24小时热门版块排行榜    

查看: 4570  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

swfctheochem

铜虫 (初入文坛)

[求助] 关于gaussian09中BSSE校正

在论坛上看到以下内容:
要计算A、B两个分子的相互作用能,在Gaussian03中使用counterpoise=2关键字(可简写为counter=2),会计算5个体系,输出的能量按照如下顺序:
E_AB:A、B基组下AB复合物的能量
E_A,bAB:A、B基组下A的能量
E_B,bAB:A、B基组下B的能量
E_A:A基组下A的能量
E_B:B基组下B的能量
最后会输出corrected energy (E_corrected)和BSSE energy (E_BSSE)。E_BSSE是校正能,E_BSSE = (E_A - E_A,bAB) + (E_B - E_B,bAB) ;E_corrected就是消除了因单体基组重叠造成的能量降低后的AB复合物能量,E_corrected = E_AB + E_BSSE。
BSSE校正后的真实的相互作用能可以这样计算:E_interaction = E_corrected - (E_A + E_B)。也可以这样计算,是等价的:E_interaction = E_AB - E_A,bAB - E_B,bAB。
我用gaussian09计算两个分子的相互作用能,输入格式如下
# MP2/6-31+G** Counterpoise=2 Opt
Counterpoise with Cartesian
0,1
分子描述

发现输出结果中只有如下两项:
Counterpoise: corrected energy =    -734.521269484568
Counterpoise: BSSE energy =       0.003653491328
这两项应该就是上面说的corrected energy (E_corrected)和BSSE energy (E_BSSE)。那么前面五项在哪里啊?没有E_A和E_B也算不了最终的相互作用能啊!难道我还要单独计算E_A和E_B吗?按上面的说法应该一次计算就可得到结果啊!哪里出错了?是03和09输出格式的区别吗?另外out文件的最后给出MP2=-385.2025592,这似乎是其中一个分子的总能量,那么另一个分子的能量在哪里?直接用Counterpoise=2 Opt,并没有做频率分析,如果单独算A和B的能量,需要做频率分析考虑零点能吗?第一次计算BSSE,请各位指点!非常感谢!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高斯

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nunup5

木虫 (小有名气)

搜“SCF Done”一共五个结果,就是你说的五个体系!
5楼2013-08-20 09:04:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

xjyuefan

铁杆木虫 (正式写手)

两个体系,那分子坐标是分开写吗?
2楼2013-08-11 11:40:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

swfctheochem

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xjyuefan at 2013-08-11 11:40:21
两个体系,那分子坐标是分开写吗?

不用分开写啊,每个原子后面有数字描述该原子是属于哪个片段的
3楼2013-08-12 13:33:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
swfctheochem: 金币+10, ★★★很有帮助, 很有帮助 2013-08-20 21:20:25
搜索"EUMP2",我不信就给你一个能量。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
4楼2013-08-13 00:11:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 YLHlRHNwYkce 2026-09-02 6/300 2026-09-03 15:23 by T0rGB46095mJ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 YLHlRHNwYkce 2026-09-02 9/450 2026-09-03 15:21 by T0rGB46095mJ
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 rFEsUBKXRll0 2026-09-02 5/250 2026-09-03 15:10 by T0rGB46095mJ
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 9/450 2026-09-03 14:48 by T0rGB46095mJ
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 8/400 2026-09-03 14:48 by T0rGB46095mJ
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 YLHlRHNwYkce 2026-09-02 8/400 2026-09-03 12:03 by T0rGB46095mJ
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +8 gdd2018 2026-08-28 13/650 2026-09-03 06:22 by 羽毛枫f
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 4/200 2026-09-03 03:14 by rM1TE0WVDIIY
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 6/300 2026-09-02 23:59 by rM1TE0WVDIIY
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
信息提示
请填处理意见