应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 请求高手关于ATK/VNL中分子建模的问题
121/2返回列表12下一页
查看: 2482  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

飘飘转世

银虫 (小有名气)

[求助] 请求高手关于ATK/VNL中分子建模的问题

本人ATK/VNL软件初学者，现用版本为12.2.2，在http://www.quantumwise.com/products/download上下载的。学习了几天，回构建已知分子的分子结模型，但是没找到画分子三维图的方法。现在又下面一个正在研究的分子，请求各位大侠帮助或给我画分子三维图的指示！

OH(正确)-连接后.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-10-24 12:46:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

majiejili

金虫 (小有名气)
我们是先把MS中保存为car，然后把坐标复制到到py文件中，就可以用builder打开了
赞一下(2人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

飘飘转世
好好科研
6楼2012-10-26 14:55:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
飘飘转世: 金币+15, ★★★★★最佳答案 2012-10-25 19:03:46
内容已删除
赞一下(1人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
3楼2012-10-25 16:53:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

77585218358

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
飘飘转世: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-10-25 19:03:57
你可以用MS进行建模，然后把MS建好的分子结构导入到ATK中。
赞一下 回复此楼
2楼2012-10-25 14:13:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飘飘转世

银虫 (小有名气)
内容已删除
回复此楼
4楼2012-10-25 19:07:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飘飘转世

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 77585218358 at 2012-10-25 14:13:52
你可以用MS进行建模，然后把MS建好的分子结构导入到ATK中。

非常感谢，MS建完模需要保存成什么文件格式，再导入ATK中？
赞一下 回复此楼
5楼2012-10-25 19:09:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飘飘转世

银虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by majiejili at 2012-10-26 14:55:37
我们是先把MS中保存为car，然后把坐标复制到到py文件中，就可以用builder打开了

嗯，谢谢！
回复此楼
7楼2012-10-26 23:02:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飘飘转世

银虫 (小有名气)
内容已删除
回复此楼
8楼2012-11-01 15:34:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 飘飘转世 at 2012-11-01 15:34:52
在GaussView中构建完毕后，取出结构存成XYZ格式，具体是个什么步骤呢？ 我试了好多次没成功...

首先存成gjf格式，然后用写字板打开，将结构取出来，按照xyz格式存一下就得了。so easy。
赞一下 回复此楼
弘德明志博学笃行
9楼2012-11-01 15:37:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飘飘转世

银虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by zhangguangping at 2012-11-01 15:37:41
首先存成gjf格式，然后用写字板打开，将结构取出来，按照xyz格式存一下就得了。so easy。...

我用XP（3G）内存计算  到中途总是出现unknown software exception(Ox40000015) Ox7857bea4 导致运行失败，然后用换 server 03(6G)，还是会出现这样的错误。我整了好几天，还是没整好，这是为什么呢？ 是不是这个分子太大？（扩展分子总共有190左右个原子）

未命名.jpg
赞一下 回复此楼
10楼2012-11-02 10:05:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 飘飘转世 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 21:37 by vZfe6xYu34yj
[考博] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-14 21:36 by vZfe6xYu34yj
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-14 21:24 by vZfe6xYu34yj
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-14 21:21 by vZfe6xYu34yj
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +4 两三岁ss 2026-09-14 4/200 2026-09-14 20:29 by 班主任的同桌
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-14 18:01 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-14 17:49 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-14 17:48 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-14 17:25 by Aj1rhIDL5ixY
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-14 16:25 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:00 by Aj1rhIDL5ixY
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:57 by Aj1rhIDL5ixY
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:48 by Aj1rhIDL5ixY
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:45 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-14 15:21 by Aj1rhIDL5ixY
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 15:09 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
[考博] 西北工业大学材料学院电化学传感与催化课题组招收2027年推免研究生、博士生、博士后 +3 马方园 2026-09-10 4/200 2026-09-14 09:29 by Chem张zz
[教师之家] 浙江师范大学是怎么坑我的 +10 recruit123 2026-09-09 15/750 2026-09-13 10:45 by seaskyy
[有机交流] 科研求助 10+4 我吃一只鱼 2026-09-07 4/200 2026-09-10 08:32 by 0940628
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭