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飘飘转世

银虫 (小有名气)

[求助] 请求高手关于ATK/VNL中分子建模的问题

本人ATK/VNL软件初学者,现用版本为12.2.2,在http://www.quantumwise.com/products/download上下载的。学习了几天,回构建已知分子的分子结模型,但是没找到画分子三维图的方法。现在又下面一个正在研究的分子,请求各位大侠帮助或给我画分子三维图的指示!

OH(正确)-连接后.jpg
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majiejili

金虫 (小有名气)

我们是先把MS中保存为car,然后把坐标复制到到py文件中,就可以用builder打开了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

好好科研
6楼2012-10-26 14:55:37
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zhangguangping

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
飘飘转世: 金币+15, ★★★★★最佳答案 2012-10-25 19:03:46
内容已删除
弘德明志博学笃行
3楼2012-10-25 16:53:07
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普通回帖

77585218358

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
飘飘转世: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-10-25 19:03:57
你可以用MS进行建模,然后把MS建好的分子结构导入到ATK中。
2楼2012-10-25 14:13:52
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飘飘转世

银虫 (小有名气)

内容已删除
4楼2012-10-25 19:07:37
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飘飘转世

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 77585218358 at 2012-10-25 14:13:52
你可以用MS进行建模,然后把MS建好的分子结构导入到ATK中。

非常感谢,MS建完模需要保存成什么文件格式,再导入ATK中?
5楼2012-10-25 19:09:05
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飘飘转世

银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by majiejili at 2012-10-26 14:55:37
我们是先把MS中保存为car,然后把坐标复制到到py文件中,就可以用builder打开了

嗯,谢谢!
7楼2012-10-26 23:02:16
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飘飘转世

银虫 (小有名气)

内容已删除
8楼2012-11-01 15:34:52
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zhangguangping

木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 飘飘转世 at 2012-11-01 15:34:52
在GaussView中构建完毕后,取出结构存成XYZ格式,具体是个什么步骤呢? 我试了好多次没成功...

首先存成gjf格式,然后用写字板打开,将结构取出来,按照xyz格式存一下就得了。so easy。
弘德明志博学笃行
9楼2012-11-01 15:37:41
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飘飘转世

银虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by zhangguangping at 2012-11-01 15:37:41
首先存成gjf格式,然后用写字板打开,将结构取出来,按照xyz格式存一下就得了。so easy。...

我用XP(3G)内存计算  到中途总是出现unknown software exception(Ox40000015) Ox7857bea4 导致运行失败,然后用换 server 03(6G),还是会出现这样的错误。我整了好几天,还是没整好,这是为什么呢? 是不是这个分子太大?(扩展分子总共有190左右个原子)

未命名.jpg

10楼2012-11-02 10:05:55
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