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杨柳依依625

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助关于制备枯草芽孢杆菌感受态的经验已有1人参与

通过查资料和浏览小木虫,得到了几种制备枯草感受态的方法,但实验了若干次总是失败,还经常出现感受态污染,甚至没有转化的对照组也能长出菌来。
我所用的抗生素是红霉素,因为一直没有好的效果,所以一直在做浓度梯度:0.4、4、5、6、7、8、10μg/ml。
以下是我所用的各种方法:
一、1、菌种在斜面培养2天,孢子形成率接近100%。
       2、接于5ml GMⅠ溶液,在30℃慢摇床(100rpm)振荡培养过夜。
       3、次日取2ml转接到18ml GMⅠ中,37℃快摇床(200rpm)培养3.5小时。
       4、再取10ml转接到90ml GMⅡ中,37℃慢摇床培养90分钟,离心收集菌体。
       5、用10ml上清液悬浮菌体,并加30%的灭菌甘油至10%,混匀后分装到离心管中(0.5ml/Tube),随即放到-70℃保存。
       6、转化时取出离心管,放在45℃水浴中溶化,然后在0.5ml菌液中加入适量DNA(1ug/ml)。
       7、于37℃缓慢振荡(80rpm)保温30分钟后涂抗性平板,再在37℃培养过夜,次日检查转化子。
      【培养基配方】
        1.10×最低盐溶液:K2HPO4 14g(K2HPO4.3H2O 18.34g),KH2PO4 6g,(NH4)2SO4 2g,柠檬酸钠(Na3C6H5O7.2H2O)1g,MgSO4.7H2O 0.2g,在蒸馏水中依  次溶解,加水至100ml。
        2.L- trp溶液,2mg/ml,贮于棕色瓶内,113℃灭菌30min,用黑纸包裹。
        3.GMⅠ溶液:1×最低盐溶液95ml,50%葡萄糖1ml,5%水解酪蛋白0.4ml,10%酵母汁1ml,2mg/ml L- trp 2.5ml(50ug/ml)。
        4.GMⅡ溶液:1×最低盐溶液97.5ml,50%葡萄糖1ml,5%水解酪蛋白0.08ml,10%酵母汁0.04ml,0.5M MgCl2 0.5ml(2.5mM),0.1M CaCl2 0.5ml(0.5mM),2mg/ml L- trp 0.5ml(5ug/ml)。
        于37℃缓慢振荡(80rpm)保温30分钟后涂抗性平板,再在37℃培养过夜,次日检查转化子。
        ★ ”次日取2ml转接到18ml GMⅠ中,37℃快摇床(200rpm)培养3.5小时“,我看有人说这一步大概养到OD600为0.85-0.95,但是我做的大概在2.5小时的时候就已经OD600为1.28了。整个人就凌乱了。这种比较笼统的表述对于我这种新手来说真心是个挑战,有没有哪位大神知道具体的信息?

二、1.  准备新鲜的168 单克隆平板,取一满环枯草芽孢杆菌甘油菌划LB 平板,37°C 培养箱培养12 h。
       2.  转化前一天晚间挑单菌落至3 ml LB 培养基中,37°C,250 r/min 培养过夜。
       3.  第二天上午取160 μl 培养液转接至8 ml SPI 培养基中,37°C,250 r/min 培养至对数生长末期(168 约4-5 h)。
       4.  取0.2 ml 生长至对数期末的培养液至2 ml SPII 培养基中,37 °C,100 r/min 培养90 分钟。
       5.  在上述SPII培养基的菌体中加入20 μl 10mmol/L EGTA,再于37°C,100 r/min 培养10 分钟。
       6.  将上述处理后的菌液分装成0.5 ml 每管,各加入5 μl DNA(DNA 量不能过高,不超过5 μg),再于37 °C,250 r/min 培养90 分钟,取菌液涂布筛选平板。
      【培养基配方】
      1.  SP 盐:0.2%( NH4 )2SO4,1.4% K2HPO4,0.6% KH2PO4, 0.02% MgSO4·7H2O, 0.1% 柠檬酸钠。
      2.  CAYE (100×):2 % Casamino acid,10%酵母膏。
      3.  SPI 培养基:SP 盐溶液加入1 %体积浓度为50%葡萄糖溶液,1 %体积100×CAYE 溶液。
      4.  SPII 培养基:SPI 培养基加入1 %体积50 mmol/L CaCl2 溶液,1 %体积250 mmol/L MgCl2 溶液。
      5.  SP-A Salts Solution(500 ml):0.4% (NH4)2SO4 :2 g    2.8% K2HPO4·3H2O :14 g    1.2% KH2PO4 :6 g    0.2% Trisodium Citrate Dihydrate :1g   
           121°C灭菌20 min。
      6.  SP-B Salts Solution(500 ml):0.04% MgSO4·7H2O: 0.2 g    121°C灭菌20 min。
      7.  100×CAYE Solution(100 ml):2% Casamino acid :2 g    10% Yeast Extract:10 g     121°C灭菌20 min。
      8.  SPI Medium(20 mL): SP-A Salts Solution:9.8 mL     SP-B Salts Solution:9.8 mL    (1%V)Glucose(50%w/v,115°C灭菌20 min) :200 μL     (1%V)100×CAYE:200 μL
     10.  SPII Medium(6 mL):SPI Medium:5.88mL    (1%V)50mM CaCl2 :60μL    (1%V)250mM MgCl2:60μL
     11.  100×EGTA Solution:10mmol/L EGTA 溶液,溶解时需加少量NaOH 至pH8.0。

三、① 取冻存的B.subtilis 一环,在LB 平板上划线,37℃培养过夜活化。
       ② 挑取单菌落接种于5ml LB 液体培养基中,37℃培养过夜培养(18h)。
       ③ 取一定量的过夜培养物到4.5ml的Medium A 中,使OD650 值到达0.1-0.2,留下4.5ml 混合菌液。
       ④ 37℃ 200rpm 振荡培养,每个20min 测一次OD650,当OD650 到达0.4-0.6(大约需要60-90min)时记时为t0。
       ⑤ 继续振荡培养90min,计时为t90,吸取0.05ml 菌液至存有0.45ml 预热的Medium B 的无菌试管中;
       ⑥ 37℃振荡90min,此时培养物中有很多感受态细胞形成;
       ⑦ 加1μg 的质粒(15-20ul),37℃振荡培养30min。
       ⑧ 离心去除大部分的上清液,重悬细胞,涂在含有相应抗生素的筛选平板上,37℃培养过夜
       ★ 这种方法我是从第4步开始每隔20min就测OD650,一直到基本稳定了,换成对数值后选取对数期生长率的拐点作为t0,90min后也差不多就是对数末期了,但这种方法因为需要一直测吸光度,所以我的感受态经常污染,而且也没有转化成功。

基本就是这三种方法了,因为我们实验室没有做过枯草的系统,所以很多都是我自己摸索的,比较笨,各位大神不喜勿喷。
我想肯定是有些关键点我没有Get到,一直陷在沼泽之中无法自拔。
望各位大神能倾囊相助,提供一些你们成功的经验,为小女子指点迷津,我将不胜感激!
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杨柳依依625

铁虫 (小有名气)

昨天做的一批感受态还是不行,没做转化的平板也有菌,有的形态是和枯草一样,有的根本就不一样,应该是因为污染,但是枯草也长出来是几个意思啊?好凌乱
3楼2015-05-10 08:58:15
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杨柳依依625

铁虫 (小有名气)

大神都在哪里,求回复。。。
2楼2015-05-10 08:30:52
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杨柳依依625

铁虫 (小有名气)

现在不是转化不成功的问题,主要是我的阴性对照也在抗性平板上长,这是我最大的疑惑
4楼2015-05-10 09:05:51
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liygmail

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-05-10 22:57:04
杨柳依依625: 金币+10, 有帮助 2015-05-12 14:14:42
引用回帖:
4楼: Originally posted by 杨柳依依625 at 2015-05-10 09:05:51
现在不是转化不成功的问题,主要是我的阴性对照也在抗性平板上长,这是我最大的疑惑

枯草芽孢杆菌营养递减两步法,一般步骤:
首先,菌体在丰富培养基上生长到对数期末或稳定期初期(可定期检测OD),转接贫乏培养基,生长至对数期末或稳定期初期(可定期检测OD),此时感受态效果最好。个人理解,实验环节中,某些protocol的操作参数(例如培养几小时或90min),对于不同的具体培养条件以及不同菌株,具体参数应有所差异,不宜机械照搬。

ps:阴性对照抗性平板上也长,只能说明两点:一、操作有污染,二、抗生素失效了
5楼2015-05-10 11:11:25
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