| 查看: 696 | 回复: 0 | ||
[求助]
关于gaussian PCM溶剂化模型电荷补偿问题
|
|
请教各位大神！ gaussian PCM输出文档中有Charge compensation : None这一部分，可我用QM/MM计算核酸和小分子配体体系，由于核酸分子使得体系不为中性，那我需不需要向分子动力学对体系添加抗衡离子那样对PCM模型里的charge compensation进行设置？如果需要，那该怎么设置呢？ Polarizable Continuum Model (PCM) ================================= Model : PCM. Atomic radii : UFF (Universal Force Field). Polarization charges : Total charges. Charge compensation : None. Solution method : Iterative solution. Cavity type : Scaled VdW (van der Waals Surface) (Alpha=1.100). Cavity algorithm : GePol (No added spheres) Default sphere list used, NSphG= 834. Lebedev-Laikov grids with approx. 5.0 points / Ang**2. Smoothing algorithm: Karplus/York (Gamma=1.0000). Polarization charges: spherical gaussians, with point-specific exponents (IZeta= 3). Self-potential: point-specific (ISelfS= 7). Self-field : sphere-specific E.n sum rule (ISelfD= 2). 1st derivatives : Analytical E(r).r(x)/FMM algorithm (CHGder, D1EAlg=3). Cavity 1st derivative terms included. Solvent : Water, Eps= 78.355300 Eps(inf)= 1.777849 |
回复此楼» 猜你喜欢
华北电力大学（北京）（第一性原理计算）博士招生——学博，专博各1人
已经有45人回复
-
求助各位大佬配位化学学习教材！！！
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有71人回复
-
大连海事大学国家级人才团队2026年博士研究生招生启事
已经有10人回复
-
内蒙古大学青年长江学者王蕾教授课题组2026年博士招聘，2-3人
已经有11人回复
-
多相催化-2026年CSC博士及洪堡合作博士后招生！
已经有0人回复
-
中国地质大学（武汉）—国家级青年人才杨明教授组-招收博士-新能源材料化学及催化材料
已经有32人回复
-
求光催化产过氧化氢的PPT ！！！毕业答辩需要
已经有1人回复
-
湖南大学招收锂离子电池、离子液体、高分子与凝胶材料、电催化方向博士生多名
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
高斯溶剂化能求助
已经有3人回复- PCM计算报错： Using the following non-standard input for PCM
已经有12人回复
- 溶剂化能计算问题
已经有7人回复
- SMD模型做溶剂化效应
已经有14人回复
- 溶剂化效应出现gaussian 9999错误
已经有7人回复
- 关于高斯PCM模型输入问题
已经有16人回复
- 关于gaussian09中BSSE校正
已经有10人回复
- G03中溶剂化模型的选择
已经有9人回复
- Gaussian09 溶剂化发射光谱的例子第3步出错
已经有10人回复
- 关于溶剂化能的问题？SMD，dovacuum，externaliteration，PCM，radii等，谢谢
已经有16人回复
- Gaussian 计算错误
已经有4人回复
- 溶剂化构型优化问题
已经有5人回复
- 参数化建模方法的讨论
已经有20人回复
- 溶剂化效应输入
已经有6人回复
- 加入溶剂化模型后ΔG变化太大
已经有20人回复
- 请问Gauss中溶剂化的计算怎样指定溶剂
已经有7人回复
- 气态结构的溶剂化，还是溶剂模型中优化？
已经有3人回复
- Gaussian 09 中溶剂化的荧光发射
已经有11人回复
- 关于CO2超临界的问题
已经有15人回复
- 【求助】tBuOH作为溶剂，在gaussian中如何输入？
已经有4人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人