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sam-lifei

金虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质的GO分析 已有1人参与

求教各位虫友，知道了多个蛋白序列，怎样将他的功能分类绘制成饼状图。或是其他统计图形。谢谢万能的虫友？
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1楼 2015-02-10 16:50:01
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haze12344

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sam-lifei: 金币+5, ★有帮助 2015-02-11 12:35:11
你可以将蛋白的功能查出来，然后按照功能绘制一个饼图就可以了
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生物你好
2楼2015-02-11 11:51:07
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sam-lifei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by haze12344 at 2015-02-11 11:51:07
你可以将蛋白的功能查出来，然后按照功能绘制一个饼图就可以了

谢谢，不过看他们的图好像不是自己化出来的，而且他貌似把功能归类了。不是每一个功能都体现。感觉像网站上的一个画图方法
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3楼2015-02-11 12:39:06
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haze12344

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by sam-lifei at 2015-02-11 12:39:06
谢谢，不过看他们的图好像不是自己化出来的，而且他貌似把功能归类了。不是每一个功能都体现。感觉像网站上的一个画图方法...

你上DAVID上就有蛋白质功能的GO分类可查的，用uniprot的号就可以
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生物你好
4楼2015-02-12 07:54:38
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1570583814

新虫 (初入文坛)
您好，请问您知道这个功能分类具体怎么做了吗，我的已经做了GO分析，功能分类是我自己进行判断分类吗
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5楼2016-03-18 16:29:59
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sam-lifei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 1570583814 at 2016-03-18 16:29:59
您好，请问您知道这个功能分类具体怎么做了吗，我的已经做了GO分析，功能分类是我自己进行判断分类吗

这个好像是和不同种类的有关，我找到一个网站http://weizhong-lab.ucsd.edu/metagenomic-analysis/server/cog/，做了一个COG分类，你把你的序列提交上去就可以进行分类了。他会寄回给你一个excel文件，文件里有各种分类的归类。我查询网上说好像COG和GO是对不同物种有偏向的，GO对人类的分析比较好，COG我做的微生物蛋白分类。不一定对，你暂做参考。GO分析我只是做了蛋白的功能预测，没有通过他分类。
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6楼2016-03-19 08:43:00
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1570583814

新虫 (初入文坛)
谢谢啦，不过这个是需要提交蛋白序列吧，而不是ID号

发自小木虫IOS客户端
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7楼2016-03-19 12:36:46
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