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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 我提取的基因组 要拿去做高通量测序
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黑藻先生

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
18楼: Originally posted by shellyxss at 2014-11-28 08:47:08
啊 但是把16S的基因P出来拿去测序测出来只有一个序列不能说明是纯的嘛？...

不一定
首先 你16SRNA真实序列你是不知道的（要不然你还去测什么序列）
这样的话真实的P你也是不知道的
而现在用的都是通用的P
有的菌种用这种通用的P是P不出来的
换句话说 你这个只能证明你P出来的那一个是纯的
但是不能说明你样品里就这一个

这种情况并不是很少见
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21楼2014-11-28 17:21:14
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黑藻先生

银虫 (小有名气)
引用回帖:
19楼: Originally posted by shellyxss at 2014-11-28 08:52:18
做菌种鉴定的时候，如果有杂菌那么测出来的序列应该有好几种才对。可是我送去测序之后的结果就只有一条序列，所以我觉得我的应该是纯种才对。...

所以你的“菌种鉴定” 如上面所说 可能有问题 #不好意思回复错楼了上面#
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22楼2014-11-28 17:22:30
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黑藻先生

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

再次强调一下，16sRNA只能鉴定到种，基本不能鉴定亚种
你的16sRNA是纯的，也有可能是好多株同种菌的亚种混在一起，因为他们的16sRNA是一样的
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23楼2014-11-28 18:07:48
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