24小时热门版块排行榜    

查看: 1411  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

dengglangua

铁虫 (初入文坛)

[求助] MD模拟中,在水盒子中加入其他粒子后,为什么要去掉与之重叠的水分子? 已有1人参与

在分子动力学模拟中,在水盒子中加入其他粒子,比如200个钠离子后,为什么要去掉与钠离子重叠的水分子,不去掉有什么影响?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Kiki.Hugh

金虫 (初入文坛)

楼主,请教你一下,怎么往里加离子啊,我各种失败
3楼2014-11-06 17:05:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果原子距离太近,体系能量急剧增大,可能导致体系崩溃
gromacs
2楼2014-11-06 15:44:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dengglangua

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Kiki.Hugh at 2014-11-06 17:05:15
楼主,请教你一下,怎么往里加离子啊,我各种失败

VMD里有离子的,我是直接加入的,在住窗口的extensions-Modeling-Addions里面。
4楼2014-11-07 09:08:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dengglangua

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fangsteel at 2014-11-06 15:44:13
如果原子距离太近,体系能量急剧增大,可能导致体系崩溃

谢谢你的应助。
5楼2014-11-07 09:18:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 11:51 by xiangy672
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 面上意见出来了 +10 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 19/950 2026-08-31 08:01 by blueearth171
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见