24小时热门版块排行榜    

查看: 1957  |  回复: 7

xwu10

铜虫 (小有名气)

[求助] SIESTA 计算石墨烯,模型增大体系不收敛已有1人参与

各位好

我在用SIESTA进行石墨烯的简单计算时,遇到了一个问题。我用MS进行石墨烯体系的建模,当石墨烯体系较小时(小于30个原子),SIESTA计算可以很好地收敛;然而当我增大石墨烯体系时(其他参数不变),去发现体系始终无法收敛,这个时候不管我修改何种参数,体系都无法收敛。我想问的是,SIESTA针对大体系计算难道就会出现收敛性问题吗?这是软件本身的bug还是什么其他原因?各位是否有可靠建议?(我试过修改MixingWeight和NumberPulay参数,以及Kgrid,结果依旧不能收敛)

两种体系的fdf文件如下,也供初学者学习参考
#graphene-small supercell
SystemName          graphene
SystemLabel         graphene

NumberOfAtoms          30
NumberOfSpecies        1

%block ChemicalSpeciesLabel
  1   6  C
%endblock ChemicalSpeciesLabel


%block PAO.Basis                 # Define Basis set
C           2                    # Species label, number of l-shells
n=2   0   1                         # n, l, Nzeta
   4.088   
   1.000   
n=2   1   1                       # n, l, Nzeta, Polarization, NzetaPol
   4.870      
   1.000      
%endblock PAO.Basis

XC.functional GGA

LatticeConstant     1.0 Ang
%block LatticeVectors
   20.00000000        0.0000000000        0.0000000000
   0.000000000        15.0000000000        0.0000000000
   0.000000000        0.0000000000       20.0000000000
%endblock LatticeVectors

AtomicCoordinatesFormat Ang
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
1.7 2.13 1.23 1
1.7 2.841 0 1
1.7 4.261 0 1
1.7 4.971 1.23 1
1.7 6.391 1.23 1
1.7 7.101 0 1
1.7 8.522 0 1
1.7 9.232 1.23 1
1.7 10.652 1.23 1
1.7 11.362 0 1
1.7 2.13 3.69 1
1.7 2.841 2.46 1
1.7 4.261 2.46 1
1.7 4.971 3.69 1
1.7 6.391 3.69 1
1.7 7.101 2.46 1
1.7 8.522 2.46 1
1.7 9.232 3.69 1
1.7 10.652 3.69 1
1.7 11.362 2.46 1
1.7 2.13 6.15 1
1.7 2.841 4.92 1
1.7 4.261 4.92 1
1.7 4.971 6.15 1
1.7 6.391 6.15 1
1.7 7.101 4.92 1
1.7 8.522 4.92 1
1.7 9.232 6.15 1
1.7 10.652 6.15 1
1.7 11.362 4.92 1
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies

%block kgrid_Monkhorst_Pack
   1   0   0  0.0
   0   10   0  0.0
   0   0  10  0.5
%endblock Kgrid_Monkhorst_Pack

MeshCutoff         500.0 Ry

MaxSCFIterations     1000
DM.MixingWeight      0.05
DM.NumberPulay       10
DM.Tolerance         0.0001

WriteCoorXmol .true.

BandLinesScale ReciprocalLatticeVectors

%block BandLines
1   0.0 0.0 0.0 \Gamma
100 0.0 0.0 0.5 X
%endblock BandLines

SolutionMethod       diagon
TS.WriteHS  .true.

#graphene-large supercell
SystemName          graphene
SystemLabel         graphene

NumberOfAtoms          50
NumberOfSpecies        1

%block ChemicalSpeciesLabel
  1   6  C
%endblock ChemicalSpeciesLabel


%block PAO.Basis                 # Define Basis set
C           2                    # Species label, number of l-shells
n=2   0   1                         # n, l, Nzeta
   4.088   
   1.000   
n=2   1   1                       # n, l, Nzeta, Polarization, NzetaPol
   4.870      
   1.000      
%endblock PAO.Basis

XC.functional GGA
XC.authors    PBE

LatticeConstant     1.0 Ang
%block LatticeVectors
   20.00000000        0.0000000000        0.0000000000
   0.000000000        15.0000000000        0.0000000000
   0.000000000        0.0000000000       20
%endblock LatticeVectors

AtomicCoordinatesFormat Ang
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
1.7 2.13 1.23 1
1.7 2.841 0 1
1.7 4.261 0 1
1.7 4.971 1.23 1
1.7 6.391 1.23 1
1.7 7.101 0 1
1.7 8.522 0 1
1.7 9.232 1.23 1
1.7 10.652 1.23 1
1.7 11.362 0 1
1.7 2.13 3.69 1
1.7 2.841 2.46 1
1.7 4.261 2.46 1
1.7 4.971 3.69 1
1.7 6.391 3.69 1
1.7 7.101 2.46 1
1.7 8.522 2.46 1
1.7 9.232 3.69 1
1.7 10.652 3.69 1
1.7 11.362 2.46 1
1.7 2.13 6.15 1
1.7 2.841 4.92 1
1.7 4.261 4.92 1
1.7 4.971 6.15 1
1.7 6.391 6.15 1
1.7 7.101 4.92 1
1.7 8.522 4.92 1
1.7 9.232 6.15 1
1.7 10.652 6.15 1
1.7 11.362 4.92 1
1.7 2.13 8.61 1
1.7 2.841 7.38 1
1.7 4.261 7.38 1
1.7 4.971 8.61 1
1.7 6.391 8.61 1
1.7 7.101 7.38 1
1.7 8.522 7.38 1
1.7 9.232 8.61 1
1.7 10.652 8.61 1
1.7 11.362 7.38 1
1.7 2.13 11.07 1
1.7 2.841 9.84 1
1.7 4.261 9.84 1
1.7 4.971 11.07 1
1.7 6.391 11.07 1
1.7 7.101 9.84 1
1.7 8.522 9.84 1
1.7 9.232 11.07 1
1.7 10.652 11.07 1
1.7 11.362 9.84 1
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies

%block kgrid_Monkhorst_Pack
   1   0   0  0.0
   0   10   0  0.0
   0   0  10  0.5
%endblock Kgrid_Monkhorst_Pack

MeshCutoff         500.0 Ry

MaxSCFIterations     1000
DM.MixingWeight      0.1
DM.NumberPulay       10
DM.Tolerance         0.0001

WriteCoorXmol .true.

BandLinesScale ReciprocalLatticeVectors

%block BandLines
1   0.0 0.0 0.0 \Gamma
100 0.0 0.0 0.5 X
%endblock BandLines

SolutionMethod       diagon
TS.WriteHS  .true.
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xwu10

铜虫 (小有名气)

锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流! 2015-01-30 21:47:09

zhangguangping

木虫 (著名写手)

zhangguangping

木虫 (著名写手)

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

xwu10

铜虫 (小有名气)

chengxiajie

新虫 (初入文坛)

相关版块跳转 我要订阅楼主 xwu10 的主题更新
信息提示
请填处理意见