24小时热门版块排行榜    

查看: 1025  |  回复: 3

欧阳平平

木虫 (正式写手)

[求助] 小体系水分子MD计算参数怎样设置合适 已有1人参与

各位前辈,想问一下我的体系比较小,50个原子左右,只在金属表面放了一个水分子,想看一下这个水分子平衡时会在什么位置。请问,这种情况的POTIM,SMASS怎么设置比较好?之前用POTIM=1,SMASS=0.05计算的1000步都没有收敛,是什么原因呢?亟待各位前辈回答,感激不尽~~~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

有付出总会有回报。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

infrared123

铁杆木虫 (著名写手)

To be excellent

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
欧阳平平: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-02-04 04:59:13
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流!祝您假期愉快! 2015-02-05 15:55:40
只在金属表面放了一个水分子,看水分子平衡时会在什么位置,步长要小些,H才不会被离散。
WHY NOT 结构优化呢?
不要怕,不要悔
2楼2015-02-03 07:50:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

欧阳平平

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by infrared123 at 2015-02-03 07:50:57
只在金属表面放了一个水分子,看水分子平衡时会在什么位置,步长要小些,H才不会被离散。
WHY NOT 结构优化呢?

我将水分子放在不同的位置做了结构优化,得到的结果都不一样,所以不知道水分子在哪个位置符合实际,就想做一下MD,但是貌似结果也不理想,总是找不到平衡状态。
有付出总会有回报。
3楼2015-02-04 04:56:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)


ljw4010: 金币+1, 谢谢交流!祝您假期愉快! 2015-02-05 15:55:58
都是十多年前的老问题了......
参见下面的链接
http://journals.aps.org/prl/abst ... ysRevLett.90.216102
4楼2015-02-05 13:14:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 欧阳平平 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 帮忙看看fileCode +6 wwncly 2026-08-10 12/600 2026-08-11 13:01 by wwncly
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +5 布布和一二 2026-08-10 6/300 2026-08-11 10:15 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +9 documentary 2026-08-10 9/450 2026-08-11 10:08 by wk7465
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +15 Lanmanbaby 2026-08-09 23/1150 2026-08-11 09:51 by demonstreets
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +10 yufeiwaner 2026-08-09 11/550 2026-08-10 18:47 by yufeiwaner
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
信息提示
请填处理意见