24小时热门版块排行榜    

查看: 4339  |  回复: 43
【奖励】 本帖被评价37次,作者neweroica增加金币 28.3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

neweroica

木虫 (著名写手)


[资源] 【neweroica个人文集】操作VASP的CHGCAR文件的程序:chgcarman(v0.0)

在前面的帖子中,我发布将CHGCAR转换为cube文件的程序:chgcar2cube。见:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1809216

有时候,我们需要对多个CHGCAR文件进行加减乘除等操作(比如计算电荷密度的变化)。Gaussian提供了cubeman程序用于操作cube文件,但我发现有时会出现bug。所以,我干脆编写了这个chgcarman程序,用于直接对CHGCAR文件进行进行操作。

目前chgcarman的主要功能有:

1. 输出CHGCAR文件的属性,包括:最大值,最小值,平均值,RMS值,正负值的RMS值。这样在绘制等值面图时,有助于选取合适的等值面的数值。
2. 将两个CHGCAR文件相加。
3. 将两个CHGCAR文件相减。
4. 将CHGCAR文件乘以一个缩放因子。
5. 将CHGCAR文件平方。
6. 将CHGCAR文件取常用对数(以10为底)。


建议在Linux下进行编译和使用,则可用标准C编译器进行编译,如:
gcc -o chgcarman -lm chgcarman.c

如果你非要用Windows的话,请先设置源文件中的MS_Window值为1,然后再用C编译器进行编译。这很重要!!!否则程序虽然编译通过,但转换结果会发生严重错误。

注意:目前该程序只在Linux下测试通过,Windows下我还没有测试过,也欢迎大家测试后向我反馈结果。


程序使用帮助:
        chgcarman [option] [ file ...]
        Options:
            -a
                   Add two CHGCAR files to produce a new one.
            -h
                   Show information and usage of this program and exit.
            -l
                   Compute the logarithm of a CHGCAR file to produce a new one.
            -p
                   Get properties of a CHGCAR file  without producing a new one.
            -q
                   Compute the square of a CHGCAR file to produce a new one.
            -s
                   Substract two CHGCAR files to produce a new one.
            -x factor
                   Scale a CHGCAR file by a scaling factor to produce a new one.
        Input files:
            VASP's CHGCAR or LOCPOT files

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-16 at 21:41 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

材料计算模拟实用技巧 第一性原理相关文档 vasp计算资料 Photochemistry
量化经验 淘淘

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youzhizhe

荣誉版主 (职业作家)


帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《材料计算模拟实用技巧
13楼2011-08-30 14:38:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 44 个回答

hookah

木虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

鼓励这样的小程序,试算一下哦!
3楼2010-01-24 19:55:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bingmou

金虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢了,用linux的shell在这一点还是不行,awk只能进行单个文件的处理(或者我不懂),所以这个软件太棒了!一定要学习一下,以后自己可以写。希望看不懂问lz,lz可以回复。谢谢
5楼2010-01-26 15:41:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happyjwx

木虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

下载试试看,先支持一下
7楼2010-02-28 09:41:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
xh51212楼
2011-08-29 09:06   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化工专硕342,一志愿大连理工大学,求调剂 +5 kyf化工 2026-02-28 6/300 2026-03-02 10:45 by yuchj
[考研] 求调剂 +6 yunziaaaaa 2026-03-01 7/350 2026-03-02 10:38 by @飒飒飒飒
[考研] 274求调剂 +3 cgyzqwn 2026-03-01 7/350 2026-03-02 10:38 by lature00
[考研] 材料学硕318求调剂 +6 February_Feb 2026-03-01 6/300 2026-03-02 10:36 by 聪明的大松鼠
[考研] 0856材料调剂 +4 沿岸有贝壳OUC 2026-03-02 4/200 2026-03-02 10:19 by 公瑾逍遥
[考研] 材料类求调剂 +11 wana_kiko 2026-02-28 14/700 2026-03-02 08:46 by 聪明的大松鼠
[考研] 322求调剂 +3 熊境喆 2026-03-01 3/150 2026-03-02 08:44 by houyaoxu
[考研] 材料复试调剂 +4 学材料的点 2026-03-01 5/250 2026-03-02 08:26 by houyaoxu
[考研] 哈工大计算机刘劼团队招生 +3 hit_aiot 2026-03-01 5/250 2026-03-02 07:48 by 得鹿梦鱼111
[考研] 0857调剂 +4 一ll半 2026-02-28 5/250 2026-03-02 02:33 by 908055542
[考研] 江苏省农科院招调剂1名 +3 Qwertyuop 2026-03-01 3/150 2026-03-01 23:18 by aaadim
[考研] 0856调剂 +5 刘梦微 2026-02-28 5/250 2026-03-01 22:30 by wang_dand
[硕博家园] 博士自荐 +7 科研狗111 2026-02-26 11/550 2026-03-01 22:24 by 哲平L
[考研] 0856材料求调剂 +11 hyf hyf hyf 2026-02-28 12/600 2026-03-01 18:57 by 18137688336
[考研] 0856材料求调剂 +4 麻辣鱿鱼 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:51 by caszguilin
[考研] 295复试调剂 +3 简木ChuFront 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:27 by zzxw520th
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 材料284求调剂,一志愿郑州大学英一数二专硕 +10 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:12 by yc258
[论文投稿] Optics letters投稿被拒求助 30+3 luckyry 2026-02-26 4/200 2026-03-01 09:06 by babero
[基金申请] 面上模板改不了页边距吧? +5 ieewxg 2026-02-25 6/300 2026-03-01 00:10 by addressing
信息提示
请填处理意见