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欧阳平平

木虫 (正式写手)

[求助] 小体系水分子MD计算参数怎样设置合适 已有1人参与

各位前辈,想问一下我的体系比较小,50个原子左右,只在金属表面放了一个水分子,想看一下这个水分子平衡时会在什么位置。请问,这种情况的POTIM,SMASS怎么设置比较好?之前用POTIM=1,SMASS=0.05计算的1000步都没有收敛,是什么原因呢?亟待各位前辈回答,感激不尽~~~
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有付出总会有回报。
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infrared123

铁杆木虫 (著名写手)

To be excellent

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
欧阳平平: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-02-04 04:59:13
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流!祝您假期愉快! 2015-02-05 15:55:40
只在金属表面放了一个水分子,看水分子平衡时会在什么位置,步长要小些,H才不会被离散。
WHY NOT 结构优化呢?
不要怕,不要悔
2楼2015-02-03 07:50:57
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欧阳平平

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by infrared123 at 2015-02-03 07:50:57
只在金属表面放了一个水分子,看水分子平衡时会在什么位置,步长要小些,H才不会被离散。
WHY NOT 结构优化呢?

我将水分子放在不同的位置做了结构优化,得到的结果都不一样,所以不知道水分子在哪个位置符合实际,就想做一下MD,但是貌似结果也不理想,总是找不到平衡状态。
有付出总会有回报。
3楼2015-02-04 04:56:08
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hakuna

木虫 (知名作家)


ljw4010: 金币+1, 谢谢交流!祝您假期愉快! 2015-02-05 15:55:58
都是十多年前的老问题了......
参见下面的链接
http://journals.aps.org/prl/abst ... ysRevLett.90.216102
4楼2015-02-05 13:14:25
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