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tina2013liti

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎样提交序列到NCBI数据库，菌种描述怎么写 已有2人参与

本人菜鸟一枚，因论文需要，要提交自己检测的16s rDNA序列到NCBI数据，但是不知道用Banklt还是用sequin更适合?
样品为环境样品，经过DGGE，割胶测序，序列在上海生工测的，对方在RDP数据库中进行了比对，我根据自己测出的序列在GENBAND数据库中比对,我在提交序列的时候，FASTA文件不知道怎么写，菌种名称怎么写呢，写比对的结果例如unclassified_Burkholderiales_incertae_sedis，还是写Uncultured bacterium clone  16S ribosomal RNA gene, partial sequence。下图1中是上海生工的测序和比对结果，下图2是我在genbanK比对结果，请问这个的描述改怎么写呢？
凡是测得的数据都可以上传是吗，会不会跟数据库中原有数据有重复呢？
感激涕零

怎样提交序列到NCBI数据库，菌种描述怎么写
1.jpg
怎样提交序列到NCBI数据库，菌种描述怎么写-1
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1楼 2015-01-12 15:11:53
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zhaoyanqin15

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

用sequin来写就好，这个是离线的，在NCBI上下载一个最新版本的，编完后直接发给ncbi的提交邮箱就可以了。比较方便快捷。
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植物病理学
2楼2015-03-18 05:06:35
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小尕吴

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaoyanqin15 at 2015-03-18 05:06:35
用sequin来写就好，这个是离线的，在NCBI上下载一个最新版本的，编完后直接发给ncbi的提交邮箱就可以了。比较方便快捷。

请问在sequin中出现下图这种怎么办？？？
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3楼2015-12-09 23:30:03
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