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清风凌云007

金虫 (小有名气)

[求助] 用G09优化激发态及荧光光谱计算 已有1人参与

我要算一个体系的荧光光谱,看了好多小木虫的帖子越看越糊涂了,还看了G09的英文说明,在SCRF这有说明(http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_scrf.htm),我只算气态的,总结了下是不是需要step1、2、4、5、6?step7是否需要计算?希望计算高手们、前辈们给指点迷津,我这样算到底对不对,如果不对应该怎么算呢,现在真是非常着急,都不想放假了,先在此谢过各位大神!!我的计算步骤如下(现在在进行第三步),
1、# opt freq b3lyp/6-31g(d)             基态分子结构优化及频率计算
2、# td(nstates=20) b3lyp/6-31g(d)           吸收光谱计算
3、# opt td(nstates=20,root=1,direct) b3lyp/6-31g(d)            单重态第一激发态优化(优化基础应该用优化基态结果还是吸收光谱计算结果?????)
4、# freq td(nstates=20,root=1,direct) b3lyp/6-31g(d)           单重态第一激发态优化结构频率计算
5、# td(nstates=20) b3lyp/6-31g(d)            单重态第一激发态发射
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小范范1989

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
清风凌云007: 金币+50, ★★★很有帮助, 希望大神继续指导我的回帖,多谢呀 2015-01-24 14:00:50
手册上的例子还有我们在论坛里讨论的都是在溶剂中的,需要考虑溶剂的平衡化和非平衡化的作用,
还有在TDDFT和DFT过程中,溶剂的作用。所以需要1-7,确切的说是1.3.4.5.6.7这几部。
如果说,你只计算在空气中的发射谱,那么这个很简单,下面的步骤
1:# opt freq b3lyp/6-31g(d)             基态分子结构优化及频率计算
2:# opt td(nstates=20,root=1,direct) b3lyp/6-31g(d)            单重态第一激发态优化(优化基础应该用优化基态结果还是吸收光谱计算结果?????
ps:针对你的问题,是这样的,这是激发态的优化,如果说计算发射,我们要看从s1-s0的发射,基于s0
优化的结构优化s1

在进行完上述步骤之后,在优化s1的输出文件中,会有如下的数据:
Excitation energies and oscillator strengths:

Excited State   1:      Singlet-A      1.7417 eV  711.84 nm  f=0.0001  <S**2>=0.000
     167 ->168        -0.70045
This state for optimization and/or second-order correction.
Total Energy, E(TD-HF/TD-KS) =  -2006.02553586   
Copying the excited state density for this state as the 1-particle RhoCI density.

Excited State   2:      Singlet-A      2.5732 eV  481.82 nm  f=0.1422  <S**2>=0.000
     167 ->169        -0.69630

Excited State   3:      Singlet-A      2.5993 eV  476.99 nm  f=0.0028  <S**2>=0.000
     165 ->168         0.44525
     166 ->168         0.52944
默认的是3个,因为默认的nstates=3.看第一个td的波长就是发射的荧光的波长

ps:很多人,还在优化了s1的结构后,又做了一个td,其实没有必要,当然你以可以进行,计算出来的结果,和我们优化s1出来的结构的第一td是一样的。

综上所述,计算空气中的荧光,只需要2步,优化s0,基于s0优化s1,然后从s1输出文件找第一个td波长。
over

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
6楼2015-01-24 10:53:34
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小范范1989

木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 清风凌云007 at 2015-01-24 13:49:13
多谢大神指教,我看了两个帖子,还是有一点不明白,就是怎么做发射光谱图呢,要是作图是要在优化激发态基础上做TD 吗?也就是我的最后一步
5、# td(nstates=20) b3lyp/6-31g(d)            单重态第一激发态发射
...

按照我们这个计算方式,计算的只是一个波长,
如果说非要做出谱线,那么就采用下面的步骤:
1:那你计算td的文件的输出文件.log或者是.out,放到高斯view中,
点击results,然后选择UV-VIS,会看到一个图像,如下图一,但是这个图像时我们计算td时候全部的,我们要看的是第一个td对应的发射。所以这个图像不是。
2:在图像的中,在x轴上,找到我们输出文件第一个td对应的波长,假如说是350nm。就在350nm处,右键。--save data-(可以设置开始,结束,还有间隔范围)---保存数据后,使用origin作图。如图二
3:图3才是我们的荧光光谱。
用G09优化激发态及荧光光谱计算
3.png


用G09优化激发态及荧光光谱计算-1
1.png


用G09优化激发态及荧光光谱计算-2
2.jpg

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12楼2015-01-24 16:00:26
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普通回帖

清风凌云007

金虫 (小有名气)

怎么没人回复呢 呜呜  各位高手请进贴回复吧 非常感谢
2楼2015-01-23 19:33:53
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清风凌云007

金虫 (小有名气)

哎呀呀呀
3楼2015-01-23 19:56:52
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)

你的步骤没错

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2015-01-24 05:32:20
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小范范1989

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
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5楼2015-01-24 10:36:34
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清风凌云007

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-01-24 10:53:34
手册上的例子还有我们在论坛里讨论的都是在溶剂中的,需要考虑溶剂的平衡化和非平衡化的作用,
还有在TDDFT和DFT过程中,溶剂的作用。所以需要1-7,确切的说是1.3.4.5.6.7这几部。
如果说,你只计算在空气中的发射 ...

多谢大神指教,我看了两个帖子,还是有一点不明白,就是怎么做发射光谱图呢,要是作图是要在优化激发态基础上做TD 吗?也就是我的最后一步
5、# td(nstates=20) b3lyp/6-31g(d)            单重态第一激发态发射

还有就是画图要用chk文件吗?只有out或log文件应该怎么画图呢?在我的输入文件(如下)中输入%chk=2.gif.chk就是生成了chk文件吧,但是我打不开,看了好多论坛上的帖子有的说要转化成fchk,但是我按照说的转化不了
%chk=2.chk
%mem=100MW
%nproc=1
# opt b3lyp/6-31+g
7楼2015-01-24 13:49:13
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清风凌云007

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by Jasminer at 2015-01-24 05:32:20
你的步骤没错

多谢多谢
8楼2015-01-24 13:50:01
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 清风凌云007 at 2015-01-24 13:49:13
多谢大神指教,我看了两个帖子,还是有一点不明白,就是怎么做发射光谱图呢,要是作图是要在优化激发态基础上做TD 吗?也就是我的最后一步
5、# td(nstates=20) b3lyp/6-31g(d)            单重态第一激发态发射
...

作图不需chk,任一能作展宽的软件都可以,比如说GV。

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2015-01-24 14:21:47
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清风凌云007

金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by Jasminer at 2015-01-24 14:21:47
作图不需chk,任一能作展宽的软件都可以,比如说GV。
...

就是说在GaussView中打开out或log文件,在results中选哪个选项呢?
图片是我算了TD吸收后点UV-VIS后出现的图,别的就不会了
用G09优化激发态及荧光光谱计算-3
360截图20150124144958116.jpg

10楼2015-01-24 14:52:13
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