| 查看: 1799 | 回复: 4 | |||
29050801新虫 (小有名气)
|
[求助]
gaussian如何让两个分子逐渐靠近
|
|
在好多文献了看到研究小分子和大分子的包合作用的时候有用到gaussian设置大分子在一定空间结构，小分子通过设置的坐标渐渐靠近并逐步进入大分子内。 在进入的过程中每移动一定距离都会进行分子结构的优化和小分子的旋转。 但是，请问如何设置小分子逐渐靠近大分子呢？ 难道是小分子和大分子之间每一个位置关系，设置一个计算输入文件，在单独设置小分子的旋转二面角尽心能量优化。如果是这样，那么小分子的旋转是以什么为参考标准的呢？ 如果是通过一个输入文件设置的，请问怎么设置的呢？ 看到文献中有提到用dummy atom设置，但是通过redundant coordinate设置dummy atom的时候，gv提示不能设置dummy atom。别的就不知道怎么弄好了。 附上想要设置的分子的几张图片：    [ Last edited by 29050801 on 2014-1-17 at 10:07 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
298分 070300求调剂
已经有15人回复
-
湖南大学张世国团队招26年第二批博士—离子液体、高分子与凝胶材料
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有133人回复
-
中国电机工程学报的投稿系统
已经有0人回复
-
湖南农业大学能源材料创新团队招收2025化学专业研究生（学硕）调剂
已经有0人回复
-
2026年西华大学材料学院-材料近净成形与表面技术研究团队-招收调剂研究生
已经有9人回复
-
调剂信息
已经有0人回复
-
河北农大生物与医药专业招收调剂，名额充足
已经有0人回复
-
齐鲁工业大学 国家重点实验室-新能源、锂离子电池、材料、化学方向
已经有0人回复
-
杰青/长江团队招收调剂
已经有0人回复
-
中南林业科技大学罗勇锋教授团队2026年招收材料类调剂研究生
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- in文件运行失败（lost atoms）求助！！
已经有11人回复
- gaussian可以计算多个分子的红外光谱吗
已经有5人回复
- 如何用gaussian软件计算分子的振动光谱？
已经有8人回复
- 做scan时怎么保持两个原子间键长不变
已经有7人回复
- 静电势为什么有正负值？
已经有102人回复
- 从He2等的量子化学图形解读范德华作用(续二)
已经有25人回复
- 从He2等的量子化学图形解读范德华作用(续)
已经有34人回复
- 从He2等的量子化学图形解读范德华作用
已经有43人回复
- 怎么解释活化能相同的两个反应，同等条件下速率常数却不同？
已经有11人回复
- 关于过渡态和能量优化的问题
已经有7人回复
- Gaussianview中如何画复杂分子
已经有5人回复
- 【求助/交流】怎么鉴别植物细胞是活着还是死了，有任何想法的都请不吝指教，谢谢
已经有13人回复
- 【求助】分子带电荷的确定 GaussianView
已经有13人回复
- 【求助】优化计算后偶极距选择
已经有12人回复
yongleli
木虫 (正式写手)
- 应助: 93 (初中生)
- 金币: 3769.1
- 散金: 369
- 红花: 24
- 帖子: 764
- 在线: 101.3小时
- 虫号: 303595
- 注册: 2006-12-03
- 专业: 原子和分子物理
290508012楼2014-01-17 11:46:40
29050801
新虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1065.5
- 散金: 6
- 红花: 1
- 帖子: 163
- 在线: 78.4小时
- 虫号: 1765116
- 注册: 2012-04-19
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
3楼2014-01-17 12:00:44
beefly
专家顾问 (职业作家)
地沟油冶炼专家
-
专家经验: +458 - QC强帖: 12
- 应助: 88 (初中生)
- 金币: 13045.7
- 散金: 27307
- 红花: 300
- 帖子: 4673
- 在线: 927.1小时
- 虫号: 408372
- 注册: 2007-06-21
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 计算模拟
4楼2014-01-17 21:10:44
29050801
新虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1065.5
- 散金: 6
- 红花: 1
- 帖子: 163
- 在线: 78.4小时
- 虫号: 1765116
- 注册: 2012-04-19
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
5楼2014-01-18 08:25:14
