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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 求助VASP自带NEB的INCAR设置。按照我的INCAR计算只有在01文件夹里有输出文件
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jayjeremyyu

金虫 (小有名气)

[求助] 求助VASP自带NEB的INCAR设置。按照我的INCAR计算只有在01文件夹里有输出文件 已有2人参与

如题。。
各位前辈啊。帮帮忙啊。老师让计算Li离子在正极材料中的迁移过程。没有什么基础，也没有师兄能带，老师也不懂。
我按照我设置的INCAR进行计算，只有01子文件夹有输出文件，其他文件夹都没有输出文件。之前看到的资料应该是除了两个端点外，其他的子文件夹都会有输出文件的。
我是用nebmake.pl插入构象的。
不是我不用CINEB，尝试过编译，总不成功。没什么基础，不会编译vtstcode，我也不敢怎么硬来编译，服务器很多人在用，编译坏了不好交代。就放弃了，想用VASP自带的。
我的INCAR如下：
System= LiMnO2
ISTART=0
ENCUT=400
PREC =normal
ISMEAR=0
SIGMA=0.05
GGA=PE; EDIFFG=-0.05
ICHARG=2
LREAL=Auto
NSW=5
ISIF=2
IBRION=1
IMAGES=7
SPRING=-5
NFREE=2
LSCALAPACK=.FALSE
希望各位能帮帮忙啊。一直都没有结果，快开组会了，再没有一点结果老师就要骂人了。
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1楼 2014-12-06 23:44:26
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春华秋实538

铁杆木虫 (小有名气)

博士

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jayjeremyyu: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-12-09 00:29:34
http://cms.mpi.univie.ac.at/wiki ... ic_Band_Calculation 你可以试试这个简单的算例。我运行过是没问题的。另外你可以在你的目录下面安装VASP，不会对其他用户造成影响。CNEB与NEB比较起来更加容易找到鞍点，反应势垒更加准确。
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2楼2014-12-08 21:10:37
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jayjeremyyu

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 春华秋实538 at 2014-12-08 21:10:37
http://cms.mpi.univie.ac.at/wiki/index.php/Collective_jumps_of_a_Pt_adatom_on_fcc-Pt_%28001%29:_Nudged_Elastic_Band_Calculation 你可以试试这个简单的算例。我运行过是没问题的。另外你可以在你的目录下面安 ...

真的感谢你的回复，那我就敢放开手脚乱来了。凌晨12点后才看到你的回复。还有一个问题，计算neb需要并行版的vasp是吗？你有相关关于并行版vasp编译的资料吗？？谢谢。。
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3楼2014-12-09 00:29:14
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春华秋实538

铁杆木虫 (小有名气)

博士

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by jayjeremyyu at 2014-12-09 00:29:14
真的感谢你的回复，那我就敢放开手脚乱来了。凌晨12点后才看到你的回复。还有一个问题，计算neb需要并行版的vasp是吗？你有相关关于并行版vasp编译的资料吗？？谢谢。。...

当然得要并行的了，不同的images提交到不同和核上或者节点上，直接都有communication.并行的安装方法，小木虫上有很多资源，可以试着搜索下。
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4楼2014-12-09 01:48:10
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空明之小

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jayjeremyyu: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-12-09 10:25:29
当小木虫上有很多资源，可以试着搜索下 不同的images提交到不同和核上或者节点上，直接都有communication，
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在路上
5楼2014-12-09 08:48:35
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jayjeremyyu

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 空明之小 at 2014-12-09 08:48:35
当小木虫上有很多资源，可以试着搜索下 不同的images提交到不同和核上或者节点上，直接都有communication，

直接都有communication是什么意思啊？？不知道。。能不能说得直白些啊。。是真的不懂。以前不做电脑模拟，半路出家的，什么都不懂。还有，那个服务器上的vasp是串行的，那我在我自己的目录下安装并行的时候还需要重新编译那些ifort的东西吗？
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6楼2014-12-09 10:25:08
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春华秋实538

铁杆木虫 (小有名气)

博士

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
jayjeremyyu: 金币+5 2014-12-10 11:07:29
引用回帖:
6楼: Originally posted by jayjeremyyu at 2014-12-09 10:25:08
直接都有communication是什么意思啊？？不知道。。能不能说得直白些啊。。是真的不懂。以前不做电脑模拟，半路出家的，什么都不懂。还有，那个服务器上的vasp是串行的，那我在我自己的目录下安装并行的时候还需要重 ...

节点之间都有通讯（数据互通）。你可以参照下这个帖子http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7578359&fpage=1&target=blank  安装vasp
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7楼2014-12-10 00:24:06
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