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maoxixi

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何将细菌全基因组序列翻译成蛋白 已有3人参与

如何将全基因组的dna序列翻译成蛋白,或者有哪个网站的翻译结果可信度较高?
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zshw_001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
全基因组都翻译了干嘛用,引物设计软件就可以把密码子翻译成氨基酸,不过不区分终止吧。
永远相信未知的总是美好的!
4楼2015-01-23 17:57:51
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
将DNA翻译成蛋白质比较简单,很多软件都可以实现,一个密码子对应一个氨基酸,一般情况不会有错,只是翻译出来的结果没有什么用。细菌基因组里有很多区域本来就不是用来翻译蛋白的,全基因组翻译可能会造成移码,中途碰到终止子也很普遍,得到的蛋白根本没有用。如果你要找某个细菌的某种蛋白,而有没有参考序列,建议你使用blastX。
2楼2015-01-23 09:17:49
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
输入你的序列到 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome 对话框中,点BLAST
3楼2015-01-23 13:57:52
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