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hhl1230

新虫 (小有名气)

[求助] 我都哭了~~~~~~~~~~~·5端RACE胶图,求大神指点~~~~~~~~~~~~~~ 已有2人参与

求各位大神指点,这是我简易RACE第一轮PCR的胶图。
体系: 5′RACE Olig(T)-Adaptor 0.5
           5′RACE Adaptor           0.5
           P1                                 0.5
           模板                             1
           ddH2O                         2.5
           高保真酶                       5
条件:95°,5min;98°,10s;57°,5s;72°,1min 30s;72°,5min;4°,Forever     
           循环数:33
参考原理:共设计 4 条引物,P2 、P1 、 5′RACE Olig(T)-Adaptor 和5′RACE Adaptor, 其中 P1 和 P2 是根据已获得中间片段序列而设计的特异性引物, 并且P2 在P1的下游; 5′RACE Olig(T)-Adaptor 和 5′RACE Adaptor 是一对通用引物。首先, 反转录, 用特异性引物 P2代替反转录试剂盒中的Olig(T)在逆转录酶的作用下合成cDNA 的第一链, 用纯化试剂盒将 cDNA纯化; 其次, 在纯化产物 cDNA3′端加一个Poly(A)尾巴。取纯化 cDNA 10 μL, 5×TdT buffer 10 μL,0.1% BSA 5μL, dATP (10 mmol/L) 2.5 μL, TdT 酶1 μL, H2O 21.5 μL, 37℃ 保温 30 min 后 80℃ 终止反应 3 min。产物用 H2O 稀释为1X,10X,100X 后−20℃ 保存。

我都哭了~~~~~~~~~~~·5端RACE胶图,求大神指点~~~~~~~~~~~~~~
5端简易RACE.jpg
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hhl1230

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by changing2433 at 2015-06-24 09:12:12
楼主怎么解决的,求指教呀。我现在跑的条带拖尾好严重。...

这个拖带的是用高保真酶跑的(这个高保真酶PCR适宜退货温度在55~58°,比我引物的温度要低几度),我换了普通的Mix跑,然后就不拖带了。
7楼2015-06-26 20:17:31
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lansong9783

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-06-26 23:01:23
你的退火温度设温度梯度没有,没有特异性扩增,是不是退火温度的问题,退火时间也很短。还有98度?95度就足够了。
2楼2015-05-11 04:11:32
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hhl1230

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lansong9783 at 2015-05-11 04:11:32
你的退火温度设温度梯度没有,没有特异性扩增,是不是退火温度的问题,退火时间也很短。还有98度?95度就足够了。

哈哈。。。。现在才来逛小木虫,我的问题已经解决了。谢谢评论
3楼2015-06-01 11:17:21
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changing2433

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hhl1230 at 2015-06-01 11:17:21
哈哈。。。。现在才来逛小木虫,我的问题已经解决了。谢谢评论...

楼主怎么解决的,求指教呀。我现在跑的条带拖尾好严重。
4楼2015-06-24 09:12:12
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