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[求助]
有关差异蛋白组的问题，求大神帮助！！！ 已有3人参与
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小女子新虫一枚，从没接触过蛋白组相关的知识，最近想在原来的实验基础上进行差异蛋白组的试验，求大神给一条明路 。我以前的试验是关于黄瓜的逆境生理，我的问题是：1、有关差异蛋白组的试验从哪里开展？是否用iTRAQ就可以得到相关的差异蛋白的信息？ 2、找到差异蛋白之后如何进行更深入的研究？ 3、能否推荐几篇国际上最新的有关作物逆境差异蛋白组研究的文章？ 不胜感激，小女子在这里叩谢了！ |
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calorimetry
铜虫 (正式写手)
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- 专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
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1、有关差异蛋白组的试验从哪里开展？是否用iTRAQ就可以得到相关的差异蛋白的信息？ iTRAQ（isobaric tags for relative and absolute quantitation）技术是由AB SCIEX公司研发的一种体外同重同位素标记的相对与绝对定量技术。该技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团，经高精度质谱仪串联分析，可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量，是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。这不过是差异蛋白质组的一种研究方法。其他的研究方法很多，比如二维电泳，werstern blotting，基因表达谱等方法多了去了。 2、找到差异蛋白之后如何进行更深入的研究？ 空间结构的预测与测定、功能的预测与测定、相互作用的预测与测定、折叠与蛋白质稳定性、生物大分子网络（基因表达网络、信号传导网络、代谢网络等），你想具体怎么讨论，我们可以再具体讨论。 3、能否推荐几篇国际上最新的有关作物逆境差异蛋白组研究的文章？ 这在SCI文献库里很容易用关键词搜出来呀。到是植物蛋白质组学研究的手册，你不好找，植物蛋白质组学研究的手册要吗？英文版的PDF，要的话，我送你一本，发在论坛里。 |
sunny_pl09115楼2015-06-24 15:44:25
| 你好，iTRAQ是做差异蛋白的经典方法。这一步是发现差异蛋白，然后做个验证，用与iTRAQ正交的方法，比如werstern，MRM, 或者PCR都行，证明确实是表达有差异，然后再做功能学的实验。没做过植物的研究，这个就不好多说了。给个邮箱，我发你一篇个人觉得还算经典的逆境蛋白组学的综述。 |
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