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qx4117

银虫 (小有名气)

[求助] 功能基因的处理 已有1人参与

高通量测序nifH基因序列,不知道用哪个数据库比对来确定分类。好不容易在FunGene中找见了nifH基因的数据库,却没办法下载。希望熟悉这方面的虫虫给予指点。
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wjt5856

木虫 (小有名气)

nifh现在貌似有库了吧
2楼2015-03-05 22:06:56
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ectoine

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wjt5856 at 2015-03-05 22:06:56
nifh现在貌似有库了吧

请教楼主一个问题啊,你用什么引物P出来的nifH基因啊?我p两周了,都没出来,
3楼2015-03-17 18:27:57
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wjt5856

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ectoine at 2015-03-17 18:27:57
请教楼主一个问题啊,你用什么引物P出来的nifH基因啊?我p两周了,都没出来,...

是不是条件不太好啊,优化下,或者换个酶啥的。我没p过nifH,只是帮别人处理过数据
4楼2015-03-17 20:58:42
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qx4117

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wjt5856 at 2015-03-05 22:06:56
nifh现在貌似有库了吧

但是不知道怎么下载,做的是高通量的。
5楼2015-04-20 00:19:30
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qx4117

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ectoine at 2015-03-17 18:27:57
请教楼主一个问题啊,你用什么引物P出来的nifH基因啊?我p两周了,都没出来,...

不知道你扩增出来了没有。我们是高通量的,不过之前我们用nifH1,nifH2,nifH3,nifH4扩增的。
6楼2015-04-20 00:24:38
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南北0297

新虫 (初入文坛)

请问楼主你做出来了吗?
7楼2016-02-15 10:37:02
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qx4117

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 南北0297 at 2016-02-15 10:37:02
请问楼主你做出来了吗?

后面再没做,在测序公司比对的基础上处理的。
8楼2016-02-17 14:30:56
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sky邹大侠

新虫 (小有名气)

请问楼主,后面是交给测序公司去比对的么?
just fighting
9楼2017-09-04 09:19:46
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sky邹大侠

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

选择你想分析的基因,点进去,选择,然后begin analysis就能下载了,不过每次只能下载10000条序列。想请教一下楼主,下载完之后如何比对呢?
just fighting
10楼2017-09-04 09:25:35
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