应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 初学者请教几个关于VASP计算分子动力学的问题
51/1返回列表
查看: 5325  |  回复: 25
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

苦逼牛逼

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 初学者请教几个关于VASP计算分子动力学的问题

之前一直用VASP做基础的构型优化、表面吸附等基态性质计算  最近开始尝试进行AIMD计算  主要模拟矿物表面溶剂化和离子分子水合构型。现有如下几个疑问  还望不吝赐教

1. 现用VASP版本为5.2.2   进行AIMD计算需要重新编译软件或修改makefile文件吗？

2. 按照http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4915756&fpage=1&target=blank 提供的算例输入文件尝试模拟了一个10倍体H2O分子簇  分别设置了1000步和3000步  一直未达到收敛  求分析（INCAR如下）


3. 针对我的主要计算内容，VASP-AIMD的一般计算步骤是什么？数据结果分析一般如何进行？


多谢各位！！！

初学者请教几个关于VASP计算分子动力学的问题
QQ截图20150515020058.jpg
回复此楼

» 本帖@通知

@cenwanglai @gavinliu7390 @jizw0704 @mxl10000 @nwx_ky @valenhou001

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
界面吸附计算化学
1楼 2015-05-15 02:04:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿Q~~

至尊木虫 (文坛精英)
★ ★
苦逼牛逼: 金币+2 2015-05-15 07:51:44
路过的看了一下，帮顶，祝福你好运！~~~~~~~~~~~~~~~~~~
赞一下 回复此楼
自强不息，厚德载物；独立精神，自由思想。
5楼2015-05-15 07:34:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 26 个回答

苦逼牛逼

铁杆木虫 (著名写手)
先自顶
回复此楼
界面吸附计算化学
2楼2015-05-15 02:06:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

苦逼牛逼

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 阿Q~~ at 2015-05-15 07:34:09
路过的看了一下，帮顶，祝福你好运！~~~~~~~~~~~~~~~~~~

hahaha。。。。好MM
回复此楼
界面吸附计算化学
6楼2015-05-15 07:51:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

magicmonk

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
苦逼牛逼: 金币+5 2015-05-15 09:06:22
ljw4010: 金币+5, 谢谢指导解答！ 2015-05-15 20:09:37
1. 现用VASP版本为5.2.2   进行AIMD计算需要重新编译软件或修改makefile文件吗？
一般不用，除非你要用NPT系综或其他加速动力学方法；不过最好还是编译一下Gamma点版本，因为MD的体系一般比较大。

2. 按照http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4915756&fpage=1&target=blank 提供的算例输入文件尝试模拟了一个10倍体H2O分子簇  分别设置了1000步和3000步  一直未达到收敛  求分析（INCAR如下）
未收敛是离子步未收敛还是电子步没收敛？最好把结果文件给出来。


3. 针对我的主要计算内容，VASP-AIMD的一般计算步骤是什么？数据结果分析一般如何进行？
一般步骤是先弛豫，在进行动力学模拟。数据分析可以用VMD或者自己编一些脚本处理
赞一下(1人) 回复此楼
我们最深的恐惧不是我们能力不够，我们最深的恐惧是能力超越了极限。
7楼2015-05-15 08:09:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 26 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂 ，六级已过，有科研经历 +9 曦熙兮 2026-03-15 9/450 2026-03-18 10:23 by macy2011
[考研] 265求调剂 +3 梁梁校校 2026-03-17 3/150 2026-03-18 09:12 by zhukairuo
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 326求调剂 +5 上岸的小葡 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:26 by ruiyingmiao
[考研] 【0856】化学工程（085602）313 分，本科学科评估A类院校化学工程与工艺，诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 8/400 2026-03-17 16:57 by ruiyingmiao
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +6 SUICHILD 2026-03-12 6/300 2026-03-17 09:24 by 雾散后相遇lc
[考研] 278求调剂 +3 Yy7400 2026-03-13 3/150 2026-03-17 08:24 by laoshidan
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 326求调剂 +4 诺贝尔化学奖觊� 2026-03-15 7/350 2026-03-16 17:11 by 诺贝尔化学奖觊�
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工求调剂一志愿 985 总分 295 +8 dream…… 2026-03-12 8/400 2026-03-13 22:17 by 星空星月
[考研] 工科，求调剂 +3 我887 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:39 by JourneyLucky
[考研] 0856化学工程280分求调剂 +4 shenzxsn 2026-03-11 4/200 2026-03-13 11:55 by ymwdoctor
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭