| 查看: 3478 | 回复: 7 | ||
bojanchang银虫 (小有名气)
|
[求助]
如何根据miRNA的序列预测其靶基因，有推荐的软件或网址吗 已有1人参与
|
|
实验室根据miRNA表达谱鉴定到几个Noval的miRNA，后面想做这些Noval的靶基因预测，我发现一些靶基因预测的网站数据库都针对已经发现的miRNA，像我这种情况，只知道Noval miRNA的序列，预测其靶基因用哪个数据库比较好啊？ 还请大家指点，分享一下经验，不胜感激！ |
回复此楼» 猜你喜欢
含氟糖皮质激素的外用抗炎利器醋酸氟轻松
已经有0人回复
-
阿莫奈韦（Amenamevir）：解旋酶-引物酶靶向分子的结构特征与合成路径全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有158人回复
-
利瑞鲁单抗：靶向KIR的NK细胞检查点工具抗体，结构基础与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 荧光素酶验证miRNA靶基因
已经有7人回复
- 求助 已知真菌基因组DNA序列如何预测cDNA序列？
已经有6人回复
- 人类Bcl-2的基因序列 和 对应的miRNA怎么选择
已经有3人回复
- miRNA靶基因预测软件都有哪些？哪些好用？
已经有10人回复
- 已知蛋白质38KD，如何获得其全长基因序列？
已经有10人回复
- 验证miRNA对靶基因剪切位点的RLM-RACE的效率问题
已经有13人回复
- 用什么软件可以讲基因序列和氨基酸序列上下对应排列，就像文献中的那种
已经有8人回复
- miRNA的靶基因怎么预测啊？
已经有9人回复
- 请问miRNA靶基因验证时怎么突变靶基因的3‘UTR结合位点
已经有11人回复
- 一段序列（不是基因，是非编码RNA）怎么知道都有哪些miRNA可能作用于他呢？
已经有4人回复
- 复杂疾病关联的miRNA-mRNA功能模块识别的信息融合方法研究
已经有8人回复
- miRNA双荧光报告基因实验筛选靶基因及细胞功能学研究资料---miR21文献
已经有106人回复
xingzhou823
木虫 (正式写手)
五道杠
- 应助: 24 (小学生)
- 金币: 2391.6
- 散金: 200
- 红花: 7
- 帖子: 789
- 在线: 170.7小时
- 虫号: 2070126
- 注册: 2012-10-18
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
【答案】应助回帖
★
感谢参与，应助指数 +1
bojanchang(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-03-23 19:34:44
感谢参与，应助指数 +1
bojanchang(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-03-23 19:34:44
|
常用的英文数据库有 TargetScan、miRanda、MirTarget2、PicTar、PITA等。 另外，新手的话可以使用中文的web-service，简单实用，上手快捷。例如“云生信”http://www.biocloudservice.com。 |
2楼2015-03-20 13:10:03
bojanchang
银虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 490.6
- 帖子: 109
- 在线: 69.6小时
- 虫号: 2403518
- 注册: 2013-04-06
- 性别: GG
- 专业: 食品科学基础
3楼2015-03-23 09:09:13
xingzhou823
木虫 (正式写手)
五道杠
- 应助: 24 (小学生)
- 金币: 2391.6
- 散金: 200
- 红花: 7
- 帖子: 789
- 在线: 170.7小时
- 虫号: 2070126
- 注册: 2012-10-18
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
4楼2015-03-23 13:16:27
bojanchang
银虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 490.6
- 帖子: 109
- 在线: 69.6小时
- 虫号: 2403518
- 注册: 2013-04-06
- 性别: GG
- 专业: 食品科学基础
5楼2015-03-24 16:33:03
christina89
新虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 391
- 散金: 30
- 帖子: 45
- 在线: 29.2小时
- 虫号: 3805821
- 注册: 2015-04-13
- 性别: MM
- 专业: 生物物理、生物化学与分子
6楼2015-09-24 09:42:27
| 请问您有相关的本地预测软件没有，我刚进行高通量测序，也有想做的候选基因，但是没有相关的本地预测软件安装包，请问您能不能发我一下（邮箱：liuhongzhu2017@outlook.com）,感激不尽！ |
7楼2018-08-29 22:48:13
8楼2018-10-18 09:35:36
50