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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 全基因组圈图
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ygqhappy

金虫 (正式写手)

[求助] 全基因组圈图 已有2人参与

最近在华大测了一株细菌的全基因组精细图，可是数据里面没有全基因组的圈图，问了公司说只有完成图才能做圈图，请问是这样的吗？如果利用精细图做圈图的话有没有比较容易掌握的软件？
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1楼 2014-12-12 10:41:46
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clark2010

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-12-15 10:17:19
ygqhappy: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢 2014-12-15 15:38:11
我觉得做不出来圈图。不过听说过类似的事情，你可以找个同菌种的菌株比对一下，确定相对位置。然后补缺口也好补。
至于软件，没用过，也不知道，还得别人来回答。
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2楼2014-12-14 06:51:28
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王丹2013

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
ygqhappy: 金币+15, ★★★很有帮助 2015-01-09 14:43:43
你找个与你基因组相似度最高的基因组全图作参考，先用Mauve软件将你自己的草图重排，然后再用CGview 软件就可以画圈图了
赞一下 回复此楼
3楼2014-12-18 14:25:08
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