAR文件的程序:chgcarman(v0.0)

在前面的帖子中,我发布将CHGCAR转换为cube文件的程序:chgcar2cube。见:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1809216

有时候,我们需要对多个CHGCAR文件进行加减乘除等操作(比如计算电荷密度的变化)。Gaussian提供了cubeman程序用于操作cube文件,但我发现有时会出现bug。所以,我干脆编写了这个chgcarman程序,用于直接对CHGCAR文件进行进行操作。

目前chgcarman的主要功能有:

1. 输出CHGCAR文件的属性,包括:最大值,最小值,平均值,RMS值,正负值的RMS值。这样在绘制等值面图时,有助于选取合适的等值面的数值。
2. 将两个CHGCAR文件相加。
3. 将两个CHGCAR文件相减。
4. 将CHGCAR文件乘以一个缩放因子。
5. 将CHGCAR文件平方。
6. 将CHGCAR文件取常用对数(以10为底)。


建议在Linux下进行编译和使用,则可用标准C编译器进行编译,如:
gcc -o chgcarman -lm chgcarman.c

如果你非要用Windows的话,请先设置源文件中的MS_Window值为1,然后再用C编译器进行编译。这很重要!!!否则程序虽然编译通过,但转换结果会发生严重错误。

注意:目前该程序只在Linux下测试通过,Windows下我还没有测试过,也欢迎大家测试后向我反馈结果。


程序使用帮助:
        chgcarman [option] [ file ...]
        Options:
            -a
                   Add two CHGCAR files to produce a new one.
            -h
                   Show information and usage of this program and exit.
            -l
                   Compute the logarithm of a CHGCAR file to produce a new one.
            -p
                   Get properties of a CHGCAR file  without producing a new one.
            -q
                   Compute the square of a CHGCAR file to produce a new one.
            -s
                   Substract two CHGCAR files to produce a new one.
            -x factor
                   Scale a CHGCAR file by a scaling factor to produce a new one.
        Input files:
            VASP's CHGCAR or LOCPOT files

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-16 at 21:41 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

材料计算模拟实用技巧 第一性原理相关文档 vasp计算资料 Photochemistry
量化经验 淘淘

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

valenhou001

至尊木虫 (职业作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

如果做自旋极化的计算,还需考虑spin density= charge density (spin-up) - charge density (spin-down)。

如果楼主有兴趣,可以将你的处理vasp输出结果的c代码整合成一个类似lev00的工具。
10楼2010-05-22 09:01:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 44 个回答

hookah

木虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

鼓励这样的小程序,试算一下哦!
3楼2010-01-24 19:55:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bingmou

金虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢了,用linux的shell在这一点还是不行,awk只能进行单个文件的处理(或者我不懂),所以这个软件太棒了!一定要学习一下,以后自己可以写。希望看不懂问lz,lz可以回复。谢谢
5楼2010-01-26 15:41:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happyjwx

木虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

下载试试看,先支持一下
7楼2010-02-28 09:41:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
xh51212楼
2011-08-29 09:06   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料调剂 +6 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 7/350 2026-03-02 10:42 by Jy?
[考研] 274求调剂 +3 cgyzqwn 2026-03-01 7/350 2026-03-02 10:38 by lature00
[考研] 欢迎采矿、地质、岩土、计算机、人工智能等专业的同学报考 +5 pin8023 2026-02-28 7/350 2026-03-02 10:33 by ZY,先生
[考研] 0854复试调剂 276 +4 wmm9 2026-03-01 6/300 2026-03-02 09:28 by 热情沙漠
[考研] 材料类求调剂 +11 wana_kiko 2026-02-28 14/700 2026-03-02 08:46 by 聪明的大松鼠
[考研] 材料复试调剂 +4 学材料的点 2026-03-01 5/250 2026-03-02 08:26 by houyaoxu
[考研] 材料化工调剂 +12 今夏不夏 2026-03-01 13/650 2026-03-01 23:32 by L135790
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +6 礼堂丁真258 2026-02-28 8/400 2026-03-01 22:50 by jian_
[基金申请] 成果系统访问量大,请一小时后再尝试。---NSFC啥时候好哦,已经两天这样了 +4 NSFC2026我来了 2026-02-28 4/200 2026-03-01 22:37 by 铁门栓
[考研] 272求调剂 +6 田智友 2026-02-28 6/300 2026-03-01 21:40 by 公瑾逍遥
[考研] 306分材料调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:48 by 无际的草原
[考研] 一志愿中南大学理学化学 +4 15779376950 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:00 by Fff-1
[考研] 272求调剂 +6 材紫有化 2026-02-28 6/300 2026-03-01 18:58 by 18137688336
[考研] 281求调剂 +4 2026计算机_诚心 2026-03-01 7/350 2026-03-01 17:20 by 2026计算机_诚心
[考研] 321求调剂一志愿东北林业大学材料与化工英二数二 +4 虫虫虫虫虫7 2026-03-01 7/350 2026-03-01 16:52 by caszguilin
[考研] 285求调剂 +8 满头大汗的学生 2026-02-28 8/400 2026-03-01 16:47 by caszguilin
[考研] 303求调剂 +4 今夏不夏 2026-03-01 4/200 2026-03-01 14:46 by 嘟嘟小浣熊
[考研] 材料284求调剂,一志愿郑州大学英一数二专硕 +10 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:12 by yc258
[基金申请] 面上模板改不了页边距吧? +5 ieewxg 2026-02-25 6/300 2026-03-01 00:10 by addressing
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
信息提示
请填处理意见