24小时热门版块排行榜    

查看: 2974  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

行侠仗义

铁虫 (正式写手)

[求助] 请教:vasp计算bader电荷,电子步已经收敛,却无法正常结束!无法产生CHGCAR!! 已有2人参与

OUTCAR里面已经提示:

------------------------ aborting loop because EDIFF is reached ----------------------------------------

但是却无法产生CHGCAR, out文件里面有提示:

Job  /lsfhome/Soft/lsf/8.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/openmpi_wrapper /home-gg/users/nscc609_SZJ/bin/vasp-5.2.12

TID   HOST_NAME   COMMAND_LINE            STATUS            TERMINATION_TIME
===== ========== ================  =======================  ===================
00000 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:28
00001 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00002 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00003 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00004 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00005 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:28
00006 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00007 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00008 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00009 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00010 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:26
00011 gg1423     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:27
00012 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:23
00013 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00014 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00015 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00016 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00017 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:23
00018 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:24
00019 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00020 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00021 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:13:24
00022 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00023 gg1026     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00024 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00025 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00026 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:10
00027 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:09
00028 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00029 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00030 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:13
00031 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00032 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00033 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:10
00034 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGPIPE)       01/18/2015 18:14:12
00035 gg0822     /home-gg/users/n  Signaled (SIGKILL)       01/18/2015 18:14:10

--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 1 with PID 22309 on
node gg1423 exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫


引用回帖:
3楼: Originally posted by 行侠仗义 at 2015-01-18 20:30:19
请问为何算了几十个电子步都可以,到收敛的时候,却突然跳出来了?
前面做的电子步需要的内存很小,而收敛瞬间内存需求变大?


类似的bader作业我交了几个,都是出现这种错误。...

just try, and then you will know the truth.
4楼2015-01-19 09:04:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

未岸亡灵

铁杆木虫 (著名写手)

暂时离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
行侠仗义: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-01-19 18:08:33
行侠仗义: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-01-20 21:43:44
机器内存不够大,建议适当降低k点,将CONTCAR拷贝成POSCAR,重新交。
2楼2015-01-18 20:17:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

行侠仗义

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 未岸亡灵 at 2015-01-18 20:17:28
机器内存不够大,建议适当降低k点,将CONTCAR拷贝成POSCAR,重新交。

请问为何算了几十个电子步都可以,到收敛的时候,却突然跳出来了?
前面做的电子步需要的内存很小,而收敛瞬间内存需求变大?


类似的bader作业我交了几个,都是出现这种错误。
3楼2015-01-18 20:30:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hookah

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请给出计算过程的主要控制文件:INCAR和KPOINTS请给出来,否则我们也只能瞎猜测。
5楼2015-01-19 09:39:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:50 by jCd0dEvKHShX
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 11:49 by jCd0dEvKHShX
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-29 11:39 by jCd0dEvKHShX
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-29 11:17 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +3 349506619 2026-08-28 3/150 2026-08-29 10:49 by 木风9012
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-29 09:26 by G6APbkg8SA6w
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见