24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2052  |  回复: 3

zhangmao511

铁虫 (小有名气)

[求助] Gromacs 运行GPU加速命令的问题 已有1人参与

最近想尝试用GPU加速,来跑Gromacs,看了下官网手册,说在mdrun命令的时候,追加-nb gpu即可。
-nb enum auto Calculate non-bonded interactions on: auto, cpu, gpu or gpu_cpu
想问一下,后面的选项cpu, gpu or gpu_cpu,都有什么不同呢?选-nb gpu和-nb gpu_cpu有什么不同吗?(字面上理解是GPU和CPU同时运行,不知道是不是)
然后,还想问一下,我之前用的是mpirun -np 12 mdrun_mpi -v -deffnm md_0_1这个命令,如果后面追加-nb gpu,是不是在多线程运行下,再加上GPU加速呢??谢谢!!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

smutao

禁虫 (著名写手)


感谢参与,应助指数 +1
abinitio: 金币+1, 感谢应助 2014-11-21 08:14:13
本帖内容被屏蔽

2楼2014-11-19 11:34:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmao511

铁虫 (小有名气)

我想知道安装了GPU,执行mdrun的命令是怎么样的????
3楼2014-11-20 11:44:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyq126

禁虫 (初入文坛)


abinitio: 金币+1, 感谢应助 2014-11-21 14:54:19
本帖内容被屏蔽

4楼2014-11-21 14:26:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhangmao511 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 301求调剂 +14 121. 2026-04-04 14/700 2026-04-06 22:52 by qlm5820
[硕博家园] 0856材料化工求调剂,一志愿211,初试成绩349 +4 江淮北月 2026-04-05 4/200 2026-04-06 22:44 by chenzhimin
[考研] 328求调剂 +3 ghhh88888 2026-04-06 3/150 2026-04-06 21:35 by 啵啵啵0119
[考研] 求助 +3 卡卡东88 2026-04-06 4/200 2026-04-06 15:28 by going home
[考研] 材料工程310专硕调剂 +14 捞捞我…. 2026-04-04 15/750 2026-04-06 14:18 by lqwchd
[考研] 一志愿河北工业大学材料工程,初试344求专硕调剂 +6 15933906766 2026-04-05 6/300 2026-04-06 13:21 by 无际的草原
[考研] 求调剂 +5 chenxrlkx 2026-04-05 7/350 2026-04-06 07:54 by houyaoxu
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 20:07 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿9材料学硕297已过六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-04-04 12/600 2026-04-05 19:04 by 蓝云思雨
[考研] 工科08专硕机械275求调剂 +3 AaAa7420 2026-04-02 3/150 2026-04-05 13:26 by jp9609
[考研] 一志愿西北农林畜牧专硕336分求调剂 +3 5ourr 2026-04-03 3/150 2026-04-05 10:40 by JOKER0401
[考研] 311分 22408 求调剂 +3 bing_bot 2026-04-03 3/150 2026-04-05 00:43 by chongya
[考研] 材料与化工306分找调剂 +23 沧海轻舟e 2026-04-02 27/1350 2026-04-04 21:52 by laoshidan
[考研] 求生物学调剂 +14 15172915737 2026-04-01 14/700 2026-04-04 20:13 by babysonlkd
[考研] 材料科学与工程考研 +10 拯救皮特托先生 2026-04-02 10/500 2026-04-03 23:57 by userper
[考研] 311求调剂 +20 zchqwer 2026-04-01 22/1100 2026-04-03 22:09 by lglzsd
[考研] 求调剂 +9 akdhjs 2026-03-31 11/550 2026-04-03 13:32 by akdhjs
[考研] 一志愿中国科学院大学265求调剂 +9 恬淡ye 2026-03-31 10/500 2026-04-03 11:10 by txp1986
[考研] 求调剂推荐 +3 南山南@ 2026-04-01 3/150 2026-04-02 12:09 by xiaoranmu
[考研] 0710生物学求调剂 +9 manman511 2026-04-01 9/450 2026-04-02 10:00 by zxl830724
信息提示
请填处理意见