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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 请教：vasp计算bader电荷，电子步已经收敛，却无法正常结束！无法产生CHGCAR！！
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行侠仗义

铁虫 (正式写手)

[求助] 请教：vasp计算bader电荷，电子步已经收敛，却无法正常结束！无法产生CHGCAR！！ 已有2人参与

OUTCAR里面已经提示：

------------------------ aborting loop because EDIFF is reached ----------------------------------------

但是却无法产生CHGCAR, out文件里面有提示：

Job  /lsfhome/Soft/lsf/8.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/openmpi_wrapper /home-gg/users/nscc609_SZJ/bin/vasp-5.2.12

TID   HOST_NAME   COMMAND_LINE            STATUS            TERMINATION_TIME
===== ========== ================  =======================  ===================
00000 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:28
00001 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00002 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00003 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00004 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00005 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:28
00006 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00007 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00008 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00009 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00010 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00011 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00012 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:23
00013 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00014 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00015 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00016 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00017 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:23
00018 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:24
00019 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00020 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00021 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:24
00022 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00023 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00024 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00025 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00026 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:10
00027 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:09
00028 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00029 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00030 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00031 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00032 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00033 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:10
00034 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00035 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:10

--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 1 with PID 22309 on
node gg1423 exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
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1楼 2015-01-18 19:58:07
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hookah

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
请给出计算过程的主要控制文件：INCAR和KPOINTS请给出来，否则我们也只能瞎猜测。
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5楼2015-01-19 09:39:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
行侠仗义: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-01-19 18:08:33
行侠仗义: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-01-20 21:43:44
机器内存不够大，建议适当降低k点，将CONTCAR拷贝成POSCAR，重新交。
赞一下 回复此楼
2楼2015-01-18 20:17:28
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行侠仗义

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2015-01-18 20:17:28
机器内存不够大，建议适当降低k点，将CONTCAR拷贝成POSCAR，重新交。

请问为何算了几十个电子步都可以，到收敛的时候，却突然跳出来了？
前面做的电子步需要的内存很小，而收敛瞬间内存需求变大？


类似的bader作业我交了几个，都是出现这种错误。
赞一下 回复此楼
3楼2015-01-18 20:30:19
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未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫
引用回帖:
3楼: Originally posted by 行侠仗义 at 2015-01-18 20:30:19
请问为何算了几十个电子步都可以，到收敛的时候，却突然跳出来了？
前面做的电子步需要的内存很小，而收敛瞬间内存需求变大？


类似的bader作业我交了几个，都是出现这种错误。...

just try, and then you will know the truth.
赞一下 回复此楼
4楼2015-01-19 09:04:16
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