应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » MS晶胞计算出现问题
252/3返回列表上一页123下一页
查看: 3790  |  回复: 24
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by meimeidyh at 2015-05-05 20:34:48
应该是你建的结果存储文件太长了。试试改下文件夹名字。
...

还是不行，试了下，计算别的晶胞都没问题，都是从findit导出来的。不知道这个为什么还是算不了
2015/05/06@11:20:36  Diagnostics INFO Log file created
2015/05/06@11:20:58  Message Box WARN Reconnected to 2 job(s), 1 of which is still running.
2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN No crystal system (cell setting) present in data block 2406-ICSD.
2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN Data block 2406-ICSD does not contain any connectivity information.
2015/05/06@12:43:28  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt ERROR CASTEP terminated with unknown error status.
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O.castep_bin
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O.geom
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O_BandStr.castep_bin
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O_BandStr.castep
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O_DOS.castep_bin
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN File not found on server: icsd_3H2O_DOS.castep
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt ERROR Error on Job Complete. Failed to import document from D:\Documents\Materials Studio Projects\My quickstart_Files\Documents\icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt\icsd P121 C1 2 CASTEP GeomOpt (2)\9012546 CASTEP GeomOpt\icsd 3H2O CASTEP GeomOpt\icsd 3H2O.xsd. - binary file with castep results not present.
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt ERROR Files not removed from server due to previous errors.
2015/05/06@12:43:38  [8QOQE] - icsd 3H2O CASTEP GeomOpt WARN As instructed, files have been left on remote server, these may need to be manually archived.
赞一下 回复此楼
11楼2015-05-06 12:45:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meimeidyh

铁杆木虫 (著名写手)

进城务工人员
引用回帖:
11楼: Originally posted by 409073837 at 2015-05-06 12:45:26
还是不行，试了下，计算别的晶胞都没问题，都是从findit导出来的。不知道这个为什么还是算不了
2015/05/06@11:20:36  Diagnostics INFO Log file created
2015/05/06@11:20:58  Message Box WARN Reconnected t ...

实在不行就别用倒出来的算，自己建晶胞

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
12楼2015-05-06 17:56:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by meimeidyh at 2015-05-06 17:56:56
实在不行就别用倒出来的算，自己建晶胞
...

自己构建的和导出的不是一样吗？按照相同的参数，结构都是一样的吧？
赞一下 回复此楼
13楼2015-05-06 19:48:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

meimeidyh

铁杆木虫 (著名写手)

进城务工人员
引用回帖:
13楼: Originally posted by 409073837 at 2015-05-06 19:48:28
自己构建的和导出的不是一样吗？按照相同的参数，结构都是一样的吧？...

是一样的。我都是用自己建的

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
14楼2015-05-06 19:59:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by meimeidyh at 2015-05-06 19:59:57
是一样的。我都是用自己建的
...

难道是因为含有结晶水的缘故？
赞一下 回复此楼
15楼2015-05-06 21:29:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
Unusual difference between calculated and measured density
            Position of 36 Elements of H Are Undetermined
这个会不会也是计算不出来的原因呢？
赞一下 回复此楼
16楼2015-05-06 21:59:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (初入文坛)
★
409073837: 金币+1 2015-05-09 18:07:18
本帖仅楼主可见
赞一下
17楼2015-05-09 09:44:45
已阅   申请计算强帖   回复此楼   编辑   查看我的主页

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
409073837: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-05-09 18:03:15
引用回帖:
16楼: Originally posted by 409073837 at 2015-05-06 21:59:21
Unusual difference between calculated and measured density
            Position of 36 Elements of H Are Undetermined
这个会不会也是计算不出来的原因呢？

MS软件提示：2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN No crystal system (cell setting) present in data block 2406-ICSD.
2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN Data block 2406-ICSD does not contain any connectivity information.
晶体导入后，首先要确认，MS中的晶体和ICSD数据中的晶格参数完全一致，根据MS软件提示，该cif文件中没有晶体晶系信息，请检查。

ISCD数据对晶体信息的记录：Unusual difference between calculated and measured density
这一条信息不用管。
            Position of 36 Elements of H Are Undetermined
这一条信息很关键，说明晶体中H原子的坐标没有确定出来，你可以检查一下MS中的晶格，是不是找不到H原子？
这说明这个晶体晶胞不完整的，在ICSD数据中查找其中可替代晶体结构，如果整个数据库中都没有该晶体结构信息，试着在近几年文献中查找该晶体结构。如果最新的文中仍没有，要么您放弃对该晶体进行计算；要么您通过实验培养单晶，作单晶衍射，解析出该晶体的结构，然后再计算，其中单晶培养实验+解晶体也够发一篇普通SCI文章了。
赞一下(1人) 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
18楼2015-05-09 11:40:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-05-09 11:40:28
MS软件提示：2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN No crystal system (cell setting) present in data block 2406-ICSD.
2015/05/06@12:37:25  CIF Importer WARN Data block 2406-ICSD does not contain an ...

谢谢，确实是找不到H原子，看来好像只能放弃计算了。做了单晶衍射，从jade里得到的参数也比较少吧？
赞一下 回复此楼
19楼2015-05-09 17:43:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

409073837

木虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by NUAA张泽磊 at 2015-05-09 09:44:45
我用的是gulp模块，帮不了你～
我的findit最近打不开了～你的可不可以发我一份？zelei_zhang@nuaa.edu.cn
跪谢！！

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3696968这里面的百度网盘可下载
赞一下 回复此楼
20楼2015-05-09 18:17:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 409073837 的主题更新
252/3返回列表上一页123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 本子写完了，给DS兄弟看了，得了92分 +3 Doma 2026-03-01 7/350 2026-03-02 00:00 by jnzsy
[考研] 材料化工调剂 +12 今夏不夏 2026-03-01 13/650 2026-03-01 23:32 by L135790
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +6 礼堂丁真258 2026-02-28 8/400 2026-03-01 22:50 by jian_
[考研] 0856调剂 +5 刘梦微 2026-02-28 5/250 2026-03-01 22:30 by wang_dand
[考研] 26考研报考西工大材料308分求调剂 +3 weizhong123 2026-03-01 3/150 2026-03-01 21:42 by 公瑾逍遥
[考研] 274求调剂 +3 cgyzqwn 2026-03-01 6/300 2026-03-01 21:24 by cgyzqwn
[考研] 0805总分292，求调剂 +7 幻想之殇 2026-03-01 7/350 2026-03-01 21:22 by 公瑾逍遥
[考研] 一志愿中南大学理学化学 +4 15779376950 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:00 by Fff-1
[考博] 26申博 +4 想申博！ 2026-02-26 6/300 2026-03-01 17:32 by 想申博！
[考研] 328求调剂 +3 aaadim 2026-03-01 5/250 2026-03-01 17:29 by njzyff
[考研] 321求调剂一志愿东北林业大学材料与化工英二数二 +4 虫虫虫虫虫7 2026-03-01 7/350 2026-03-01 16:52 by caszguilin
[考研] 0856材料求调剂 +4 麻辣鱿鱼 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:51 by caszguilin
[考研] 285求调剂 +8 满头大汗的学生 2026-02-28 8/400 2026-03-01 16:47 by caszguilin
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 材料284求调剂，一志愿郑州大学英一数二专硕 +10 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:12 by yc258
[考研] 调剂 +3 简木ChuFront 2026-02-28 3/150 2026-03-01 11:46 by 王伟要上岸啊
[考博] 博士自荐 +4 kkluvs 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:19 by 馥安馥安
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[考研] 材料调剂 +4 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 4/200 2026-03-01 00:38 by 猫猫球alter
[考研] 307求调剂 +4 73372112 2026-02-28 6/300 2026-03-01 00:04 by ll247
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭