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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » CPMD/CP2K » cp2k与vasp在分子动力学模拟方面的比较
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bluejh

金虫 (小有名气)

[交流] cp2k与vasp在分子动力学模拟方面的比较

最近在用vasp做abmd的模拟工作，结果很令人郁闷，15x15x15大小的盒子加入80个水左右，计算速度特别慢，基本没法做。每天也就是迭代200步。基本参数设置如下
IBRION = 0
  NSW = 3000
  POTIM = 1
  SMASS = 2
  TEBEG = 298.0
  TEEND = 298.0

# ISIF = 0
  ISYM = 0
  NELMIN=8
  ALGO =normal
  IALGO=38  
  ISPIN = 2
  LWAVE = .FALSE.
  LCHARG = .FALSE.
  ISMEAR = -1
  SIGMA = 0.05
  LREAL= Auto
  NELECT=613

  APACO=10
  NPACO=200
  NBLOCK = 1
  KBLOCK = 50

想请教用过cp2k的大牛们，cp2k处理类似体系是否能快很多？ 实在不行就换软件啦。。。
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1楼 2015-04-14 11:37:08
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bluejh

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2015-04-14 11:55:15
AIMD就是很慢，cp2k是专门做这个的，应该会快一点，但像你这样的体系在16个核的机器上cp2k大概一天也只能跑1-2ps， 一般常规的采样也至少要20-30 ps，所以一般要跑一个月，如果没有足够的计算资源还是放弃吧。

To Isloneil，
请问20-30ps是针对CP2K的么？vasp是否可以用10-20ps？从原理上来说vasp是基于BOMD，弛豫过程中似乎结果更接近于基态！
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6楼2015-04-15 18:41:13
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)
★ ★
bluejh(金币+1): 谢谢参与
abinitio: 金币+1, 鼓励交流 2015-04-15 07:33:20
AIMD就是很慢，cp2k是专门做这个的，应该会快一点，但像你这样的体系在16个核的机器上cp2k大概一天也只能跑1-2ps， 一般常规的采样也至少要20-30 ps，所以一般要跑一个月，如果没有足够的计算资源还是放弃吧。
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2楼2015-04-14 11:55:15
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emilyoyang

木虫 (正式写手)
★ ★
bluejh(金币+1): 谢谢参与
abinitio: 金币+1, 鼓励交流 2015-04-15 07:33:28
加快速度建议如下：
ALGO =normal 改为Fast or very Fast
NELMIN = 6
ISPIN = 1 关掉ISPIN，没必要
SIGMA = 0.05 再该大一点 0.1 or 0.2？（这个需要test）
EDIFF = 1E-4再小点 改为 1E-3
另外， 你的NSW=3000 偏小了。
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3楼2015-04-14 13:54:53
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bluejh

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by emilyoyang at 2015-04-14 13:54:53
加快速度建议如下：
ALGO =normal 改为Fast or very Fast
NELMIN = 6
ISPIN = 1 关掉ISPIN，没必要
SIGMA = 0.05 再该大一点 0.1 or 0.2？（这个需要test）
EDIFF = 1E-4再小点 改为 1E-3
另外， 你的NSW=300 ...

谢谢emilyoang，我的体系设置ALGO=48开始时老报错，所以才使用normal先预优化，后面会改用48. EDIFF = 1E-4改为 1E-3会不会有点小么？ 看文献上似乎都是E-4居多
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5楼2015-04-15 09:14:42
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luzihen

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
为何不用CPMD,做这种体系的话快得多吧
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10楼2015-12-03 19:00:20
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dingweilu

新虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
做类似楼主这样的体系，gromacs是强项，4核8线程的电脑一周就能完成几十个ns

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11楼2017-01-20 13:29:51
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dingweilu

新虫 (著名写手)
cp2k也是基于BOMD的

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12楼2017-01-20 13:31:02
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magicmonk4楼
2015-04-15 09:06   回复  
bluejh(金币+1): 谢谢参与
天涯20127楼
2015-04-18 08:20   回复  
bluejh(金币+1): 谢谢参与
shenrenren8楼
2015-04-18 08:26   回复  
bluejh(金币+1): 谢谢参与
miaojiabing9楼
2015-04-18 08:27   回复  
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