应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » MS晶胞计算出现问题
252/3返回列表上一页123下一页
查看: 4214  |  回复: 24
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by meimeidyh at 2015-05-05 20:34:48
应该是你建的结果存储文件太长了。试试改下文件夹名字。
...

还是不行，试了下，计算别的晶胞都没问题，都是从findit导出来的。不知道这个为什么还是算不了
2015/05/06@11:20:36  Diagnostics INFO Log file created
2015/05/06@11:20:58  Message Box WARN Reconnected to 2 job(s), 1 of which is still running.
2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN No crystal system (cell setting) present in data block 2406-ICSD.
2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN Data block 2406-ICSD does not contain any connectivity information.
2015/05/06@12:43:28  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt ERROR CASTEP terminated with unknown error status.
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O.castep_bin
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O.geom
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O_BandStr.castep_bin
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O_BandStr.castep
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O_DOS.castep_bin
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O_DOS.castep
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt ERROR Error on Job Complete. Failed to import document from D:\Documents\Materials Studio Projects\My quickstart_Files\Documents\icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt\icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt (2)\9012546 CASTEP GeomOpt\icsd 3H2O CASTEP GeomOpt\icsd 3H2O.xsd. - binary file with castep results not present.
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt ERROR Files not removed from server due to previous errors.
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN As instructed, files have been left on remote server, these may need to be manually archived.
赞一下 回复此楼
11楼2015-05-06 12:45:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meimeidyh

铁杆木虫 (著名写手)

进城务工人员
引用回帖:
11楼: Originally posted by 409073837 at 2015-05-06 12:45:26
还是不行，试了下，计算别的晶胞都没问题，都是从findit导出来的。不知道这个为什么还是算不了
2015/05/06@11:20:36  Diagnostics INFO Log file created
2015/05/06@11:20:58  Message Box WARN Reconnected t ...

实在不行就别用倒出来的算，自己建晶胞

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
12楼2015-05-06 17:56:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by meimeidyh at 2015-05-06 17:56:56
实在不行就别用倒出来的算，自己建晶胞
...

自己构建的和导出的不是一样吗？按照相同的参数，结构都是一样的吧？
赞一下 回复此楼
13楼2015-05-06 19:48:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meimeidyh

铁杆木虫 (著名写手)

进城务工人员
引用回帖:
13楼: Originally posted by 409073837 at 2015-05-06 19:48:28
自己构建的和导出的不是一样吗？按照相同的参数，结构都是一样的吧？...

是一样的。我都是用自己建的

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
14楼2015-05-06 19:59:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by meimeidyh at 2015-05-06 19:59:57
是一样的。我都是用自己建的
...

难道是因为含有结晶水的缘故？
赞一下 回复此楼
15楼2015-05-06 21:29:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
Unusual difference between calculated and measured density
            Position of 36 Elements of H Are Undetermined
这个会不会也是计算不出来的原因呢？
赞一下 回复此楼
16楼2015-05-06 21:59:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (初入文坛)
★
409073837: 金币+1 2015-05-09 18:07:18
本帖仅楼主可见
赞一下
17楼2015-05-09 09:44:45
已阅   申请计算强帖   回复此楼   编辑   查看我的主页

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
409073837: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-05-09 18:03:15
引用回帖:
16楼: Originally posted by 409073837 at 2015-05-06 21:59:21
Unusual difference between calculated and measured density
            Position of 36 Elements of H Are Undetermined
这个会不会也是计算不出来的原因呢？

MS软件提示：2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN No crystal system (cell setting) present in data block 2406-ICSD.
2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN Data block 2406-ICSD does not contain any connectivity information.
晶体导入后，首先要确认，MS中的晶体和ICSD数据中的晶格参数完全一致，根据MS软件提示，该cif文件中没有晶体晶系信息，请检查。

ISCD数据对晶体信息的记录：Unusual difference between calculated and measured density
这一条信息不用管。
            Position of 36 Elements of H Are Undetermined
这一条信息很关键，说明晶体中H原子的坐标没有确定出来，你可以检查一下MS中的晶格，是不是找不到H原子？
这说明这个晶体晶胞不完整的，在ICSD数据中查找其中可替代晶体结构，如果整个数据库中都没有该晶体结构信息，试着在近几年文献中查找该晶体结构。如果最新的文中仍没有，要么您放弃对该晶体进行计算；要么您通过实验培养单晶，作单晶衍射，解析出该晶体的结构，然后再计算，其中单晶培养实验+解晶体也够发一篇普通SCI文章了。
赞一下(1人) 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
18楼2015-05-09 11:40:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-05-09 11:40:28
MS软件提示：2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN No crystal system (cell setting) present in data block 2406-ICSD.
2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN Data block 2406-ICSD does not contain an ...

谢谢，确实是找不到H原子，看来好像只能放弃计算了。做了单晶衍射，从jade里得到的参数也比较少吧？
赞一下 回复此楼
19楼2015-05-09 17:43:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by NUAA张泽磊 at 2015-05-09 09:44:45
我用的是gulp模块，帮不了你～
我的findit最近打不开了～你的可不可以发我一份？zelei_zhang@nuaa.edu.cn
跪谢！！

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3696968这里面的百度网盘可下载
赞一下 回复此楼
20楼2015-05-09 18:17:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 409073837 的主题更新
252/3返回列表上一页123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +9 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 15/750 2026-11-09 10:50 by Equinoxhua
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 2rKfVQg2jQww 2026-11-06 16/800 2026-11-09 06:54 by l48hFd8Nwae2
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 2rKfVQg2jQww 2026-11-06 11/550 2026-11-09 00:26 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 7/350 2026-11-06 16:43 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 8/400 2026-11-06 16:34 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 14/700 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:23 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 15/750 2026-11-06 13:49 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 18/900 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 05:32 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 12/600 2026-11-06 05:32 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 04:47 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:15 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭