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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 求问如何计算质子化分子的吸收荧光光谱
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)

[求助] 求问如何计算质子化分子的吸收荧光光谱

该分子质子化后带两个单位正电荷，采用B3LYP/6-31G**泛函，TDDFT方法计算吸收发射光谱。计算的吸收最大峰在575nm, 而实验值为341nm. 请教大家该方法有什么问题，这样的分子该采用什么方法来算？谢谢！
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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!
1楼 2013-10-09 15:11:44
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
bingdieduwu: 金币+5, ★★★很有帮助, 感谢应助 2013-10-09 19:48:31
gkf高: 金币+2 2013-10-09 20:49:06
ben_ladeng: 专家考核 2013-10-09 23:07:43
bingdieduwu: 金币+3, ★★★很有帮助, 感谢回复 2013-10-11 09:35:21
这么大的差别不是算法的问题.
应该是你没有找对结构,也就是说结构不对.
由于结构决定性质,因此算出来光谱不对.
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
2楼2013-10-09 18:51:14
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fubest

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
bingdieduwu: 金币+3, ★有帮助, 感谢应助 2013-10-09 19:48:58
明显算出来的结构不对
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3楼2013-10-09 19:10:45
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hairan at 2013-10-09 18:51:14
这么大的差别不是算法的问题.
应该是你没有找对结构,也就是说结构不对.
由于结构决定性质,因此算出来光谱不对.

感谢应助，请问该如何找结构呢？我算的分子是正常结束的，而且是基态构型，频率分析倒是还没有做，但是这个结果跟实验上差的实在是太大了。
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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!
4楼2013-10-09 19:56:08
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

ben_ladeng: 专家考核 2013-10-09 23:07:54
引用回帖:
4楼: Originally posted by bingdieduwu at 2013-10-09 19:56:08
感谢应助，请问该如何找结构呢？我算的分子是正常结束的，而且是基态构型，频率分析倒是还没有做，但是这个结果跟实验上差的实在是太大了。...

是否质子化以及质子化的位置都会极大的影响特征峰的位置。
另外，如果分子的柔性比较大，形成分子内氢键等也会产生比较大的影响。
有时也要考虑质子化的形式，比如是上一个质子还是上一个质子化的水，也就是CH3(+)。
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
5楼2013-10-09 21:15:01
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
引用回帖:
5楼: Originally posted by hairan at 2013-10-09 21:15:01
是否质子化以及质子化的位置都会极大的影响特征峰的位置。
另外，如果分子的柔性比较大，形成分子内氢键等也会产生比较大的影响。
有时也要考虑质子化的形式，比如是上一个质子还是上一个质子化的水，也就是CH3( ...

是OH3(+)，不是CH3(+)，敲错了
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
6楼2013-10-09 21:27:07
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asym

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-10-10 22:03:29
bingdieduwu: 金币+3, ★有帮助, 感谢应助 2013-10-11 09:37:14
虽然不懂量子化学，但是从有机结构上来说，是不是要看你的结构的异构化？比如羰基的烯醇式和酮式，毕竟从结构上来看是两种化合物。你的化合物质子化后存在有几种个可能的结构？是否有变化应该考量。
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7楼2013-10-10 21:01:28
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virtualzx

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
bingdieduwu: 金币+3, ★有帮助, 感谢回复 2013-10-11 09:38:05
激发态是电子转移态么？tddft算电子转移态经常得定性错误的结果
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8楼2013-10-11 07:38:45
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hairan at 2013-10-09 21:15:01
是否质子化以及质子化的位置都会极大的影响特征峰的位置。
另外，如果分子的柔性比较大，形成分子内氢键等也会产生比较大的影响。
有时也要考虑质子化的形式，比如是上一个质子还是上一个质子化的水，也就是CH3( ...

谢谢您，质子化的位置和质子化的形式都已经确定，但是分子确实柔性比较大，怎么找到该分子的最优构型呢？
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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!
9楼2013-10-11 09:36:51
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by asym at 2013-10-10 21:01:28
虽然不懂量子化学，但是从有机结构上来说，是不是要看你的结构的异构化？比如羰基的烯醇式和酮式，毕竟从结构上来看是两种化合物。你的化合物质子化后存在有几种个可能的结构？是否有变化应该考量。

这个分子质子化后的结构是确定的，感谢回复
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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!
10楼2013-10-11 09:37:51
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