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neweroica

木虫 (著名写手)


[资源] 【neweroica个人文集】操作VASP的CHGCAR文件的程序:chgcarman(v0.0)

在前面的帖子中,我发布将CHGCAR转换为cube文件的程序:chgcar2cube。见:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1809216

有时候,我们需要对多个CHGCAR文件进行加减乘除等操作(比如计算电荷密度的变化)。Gaussian提供了cubeman程序用于操作cube文件,但我发现有时会出现bug。所以,我干脆编写了这个chgcarman程序,用于直接对CHGCAR文件进行进行操作。

目前chgcarman的主要功能有:

1. 输出CHGCAR文件的属性,包括:最大值,最小值,平均值,RMS值,正负值的RMS值。这样在绘制等值面图时,有助于选取合适的等值面的数值。
2. 将两个CHGCAR文件相加。
3. 将两个CHGCAR文件相减。
4. 将CHGCAR文件乘以一个缩放因子。
5. 将CHGCAR文件平方。
6. 将CHGCAR文件取常用对数(以10为底)。


建议在Linux下进行编译和使用,则可用标准C编译器进行编译,如:
gcc -o chgcarman -lm chgcarman.c

如果你非要用Windows的话,请先设置源文件中的MS_Window值为1,然后再用C编译器进行编译。这很重要!!!否则程序虽然编译通过,但转换结果会发生严重错误。

注意:目前该程序只在Linux下测试通过,Windows下我还没有测试过,也欢迎大家测试后向我反馈结果。


程序使用帮助:
        chgcarman [option] [ file ...]
        Options:
            -a
                   Add two CHGCAR files to produce a new one.
            -h
                   Show information and usage of this program and exit.
            -l
                   Compute the logarithm of a CHGCAR file to produce a new one.
            -p
                   Get properties of a CHGCAR file  without producing a new one.
            -q
                   Compute the square of a CHGCAR file to produce a new one.
            -s
                   Substract two CHGCAR files to produce a new one.
            -x factor
                   Scale a CHGCAR file by a scaling factor to produce a new one.
        Input files:
            VASP's CHGCAR or LOCPOT files

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-16 at 21:41 ]
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chuzhaonan

铁杆木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主您好,编译过程中出现,“undefined reference to `sqrt'”应该如何处理呢,谢谢您!
20楼2012-05-20 20:12:21
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查看全部 44 个回答

hookah

木虫 (正式写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

鼓励这样的小程序,试算一下哦!
3楼2010-01-24 19:55:19
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bingmou

金虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢了,用linux的shell在这一点还是不行,awk只能进行单个文件的处理(或者我不懂),所以这个软件太棒了!一定要学习一下,以后自己可以写。希望看不懂问lz,lz可以回复。谢谢
5楼2010-01-26 15:41:50
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happyjwx

木虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

下载试试看,先支持一下
7楼2010-02-28 09:41:23
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简单回复
xh51212楼
2011-08-29 09:06   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
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