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swfctheochem

铜虫 (初入文坛)

[求助] 关于gaussian09中BSSE校正

在论坛上看到以下内容:
要计算A、B两个分子的相互作用能,在Gaussian03中使用counterpoise=2关键字(可简写为counter=2),会计算5个体系,输出的能量按照如下顺序:
E_AB:A、B基组下AB复合物的能量
E_A,bAB:A、B基组下A的能量
E_B,bAB:A、B基组下B的能量
E_A:A基组下A的能量
E_B:B基组下B的能量
最后会输出corrected energy (E_corrected)和BSSE energy (E_BSSE)。E_BSSE是校正能,E_BSSE = (E_A - E_A,bAB) + (E_B - E_B,bAB) ;E_corrected就是消除了因单体基组重叠造成的能量降低后的AB复合物能量,E_corrected = E_AB + E_BSSE。
BSSE校正后的真实的相互作用能可以这样计算:E_interaction = E_corrected - (E_A + E_B)。也可以这样计算,是等价的:E_interaction = E_AB - E_A,bAB - E_B,bAB。
我用gaussian09计算两个分子的相互作用能,输入格式如下
# MP2/6-31+G** Counterpoise=2 Opt
Counterpoise with Cartesian
0,1
分子描述

发现输出结果中只有如下两项:
Counterpoise: corrected energy =    -734.521269484568
Counterpoise: BSSE energy =       0.003653491328
这两项应该就是上面说的corrected energy (E_corrected)和BSSE energy (E_BSSE)。那么前面五项在哪里啊?没有E_A和E_B也算不了最终的相互作用能啊!难道我还要单独计算E_A和E_B吗?按上面的说法应该一次计算就可得到结果啊!哪里出错了?是03和09输出格式的区别吗?另外out文件的最后给出MP2=-385.2025592,这似乎是其中一个分子的总能量,那么另一个分子的能量在哪里?直接用Counterpoise=2 Opt,并没有做频率分析,如果单独算A和B的能量,需要做频率分析考虑零点能吗?第一次计算BSSE,请各位指点!非常感谢!
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xjyuefan

铁杆木虫 (正式写手)

两个体系,那分子坐标是分开写吗?
2楼2013-08-11 11:40:21
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swfctheochem

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xjyuefan at 2013-08-11 11:40:21
两个体系,那分子坐标是分开写吗?

不用分开写啊,每个原子后面有数字描述该原子是属于哪个片段的
3楼2013-08-12 13:33:57
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
swfctheochem: 金币+10, ★★★很有帮助, 很有帮助 2013-08-20 21:20:25
搜索"EUMP2",我不信就给你一个能量。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2013-08-13 00:11:05
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nunup5

木虫 (小有名气)

搜“SCF Done”一共五个结果,就是你说的五个体系!
5楼2013-08-20 09:04:52
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春雨飞飞

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangmt at 2013-08-13 00:11:05
搜索"EUMP2",我不信就给你一个能量。

如果搜 EUMP2 的话,也要搜出五个吗?
知识的世界,没有国界,更没有限制与范围,懂得分享,才是智慧。
6楼2013-08-20 10:17:48
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swfctheochem

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by nunup5 at 2013-08-20 09:04:52
搜“SCF Done”一共五个结果,就是你说的五个体系!

SCF Done是在一起的还是分别计算的,要挨个找吗?我找过,在同一个地方没有5个能量,谢谢指点!
7楼2013-08-20 17:10:05
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swfctheochem

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 春雨飞飞 at 2013-08-20 10:17:48
如果搜 EUMP2 的话,也要搜出五个吗?...

我找到了,EUMP2每轮计算都有有五个,用搜索功能找最后五个就是,原来MP2方法与Hf和DFT的输出结果不同,SCFdone不在一起,而且EUMP2也不在一起,MP2能量应是EUMP2后的,我我用上面说的两种计算相互作用能的方法验证了一下,是一样的。
8楼2013-08-20 21:17:23
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swfctheochem

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangmt at 2013-08-13 00:11:05
搜索"EUMP2",我不信就给你一个能量。

楼主说的对,但没说清楚啊!5个EUMP2不再一起,要挨个找。不过还是谢谢!
9楼2013-08-20 21:21:38
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liyan620

禁虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

10楼2015-04-21 01:16:58
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