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bianyuan2680

至尊木虫 (著名写手)

[交流] VASP计算问题

VASP计算优化时-COO羧基严重变形,角度变大接近180(图中绿色圈内),一直得不到优化的结果,真空层30埃,K点3*3*1   
INCAR文件如下:
SYSTEM=Dye
PREC=Accurate
ISTART=0
ICHARG=2
GGA=PE
ISIF=2
EDIFF=1E-03
EDIFFG=-0.04
NELMIN=5
NELM=200
NELMDL=-5
ISMEAR=-5
ENCUT=300
NSW=60
IBRION=2
POTIM=0.5
LWAVE=.FALSE.
LREAL=Auto
IALGO=48
NPAR=4

求指点

VASP计算问题
建模的初始结构


VASP计算问题-1
优化过程中的CONTCAR结构
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鹰羽龙

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
bianyuan2680: 金币+5 2015-01-08 21:39:17
两个C-O键长有多长?这么大的分子在表面吸附60步之内很难优化完的,除非初始结构预设得非常合理。建议增大NSW,并重新调整初始吸附构型。另外表面的slab是不是足够大以减小镜像之间尤其是水平方向相互作用。
2楼2015-01-07 09:55:04
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bianyuan2680

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 鹰羽龙 at 2015-01-07 09:55:04
两个C-O键长有多长?这么大的分子在表面吸附60步之内很难优化完的,除非初始结构预设得非常合理。建议增大NSW,并重新调整初始吸附构型。另外表面的slab是不是足够大以减小镜像之间尤其是水平方向相互作用。

3楼2015-01-07 14:52:59
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bianyuan2680

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 鹰羽龙 at 2015-01-07 09:55:04
两个C-O键长有多长?这么大的分子在表面吸附60步之内很难优化完的,除非初始结构预设得非常合理。建议增大NSW,并重新调整初始吸附构型。另外表面的slab是不是足够大以减小镜像之间尤其是水平方向相互作用。

太感谢你的回复了!我之前是计算过类似的体系,很快就能优化完成,-COO也正常。
我也考虑了是不是因为表面的slab太小,后来加大到80个Ti的表面,也还是会出现这种羧基变形的情况
我给的初始C-O键长是高斯优化得到的COO结构,优化过程中羧基C慢慢变得与羧基的两个O原子在同一条线上了
不知道是什么原因导致的
4楼2015-01-07 14:53:15
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ssyexing

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
bianyuan2680: 金币+5 2015-01-08 21:39:24
先用高斯优化下 再计算 会不会更好点呢 高斯优化的话计算步骤应该会少点的吧
5楼2015-01-08 16:14:32
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bianyuan2680

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by ssyexing at 2015-01-08 16:14:32
先用高斯优化下 再计算 会不会更好点呢 高斯优化的话计算步骤应该会少点的吧

太感谢你的回复了

高斯优化的表面上的有机分子,无机材料那部分是固定的。建的模太大了,高斯跑不太动
就是现在不清楚是什么原因导致的这个-COO严重变形
6楼2015-01-08 21:33:02
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