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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » ms吸附模拟建模问题
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mzlwait

木虫 (正式写手)

[求助] ms吸附模拟建模问题 已有2人参与

把吸附物表面模型建立好之后，被吸附的物质模型怎么加到表面上去，距离表面多少，这个距离是怎样定的，还是估计合适就好，谢谢
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1楼 2014-11-25 13:39:15
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夏陌86℃

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-11-25 14:55:34
复制被吸附物质，粘贴进表面即可。被吸附物放置的位置，有不少方法，最常用手动放置即可，位置一般选在盒子中心，文献常描述“随机放在盒子的中央”，被吸附物质与表明的距离问题，最简单的，手动拖动，别太远别太近 ...

请问，如果通过先建真空层为零的表面，然后用AC模块建含有有机分子的立方盒子，在build layer 两层建在一起。和直接将有机分子复制到表面层在进行动力学模拟有什么差别，刚接触不太懂，求指教。
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7楼2014-11-28 17:19:14
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zhenwuhuang

至尊木虫 (文学泰斗)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
mzlwait(abinitio代发): 金币+1, 鼓励交流 2014-11-29 11:36:24
帮顶一下
MS建模疑难问题详解
http://wenku.baidu.com/view/4dc9b4b581c758f5f61f6779.html
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2楼2014-11-25 14:02:48
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mzlwait(abinitio代发): 金币+3, 鼓励交流 2014-11-29 11:36:12
复制被吸附物质，粘贴进表面即可。被吸附物放置的位置，有不少方法，最常用手动放置即可，位置一般选在盒子中心，文献常描述“随机放在盒子的中央”，被吸附物质与表明的距离问题，最简单的，手动拖动，别太远别太近即可，稍复杂点，选中被吸附物，Build--Close contacts--勾选 Monitor close contacts，然后拖动被吸附物靠近表面，直到出现粉色的虚线为止，停止。
赞一下(1人) 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
3楼2014-11-25 14:55:34
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suihg

金虫 (职业作家)
顺便学习了！！！
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4楼2014-11-27 10:05:47
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