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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 如何将细菌全基因组序列翻译成蛋白
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maoxixi

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何将细菌全基因组序列翻译成蛋白 已有3人参与

如何将全基因组的dna序列翻译成蛋白，或者有哪个网站的翻译结果可信度较高？
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1楼 2015-01-22 22:40:06
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zshw_001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
全基因组都翻译了干嘛用，引物设计软件就可以把密码子翻译成氨基酸，不过不区分终止吧。
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永远相信未知的总是美好的！
4楼2015-01-23 17:57:51
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
将DNA翻译成蛋白质比较简单，很多软件都可以实现，一个密码子对应一个氨基酸，一般情况不会有错，只是翻译出来的结果没有什么用。细菌基因组里有很多区域本来就不是用来翻译蛋白的，全基因组翻译可能会造成移码，中途碰到终止子也很普遍，得到的蛋白根本没有用。如果你要找某个细菌的某种蛋白，而有没有参考序列，建议你使用blastX。
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2楼2015-01-23 09:17:49
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
输入你的序列到 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome 对话框中，点BLAST
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3楼2015-01-23 13:57:52
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