24小时热门版块排行榜    

查看: 1174  |  回复: 7

dengglangua

铁虫 (初入文坛)

[求助] MD模拟中,在水盒子中加入其他粒子后,为什么要去掉与之重叠的水分子? 已有1人参与

在分子动力学模拟中,在水盒子中加入其他粒子,比如200个钠离子后,为什么要去掉与钠离子重叠的水分子,不去掉有什么影响?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果原子距离太近,体系能量急剧增大,可能导致体系崩溃
gromacs
2楼2014-11-06 15:44:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Kiki.Hugh

金虫 (初入文坛)

楼主,请教你一下,怎么往里加离子啊,我各种失败
3楼2014-11-06 17:05:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dengglangua

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Kiki.Hugh at 2014-11-06 17:05:15
楼主,请教你一下,怎么往里加离子啊,我各种失败

VMD里有离子的,我是直接加入的,在住窗口的extensions-Modeling-Addions里面。
4楼2014-11-07 09:08:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dengglangua

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fangsteel at 2014-11-06 15:44:13
如果原子距离太近,体系能量急剧增大,可能导致体系崩溃

谢谢你的应助。
5楼2014-11-07 09:18:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Kiki.Hugh

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dengglangua at 2014-11-07 09:08:47
VMD里有离子的,我是直接加入的,在住窗口的extensions-Modeling-Addions里面。...

请问,是将VMD的离子导入的意思吗?
6楼2014-11-07 10:49:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kakaxicheng

新虫 (初入文坛)

你好  请问下,串行和并行 还有Win32 , Win 64.这四个安装版本有什么区别  ,求解  谢谢
7楼2014-11-07 11:23:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kakaxicheng

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fangsteel at 2014-11-06 15:44:13
如果原子距离太近,体系能量急剧增大,可能导致体系崩溃

你好  请问下,lammps 串行和并行 还有Win32 , Win 64.这四个安装版本有什么区别  ,求解  谢谢
8楼2014-11-07 11:25:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dengglangua 的主题更新
信息提示
请填处理意见