应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » MS晶胞计算出现问题
251/3返回列表123下一页
查看: 3820  |  回复: 24
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

409073837

木虫 (小有名气)

[求助] MS晶胞计算出现问题 已有4人参与

从findit导出的晶胞，在MS中计算带隙和态密度，任务失败。不知道什么原因，请各位大神赐教。

MS晶胞计算出现问题
}9I$GYNXT27L$MK1V~180L8.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-05-04 20:32:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

meimeidyh

铁杆木虫 (著名写手)

进城务工人员
引用回帖:
7楼: Originally posted by 409073837 at 2015-05-05 13:16:11
2015/05/05@13:08:36  Diagnostics INFO Log file created
2015/05/05@13:11:02   - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt ERROR CASTEP terminated with unknown error status.
2015/05/05@13:11:14   - icsd P121  ...

应该是你建的结果存储文件太长了。试试改下文件夹名字。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2015-05-05 20:34:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
409073837: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-05-09 18:03:15
引用回帖:
16楼: Originally posted by 409073837 at 2015-05-06 21:59:21
Unusual difference between calculated and measured density
            Position of 36 Elements of H Are Undetermined
这个会不会也是计算不出来的原因呢？

MS软件提示：2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN No crystal system (cell setting) present in data block 2406-ICSD.
2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN Data block 2406-ICSD does not contain any connectivity information.
晶体导入后，首先要确认，MS中的晶体和ICSD数据中的晶格参数完全一致，根据MS软件提示，该cif文件中没有晶体晶系信息，请检查。

ISCD数据对晶体信息的记录：Unusual difference between calculated and measured density
这一条信息不用管。
            Position of 36 Elements of H Are Undetermined
这一条信息很关键，说明晶体中H原子的坐标没有确定出来，你可以检查一下MS中的晶格，是不是找不到H原子？
这说明这个晶体晶胞不完整的，在ICSD数据中查找其中可替代晶体结构，如果整个数据库中都没有该晶体结构信息，试着在近几年文献中查找该晶体结构。如果最新的文中仍没有，要么您放弃对该晶体进行计算；要么您通过实验培养单晶，作单晶衍射，解析出该晶体的结构，然后再计算，其中单晶培养实验+解晶体也够发一篇普通SCI文章了。
赞一下(1人) 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
18楼2015-05-09 11:40:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

meimeidyh

铁杆木虫 (著名写手)

进城务工人员

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
409073837: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-05-09 18:05:19
409073837: 金币+1 2015-05-24 21:27:16
这个对话框没有任何信息。你需要点击yes，然后把生成的结果文件贴出来，大家才能知道问题出在哪。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
2楼2015-05-04 20:43:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by meimeidyh at 2015-05-04 20:43:19
这个对话框没有任何信息。你需要点击yes，然后把生成的结果文件贴出来，大家才能知道问题出在哪。

comment : CASTEP calculation from Materials Studio
task : GeometryOptimization
xc_functional : PBE
spin_polarized : false
opt_strategy : Default
page_wvfns :        0


task : BandStructure
continuation : default
spin_polarized : false
elec_energy_tol :   1.000000000000000e-006
cut_off_energy :      340.000000000000000
xc_functional : PBE
bs_nextra_bands :       12
bs_eigenvalue_tol :   1.000000000000000e-005
calculate_stress : false
calculate_ELF : false
popn_calculate : false
calculate_hirshfeld : false
calculate_densdiff : false
pdos_calculate_weights : false
num_dump_cycles : 0
bs_write_eigenvalues : true
赞一下 回复此楼
3楼2015-05-04 20:48:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by meimeidyh at 2015-05-04 20:43:19
这个对话框没有任何信息。你需要点击yes，然后把生成的结果文件贴出来，大家才能知道问题出在哪。

我也是刚接触理论计算，不太懂。
赞一下 回复此楼
4楼2015-05-04 21:05:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meimeidyh

铁杆木虫 (著名写手)

进城务工人员
引用回帖:
3楼: Originally posted by 409073837 at 2015-05-04 20:48:00
comment : CASTEP calculation from Materials Studio
task : GeometryOptimization
xc_functional : PBE
spin_polarized : false
opt_strategy : Default
page_wvfns :        0


task : BandStructure
...

不是这个。结果文件的最下面应该有错误提示的。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
5楼2015-05-04 21:33:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

大嘴猴路路

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
409073837: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-05-09 18:06:22
点yes，打开.castep文件夹然后往下滑，最后应该有warning提示你为什么出错了，我计算的时候也出现过类似的问题，有可能是scf值设置得太小了之类的，就根据出错原因改一下参数就可以了
赞一下 回复此楼
6楼2015-05-05 09:06:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by meimeidyh at 2015-05-04 21:33:35
不是这个。结果文件的最下面应该有错误提示的。
...

2015/05/05@13:08:36  Diagnostics INFO Log file created
2015/05/05@13:11:02  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt ERROR CASTEP terminated with unknown error status.
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2.castep_bin
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2.geom
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2_BandStr.castep_bin
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2_BandStr.castep
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2_DOS.castep_bin
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2_DOS.castep
2015/05/05@13:11:15  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt ERROR Error on Job Complete. Failed to import document from D:\Documents\Materials Studio Projects\My quickstart_Files\Documents\icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt\icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt (2)\icsd P121 C1 2.xsd. - binary file with castep results not present.
2015/05/05@13:11:15  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt ERROR Files not removed from server due to previous errors.
2015/05/05@13:11:15  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN As instructed, files have been left on remote server, these may need to be manually archived.
赞一下 回复此楼
7楼2015-05-05 13:16:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 大嘴猴路路 at 2015-05-05 09:06:42
点yes，打开.castep文件夹然后往下滑，最后应该有warning提示你为什么出错了，我计算的时候也出现过类似的问题，有可能是scf值设置得太小了之类的，就根据出错原因改一下参数就可以了

2015/05/05@13:08:36  Diagnostics INFO Log file created
2015/05/05@13:11:02  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt ERROR CASTEP terminated with unknown error status.
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2.castep_bin
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2.geom
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2_BandStr.castep_bin
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2_BandStr.castep
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2_DOS.castep_bin
2015/05/05@13:11:14  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_P121_C1_2_DOS.castep
2015/05/05@13:11:15  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt ERROR Error on Job Complete. Failed to import document from D:\Documents\Materials Studio Projects\My quickstart_Files\Documents\icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt\icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt (2)\icsd P121 C1 2.xsd. - binary file with castep results not present.
2015/05/05@13:11:15  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt ERROR Files not removed from server due to previous errors.
2015/05/05@13:11:15  [6XKCJ] - icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt WARN As instructed, files have been left on remote server, these may need to be manually archived.
这是？
赞一下 回复此楼
8楼2015-05-05 13:17:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by meimeidyh at 2015-05-05 20:34:48
应该是你建的结果存储文件太长了。试试改下文件夹名字。
...

哦，好的
回复此楼
10楼2015-05-06 11:17:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 409073837 的主题更新
251/3返回列表123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 291 求调剂 +6 化工2026届毕业� 2026-03-21 7/350 2026-03-26 02:14 by BruceLiu320
[考研] 085600 材料与化工 329分求调剂 +8 Mr. Z 2026-03-25 8/400 2026-03-25 23:00 by peike
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 招08考数学 +8 laoshidan 2026-03-20 17/850 2026-03-25 17:52 by 一个红太阳
[考研] 材料277求调剂 +4 min3 2026-03-24 4/200 2026-03-25 15:29 by fch1983
[考研] 085600材料与化工调剂 +9 A-哆啦Z梦 2026-03-23 15/750 2026-03-25 11:18 by Ainin_
[考研] 278求调剂 +4 我可以上岸的对� 2026-03-19 4/200 2026-03-25 11:01 by userper
[考研] 287求调剂 +10 晨昏线与星海 2026-03-19 11/550 2026-03-25 10:35 by userper
[考研] 0703化学调剂，求导师收 +7 天天好运来上岸� 2026-03-24 7/350 2026-03-24 20:26 by peike
[考研] 求调剂 +6 研研，接电话 2026-03-24 7/350 2026-03-24 17:01 by barlinike
[考研] 一志愿211 初试270分 求调剂 +5 谷雨上岸 2026-03-23 6/300 2026-03-24 16:32 by laoshidan
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-24 5/250 2026-03-24 15:46 by 星空星月
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
[考研] 291求调剂 +8 hhhhxn.. 2026-03-23 8/400 2026-03-23 23:15 by peike
[考研] 284求调剂 +3 yanzhixue111 2026-03-23 6/300 2026-03-23 22:58 by pswait
[考研] 石河子大学（211、双一流）硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 考研调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 一志愿南昌大学，327分，材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭