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zhangmao511

铁虫 (小有名气)

[求助] Gromacs 运行GPU加速命令的问题 已有1人参与

最近想尝试用GPU加速,来跑Gromacs,看了下官网手册,说在mdrun命令的时候,追加-nb gpu即可。
-nb enum auto Calculate non-bonded interactions on: auto, cpu, gpu or gpu_cpu
想问一下,后面的选项cpu, gpu or gpu_cpu,都有什么不同呢?选-nb gpu和-nb gpu_cpu有什么不同吗?(字面上理解是GPU和CPU同时运行,不知道是不是)
然后,还想问一下,我之前用的是mpirun -np 12 mdrun_mpi -v -deffnm md_0_1这个命令,如果后面追加-nb gpu,是不是在多线程运行下,再加上GPU加速呢??谢谢!!
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smutao

禁虫 (著名写手)


感谢参与,应助指数 +1
abinitio: 金币+1, 感谢应助 2014-11-21 08:14:13
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2楼2014-11-19 11:34:07
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zhangmao511

铁虫 (小有名气)

我想知道安装了GPU,执行mdrun的命令是怎么样的????
3楼2014-11-20 11:44:02
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wangyq126

禁虫 (初入文坛)


abinitio: 金币+1, 感谢应助 2014-11-21 14:54:19
本帖内容被屏蔽

4楼2014-11-21 14:26:11
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