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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 我提取的基因组 要拿去做高通量测序
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a50044758

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shellyxss(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-11-27 19:52:44
shellyxss: 金币+1, ★有帮助 2014-11-28 08:47:54
他说的不存是指的你的DNA质量不好，提完你测过OD值吗？里面的蛋白质和盐都除干净了吗？
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11楼2014-11-26 21:47:54
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billtsu

木虫 (正式写手)

木木

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shellyxss: 金币+2, ★有帮助 2014-11-27 11:01:45
是单菌落摇的吗？

[ 发自小木虫客户端 ]
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啊木
12楼2014-11-26 22:12:06
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shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by billtsu at 2014-11-26 22:12:06
是单菌落摇的吗？

纯化好的菌拿去摇的，然后提取完基因组做了鉴定的呢
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13楼2014-11-27 11:02:19
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shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by a50044758 at 2014-11-26 21:47:54
他说的不存是指的你的DNA质量不好，提完你测过OD值吗？里面的蛋白质和盐都除干净了吗？

测完了 都在正常范围内呢，用的nanodrop测的
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14楼2014-11-27 11:02:56
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billtsu

木虫 (正式写手)

木木
引用回帖:
13楼: Originally posted by shellyxss at 2014-11-27 11:02:19
纯化好的菌拿去摇的，然后提取完基因组做了鉴定的呢...

我希望知道的是，是不是 《单菌落》
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啊木
15楼2014-11-27 14:16:47
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sbh1981

新虫 (初入文坛)
沉降系数不能说明基因组的纯度，因为很多不同的基因组，沉降系数很可能一样的。希望对你有帮助。
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16楼2014-11-27 14:32:57
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shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by billtsu at 2014-11-27 14:16:47
我希望知道的是，是不是 《单菌落》...

是把单菌落挑到斜面上面，然后再把斜面上的菌接到液体培养基上的。
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17楼2014-11-28 08:46:09
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shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
16楼: Originally posted by sbh1981 at 2014-11-27 14:32:57
沉降系数不能说明基因组的纯度，因为很多不同的基因组，沉降系数很可能一样的。希望对你有帮助。

啊 但是把16S的基因P出来拿去测序测出来只有一个序列不能说明是纯的嘛？
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18楼2014-11-28 08:47:08
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shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 黑藻先生 at 2014-11-26 21:24:48
为什么不能测出来？你拿什么去测都能测，只是数据好不好的问题
我面手头一个很蛋疼的项目就是一人说纯化好了一株菌测完以后发现是三株混一块了...

做菌种鉴定的时候，如果有杂菌那么测出来的序列应该有好几种才对。可是我送去测序之后的结果就只有一条序列，所以我觉得我的应该是纯种才对。
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19楼2014-11-28 08:52:18
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billtsu

木虫 (正式写手)

木木
引用回帖:
17楼: Originally posted by shellyxss at 2014-11-28 08:46:09
是把单菌落挑到斜面上面，然后再把斜面上的菌接到液体培养基上的。...

能保证不被污染吧
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啊木
20楼2014-11-28 11:20:12
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