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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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shellyxss

金虫 (正式写手)

[求助] 我提取的基因组 要拿去做高通量测序 已有4人参与

下图是我提取的基因组,有两条带,测序公司说是样品不纯,但是我做了16S的鉴定,是纯种的,这是怎么回事呢?

我提取的基因组 要拿去做高通量测序
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黑藻先生

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shellyxss: 金币+2, 有帮助 2014-11-26 08:35:23
不太清楚 不过给点建议
可能是有不同亚种
16sRNA只能鉴定到种貌似,再往后就不行了
7楼2014-11-25 21:05:03
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黑藻先生

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by shellyxss at 2014-11-26 08:35:18
可是如果有杂菌的话16S鉴定后应该测序测不出来才对啊...

为什么不能测出来?你拿什么去测都能测,只是数据好不好的问题
我面手头一个很蛋疼的项目就是一人说纯化好了一株菌测完以后发现是三株混一块了
10楼2014-11-26 21:24:48
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sbh1981

新虫 (初入文坛)

沉降系数不能说明基因组的纯度,因为很多不同的基因组,沉降系数很可能一样的。希望对你有帮助。
16楼2014-11-27 14:32:57
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黑藻先生

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
18楼: Originally posted by shellyxss at 2014-11-28 08:47:08
啊 但是把16S的基因P出来拿去测序测出来只有一个序列不能说明是纯的嘛?...

不一定
首先 你16SRNA真实序列你是不知道的(要不然你还去测什么序列)
这样的话真实的P你也是不知道的
而现在用的都是通用的P
有的菌种用这种通用的P是P不出来的
换句话说 你这个只能证明你P出来的那一个是纯的
但是不能说明你样品里就这一个

这种情况并不是很少见
21楼2014-11-28 17:21:14
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普通回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shellyxss: 金币+2, 有帮助 2014-11-24 15:37:27
你跑胶没有Marker的吗?
有没有Nanodrop的结果?
或者测序公司的Bioanalyzer的结果要来看看呀
2楼2014-11-24 14:58:52
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shellyxss

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2014-11-24 14:58:52
你跑胶没有Marker的吗?
有没有Nanodrop的结果?
或者测序公司的Bioanalyzer的结果要来看看呀

Marker和Nanodrop的结果都有的 和样品纯不纯有关系嘛?
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3楼2014-11-24 15:37:22
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shellyxss

金虫 (正式写手)

来看看
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4楼2014-11-24 19:46:07
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shellyxss

金虫 (正式写手)

来看看吧
Always be curious about nature
5楼2014-11-25 15:52:17
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shellyxss

金虫 (正式写手)

...
6楼2014-11-25 20:22:14
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shellyxss

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 黑藻先生 at 2014-11-25 21:05:03
不太清楚 不过给点建议
可能是有不同亚种
16sRNA只能鉴定到种貌似,再往后就不行了

可是如果有杂菌的话16S鉴定后应该测序测不出来才对啊
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8楼2014-11-26 08:35:18
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shellyxss

金虫 (正式写手)

...
9楼2014-11-26 15:48:22
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