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lixiaoyi1981

荣誉版主 (正式写手)

[交流] 5月份疑难问题汇总,请高手解答。

对5月份的一些疑难问题进行了汇总,主要是实验中遇到的问题,但是对于叙述不清的和叙述太过“简洁”的没有编入此次汇总。希望各位虫友踊跃回答,每个问题根据解决程度给予至少5个金币的回报。
搞这个汇总的目的有三:1、解决一些悬而未决而又比较有意义的问题;2、为小木虫的生物积累可贵的资源3、鼓励大家互助互惠。
操作方法:如有虫友解决了相应问题,请在下方跟帖说明,我们可以及时了解并给予“赏金”。
第一次做汇总,请大家支持。谢谢。
1、尘螨的分离
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=802200
2、双向电泳后银染问题!!!
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=802214
3、如何选择电泳胶条?线性OR非线性?
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=802514
4、如何降低抗体灵敏度!
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=807214
5、怎样才能准确扩取一物种未知的功能基因
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=805736
6、EST序列如何进行功能分类
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=805763
7、预测趋化因子结合位点
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=806671
8、那位大虾用dpph检测过金属硫蛋白阿
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=805466
9、如何将细胞核蛋白和胞浆蛋白分离?
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=809879
10、请问用过NBT法测SOD酶活性高手
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=809609
11、关于共聚焦显微镜的问题!!!
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=812603
12、细胞转染并经稳定筛选后形态发生变化的原因
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=812517
13、通95% O2和5% CO2混合气的NaHCO3缓冲的EBSS
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=810929
14、关于植物脱胶的问题?
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=816825
15、核蛋白的透析和去除非特异性
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=816313
16、关于PAGE的3个问题
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=817853
17、三氯乙酸沉淀蛋白后怎样除去TCA?
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=817314
18、发酵液预处理问题
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=817095
19、请教寡聚核苷酸的稳定性
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=821590
20、mGFP4在真菌中能不能表达?
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=821491
21、怎么诱导植物中NADPH的产生?
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=820753
22、如何计算QTL位点的贡献率
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=820688
23、细胞的HE染色方法
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=819708
24、
[search]疑难 解答[/search]
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reasonspare

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lixiaoyi1981(金币+10,VIP+0):好详细,第一个“搬城门木头”的人,重奖。谢谢
顶一下斑斑":

问题 16:

关于PAGE的3个问题

用水、盐、和醇分别提取的植物种子的蛋白
1、有听说溴酚兰点在电极缓冲液中的吗?我一直点在样品里,现在有点在电极缓冲液中的,对其原理和操作,很不明白
答:有这种情况,溴芬兰无论在点样空,还是在buffer 都是一样的原理,都是起到知识的作用, 通常大家都喜欢和样品混合一起点到样孔,但是有些人考虑到 page的胶孔透光性很强,很难点样,何容易串样,所以在整个buffer中加入溴芬兰,这样的效果是的点样井清晰可见. 而且对电泳没有任何影响.

2、胶跑的过程中不直,是怎么回事?
两个问题: 1 胶的pH和电泳buffer的pH 2, 电泳过程产生大量热, 胶表面受热不均匀.

3、跑完洗脱后,发现刚开始进入分离胶的地方,谱带呈栅栏状,再往下就没事了,是怎么回事?
答:没有明白: 既然跑完,那就是溴芬兰到胶底部,你怎么就能看到物质刚到分离胶的位置, 如果你能看到物质的位置,我们就不需要染色了. 图谱栅栏状,最大可能就是TBE有问题,离子强度有问题,或者使用不纯的水. 什么叫下面没事了,不知所云.
大慈大悲观世音救苦救难观世音有求必应观世音普渡众生观世音千手千眼观世音官大敢管观世音无处不在观世音普观普长观世音南无观世音菩萨
2楼2008-05-20 08:57:48
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reasonspare

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lixiaoyi1981(金币+8,VIP+0):个人的经验就是好。小木虫有更多的这种心得就好了。呵呵
17
求助:三氯乙酸沉淀蛋白后怎样除去TCA?

利用三氯乙酸沉淀蛋白,留下需要的其它物质,这时候怎样除去其中的TCA?  

最简单的方法就是 真空干燥,然后重新溶解,当然你是不需要有活性了,如果要保持活性的就需要低温冷冻干燥了.
或者,采用高速离心,去掉上清,重新溶解.
本人采用第一种方法.
-80度冷冻后,迅速放入低温冷冻干燥器中 6-12小时,根据样品多少,可以overnight就OK
大慈大悲观世音救苦救难观世音有求必应观世音普渡众生观世音千手千眼观世音官大敢管观世音无处不在观世音普观普长观世音南无观世音菩萨
3楼2008-05-20 09:03:53
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zyk_527

银虫 (小有名气)

lixiaoyi1981(金币+0,VIP+0):需要详细一些,他还有其他问题,请看相应帖子。我们是不会吝啬金币的。谢谢
5、怎样才能准确扩取一物种未知的功能基因
答:通过取得保守序列,用3‘-race和5’race拿到全基因
4楼2008-05-22 10:02:52
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guzhu0501

铜虫 (初入文坛)

问题5

★ ★ ★ ★ ★ ★
lixiaoyi1981(金币+6,VIP+0):谢谢,呵呵。不错。评分晚了,对不住
扩取一物种未知的功能基因,那就一定知道他的功能是什么了。
1.通过功能查找模式生物相同功能的基因序列。比如若你研究的是水稻的什么功能基因,你就查拟南芥的。
2.通过模式生物的功能基因的序列在NCBI上BLAST比对,或得相同功能的同源性较高的一些生物的基因序列。
3.利用生物学软件将这些相同功能的基因进行比对,或得一段或几段比较保守的序列。
4.设计引物进行RT-PCR或PCR,若不能或得全长,那你只能再做热不对称PCR或RACE了。
5楼2008-05-22 15:49:13
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张力民

铜虫 (小有名气)

lixiaoyi1981(金币+0,VIP+0):没有解决问题,呵呵,恕难加金币。
问题9:如何将细胞核蛋白和胞浆蛋白分离?
  有专门的提取蛋白的试剂盒,不过较贵。
6楼2008-05-23 16:55:36
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andyhu2001

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
lixiaoyi1981(金币+5,VIP+0):谢谢,最近有些忙,给金币晚了。对不住
问题12:
我也遇到了这个问题,个人觉得一下的说法比较有道理
加药筛选约6天左右,细胞会大量死亡,孔中只剩下的细胞寥寥无几。这时会出现两个问题:
1.死亡的细胞会裂解释放出有害物质,导致那些有neo表达的阳性细胞死亡,即非选择性死亡。
2.孔中细胞数目很少,细胞之间的信号会变得很弱,也会导致阳性细胞的状态不佳甚至死亡。
以下是建议的解决方法仅供参考:
这个时候需要一种特殊的培养液:细胞汇合度达到80%的时候,换液,培养过夜之后收集培养液,通过滤器消毒,和新鲜的培养液按1:1混合备用。再转染后筛选过程中就可以应用这种培养基。
但行好事,莫问前程!
7楼2008-05-26 22:25:27
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neuron2004

金虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
lixiaoyi1981(金币+5,VIP+0):呵呵,请收下。
问题13:
      通入的混合气体中的O2气是提高HBSS液中的氧气含量,提高急性分离的细胞或脑片的成活率;CO2气在HBSS液中H20+ CO2= H + HCO3 形成弱酸缓冲体系。
      将混合气的气瓶接解压阀后用橡胶软管或者是一次性的输液器导入要通气的HBSS液中,用解压阀控制流量,流量大小可通过通气的HBSS液中的气泡多少判断。
8楼2008-06-14 23:52:32
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tanhua

铁虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★ ★
lixiaoyi1981(金币+5,VIP+0):正解,谢谢。
怎样才能准确扩取一物种未知的功能基因?
听你的意思是要在一个物种中扩增其他物种中已知的基因,即同源克隆。如果是这样,通常的方法就是把Genbank中所有的(太多的话可以有选择)同源基因作一个比对,根据亲缘相近物种的保守区段设计引物进行目的基因的扩增,对一些多拷贝的基因,PCR的时候可以适当放宽条件,不要过分要求特异性,挑克隆的时候可以多选择一些不同长度的片断,对单拷贝的基因,PCR的特异性适当提高。
9楼2008-06-16 11:20:19
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tanhua

铁虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★ ★
lixiaoyi1981(金币+5,VIP+0):谢谢,会者不难。
如何计算QTL位点的贡献率?
Windows QTL Cartographer V2.5可同时给出基因的加显性效应和基因对性状表型变异方差的贡献率。 Windows QTL Cartographer V2.O没有用过,不知道是不是没有这个功能。
10楼2008-06-16 11:29:47
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