24小时热门版块排行榜    

查看: 2968  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

行侠仗义

铁虫 (正式写手)

[求助] 请教:vasp计算bader电荷,电子步已经收敛,却无法正常结束!无法产生CHGCAR!! 已有2人参与

OUTCAR里面已经提示:

------------------------ aborting loop because EDIFF is reached ----------------------------------------

但是却无法产生CHGCAR, out文件里面有提示:

Job  /lsfhome/Soft/lsf/8.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/openmpi_wrapper /home-gg/users/nscc609_SZJ/bin/vasp-5.2.12

TID   HOST_NAME   COMMAND_LINE            STATUS            TERMINATION_TIME
===== ========== ================  =======================  ===================
00000 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:28
00001 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00002 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00003 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00004 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00005 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:28
00006 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00007 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00008 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00009 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00010 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00011 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00012 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:23
00013 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00014 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00015 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00016 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00017 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:23
00018 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:24
00019 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00020 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00021 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:24
00022 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00023 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00024 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00025 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00026 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:10
00027 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:09
00028 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00029 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00030 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00031 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00032 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00033 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:10
00034 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00035 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:10

--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 1 with PID 22309 on
node gg1423 exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hookah

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请给出计算过程的主要控制文件:INCAR和KPOINTS请给出来,否则我们也只能瞎猜测。
5楼2015-01-19 09:39:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
行侠仗义: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-01-19 18:08:33
行侠仗义: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-01-20 21:43:44
机器内存不够大,建议适当降低k点,将CONTCAR拷贝成POSCAR,重新交。
2楼2015-01-18 20:17:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

行侠仗义

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2015-01-18 20:17:28
机器内存不够大,建议适当降低k点,将CONTCAR拷贝成POSCAR,重新交。

请问为何算了几十个电子步都可以,到收敛的时候,却突然跳出来了?
前面做的电子步需要的内存很小,而收敛瞬间内存需求变大?


类似的bader作业我交了几个,都是出现这种错误。
3楼2015-01-18 20:30:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫


引用回帖:
3楼: Originally posted by 行侠仗义 at 2015-01-18 20:30:19
请问为何算了几十个电子步都可以,到收敛的时候,却突然跳出来了?
前面做的电子步需要的内存很小,而收敛瞬间内存需求变大?


类似的bader作业我交了几个,都是出现这种错误。...

just try, and then you will know the truth.
4楼2015-01-19 09:04:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +4 zhaosm1982 2026-08-27 5/250 2026-08-27 12:17 by zhaosm1982
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-27 11:29 by xxniao123
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 面上合作单位盖章 +3 ssyjh 2026-08-27 3/150 2026-08-27 09:59 by 阿拉贡aragon
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +4 a089 2026-08-26 5/250 2026-08-27 09:24 by Howard28
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 +7 晴天加油 2026-08-26 8/400 2026-08-27 07:53 by longfie172
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见