| 查看: 1962 | 回复: 3 | |||
zhangmao511铁虫 (小有名气)
|
[求助]
Gromacs 运行GPU加速命令的问题 已有1人参与
|
|
最近想尝试用GPU加速，来跑Gromacs，看了下官网手册，说在mdrun命令的时候，追加-nb gpu即可。 -nb enum auto Calculate non-bonded interactions on: auto, cpu, gpu or gpu_cpu 想问一下，后面的选项cpu, gpu or gpu_cpu，都有什么不同呢？选-nb gpu和-nb gpu_cpu有什么不同吗？（字面上理解是GPU和CPU同时运行，不知道是不是） 然后，还想问一下，我之前用的是mpirun -np 12 mdrun_mpi -v -deffnm md_0_1这个命令，如果后面追加-nb gpu，是不是在多线程运行下，再加上GPU加速呢？？谢谢！！  |
回复此楼» 猜你喜欢
职称评审没过，求安慰
已经有51人回复
-
毕业后当辅导员了，天天各种学生超烦
已经有5人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
-
垃圾破二本职称评审标准
已经有17人回复
-
投稿Elsevier的Neoplasia杂志，到最后选publishing options时页面空白，不能完成投稿
已经有22人回复
-
EST投稿状态问题
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- gromacs中的mdp文件的编译问题
已经有6人回复
- 用apt-get的方法在一台计算机上安装gromacs可以正常使用吗？
已经有5人回复
- gromacs 用GPU版本 跑动力学
已经有9人回复
- 新手求教：怎么在GROMACS下实现并行计算？怎么看用了几个CPU？
已经有4人回复
- gromacs 中mdrun命令
已经有3人回复
- 在gromacs中运行mdrun命令时出错
已经有10人回复
- [新手求教]安装Gromacs后，查看pdb2gmx命令，显示无此命令
已经有9人回复
- 【求助】重金求助：gromacs中g_rms命令中怎样应用index.ndx文件
已经有8人回复
- 【求助】fedora中LAMMPS编译问题
已经有4人回复
- 【求助】安装abinit-6.2.3出现的新问题？请教
已经有5人回复
- 【讨论】在Cygwin下编译lammps的相关问题
已经有6人回复
★
感谢参与，应助指数 +1
abinitio: 金币+1, 感谢应助 2014-11-21 08:14:13
感谢参与，应助指数 +1
abinitio: 金币+1, 感谢应助 2014-11-21 08:14:13
|
本帖内容被屏蔽 |
2楼2014-11-19 11:34:07
zhangmao511
铁虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 33
- 红花: 2
- 帖子: 136
- 在线: 29.7小时
- 虫号: 2553312
- 注册: 2013-07-19
- 性别: GG
- 专业: 蛋白质组学
3楼2014-11-20 11:44:02
★
abinitio: 金币+1, 感谢应助 2014-11-21 14:54:19
abinitio: 金币+1, 感谢应助 2014-11-21 14:54:19
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2014-11-21 14:26:11