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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » ms中amorphous cell的设置问题,及其reaxff
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紫薇愿

木虫 (正式写手)

[求助] ms中amorphous cell的设置问题,及其reaxff 已有1人参与

用ms弄个RDX的box，在amorphous cell中，如下图标记的设置是什么意思，这个密度设定好了下面的晶胞参数也就确定了？
再用reaxff模拟，与模拟时的参数设置a,b,c一样的吗？

ms中amorphous cell的设置问题,及其reaxff
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1楼 2015-01-26 20:32:00
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congtaiupc

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 应助指数+1 2015-01-27 21:46:59
紫薇愿(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流 2015-01-27 21:47:02
引用回帖:
4楼: Originally posted by 紫薇愿 at 2015-01-27 12:16:41
改变密度，a,b,c值就会跟着改变。是不是输入密度，那么a,b,c值就不再需要自己再修改了？
...

a、b、c值就是盒子的尺寸，对吧，我们想得到的是合适的盒子（也就是我们想要的a、b、c值），这时我们就可以调动密度来实现。密度并不是固定不变的。
举个简单的例子：构建了一个水盒子，里面的水分子数是一定的，但是我们人为地调动a、b、c值（也就是改变了盒子的体积），那么密度还是0.997吗？肯定不是了。密度和a、b、c都可以调，不是局限的。
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用青春书写青春
5楼2015-01-27 15:45:25
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congtaiupc

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
紫薇愿(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流 2015-01-27 21:46:41
紫薇愿: 金币+3 2015-03-12 21:24:30
你图中红圈的意思是最终构型的密度。下面的a、b、c是构建的盒子的尺寸，可以使c固定，Specify a和b来得到你想要的结果。
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用青春书写青春
2楼2015-01-27 10:58:18
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紫薇愿

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by congtaiupc at 2015-01-27 10:58:18
你图中红圈的意思是最终构型的密度。下面的a、b、c是构建的盒子的尺寸，可以使c固定，Specify a和b来得到你想要的结果。

好的，谢谢你了，本人刚接触

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2015-01-27 12:13:59
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紫薇愿

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by congtaiupc at 2015-01-27 10:58:18
你图中红圈的意思是最终构型的密度。下面的a、b、c是构建的盒子的尺寸，可以使c固定，Specify a和b来得到你想要的结果。

改变密度，a,b,c值就会跟着改变。是不是输入密度，那么a,b,c值就不再需要自己再修改了？

[ 发自小木虫客户端 ]
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4楼2015-01-27 12:16:41
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