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sunny_pl0911

铜虫 (初入文坛)

[求助] 有关差异蛋白组的问题,求大神帮助!!! 已有3人参与

小女子新虫一枚,从没接触过蛋白组相关的知识,最近想在原来的实验基础上进行差异蛋白组的试验,求大神给一条明路。我以前的试验是关于黄瓜的逆境生理,我的问题是:
    1、有关差异蛋白组的试验从哪里开展?是否用iTRAQ就可以得到相关的差异蛋白的信息?
    2、找到差异蛋白之后如何进行更深入的研究?
    3、能否推荐几篇国际上最新的有关作物逆境差异蛋白组研究的文章?
    不胜感激,小女子在这里叩谢了!
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Doctor V.
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七夕小巫

金虫 (小有名气)

你好,iTRAQ是做差异蛋白的经典方法。这一步是发现差异蛋白,然后做个验证,用与iTRAQ正交的方法,比如werstern,MRM, 或者PCR都行,证明确实是表达有差异,然后再做功能学的实验。没做过植物的研究,这个就不好多说了。给个邮箱,我发你一篇个人觉得还算经典的逆境蛋白组学的综述。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2014-12-01 14:35:48
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sunny_pl0911

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 七夕小巫 at 2014-12-01 14:35:48
你好,iTRAQ是做差异蛋白的经典方法。这一步是发现差异蛋白,然后做个验证,用与iTRAQ正交的方法,比如werstern,MRM, 或者PCR都行,证明确实是表达有差异,然后再做功能学的实验。没做过植物的研究,这个就不好多说 ...

不知道怎么回事儿,今天才看到回复,太不好意思了,我的邮箱是:baby_pl0911@163.com,不知能否再给我发一下,万分感谢!
Doctor V.
3楼2015-06-24 09:22:23
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ganfucell

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你好:
1、差异蛋白质组要从双向电泳开始,比较经典的有国内北京六一产的、进口伯乐Bio-Rad.
2、双向电泳是找差异蛋白的,找到差异蛋白后要进行质谱分析,确定差异蛋白是什么,判定此蛋白与你的胁迫的关系;也可进一步进行基因研究。
3、文章很多,很好找,上国际网站查一下就行。
理想爱情事业
4楼2015-06-24 13:30:03
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calorimetry

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

1、有关差异蛋白组的试验从哪里开展?是否用iTRAQ就可以得到相关的差异蛋白的信息?
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是由AB SCIEX公司研发的一种体外同重同位素标记的相对与绝对定量技术。该技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,经高精度质谱仪串联分析,可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量,是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。这不过是差异蛋白质组的一种研究方法。其他的研究方法很多,比如二维电泳,werstern blotting,基因表达谱等方法多了去了。

2、找到差异蛋白之后如何进行更深入的研究?
空间结构的预测与测定、功能的预测与测定、相互作用的预测与测定、折叠与蛋白质稳定性、生物大分子网络(基因表达网络、信号传导网络、代谢网络等),你想具体怎么讨论,我们可以再具体讨论。

3、能否推荐几篇国际上最新的有关作物逆境差异蛋白组研究的文章?
这在SCI文献库里很容易用关键词搜出来呀。到是植物蛋白质组学研究的手册,你不好找,植物蛋白质组学研究的手册要吗?英文版的PDF,要的话,我送你一本,发在论坛里。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2015-06-24 15:44:25
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sunny_pl0911

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by calorimetry at 2015-06-24 15:44:25
1、有关差异蛋白组的试验从哪里开展?是否用iTRAQ就可以得到相关的差异蛋白的信息?
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是由AB SCIEX公司研发的一种体外同重同位素标记的相对与绝 ...

嗯嗯,太感谢了,能否发到我的邮箱里面:baby_pl0911@163.com,感激不尽!
Doctor V.
6楼2015-06-30 09:13:49
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sunny_pl0911

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ganfucell at 2015-06-24 13:30:03
你好:
1、差异蛋白质组要从双向电泳开始,比较经典的有国内北京六一产的、进口伯乐Bio-Rad.
2、双向电泳是找差异蛋白的,找到差异蛋白后要进行质谱分析,确定差异蛋白是什么,判定此蛋白与你的胁迫的关系;也可 ...

谢谢!
Doctor V.
7楼2015-06-30 09:14:20
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calorimetry

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by sunny_pl0911 at 2015-06-30 09:13:49
嗯嗯,太感谢了,能否发到我的邮箱里面:baby_pl0911@163.com,感激不尽!...

不好意思,今天没有带来。明天一定发送给你。
8楼2015-07-01 10:15:03
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calorimetry

铜虫 (正式写手)

sunny_pl0911:我昨晚在学校开会,开的比较晚,没有回家,回北大宿舍了,结果发现宿舍的U盘里没有该文件。家里的笔记本电脑上才有,今天回家发给你。
9楼2015-07-02 09:05:44
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calorimetry

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

有两个邮件,含有共六本蛋白质组学的实验手册的PDF附件,全英文版,Methods in Molecular Biology Series的,昨晚已经发送至楼主的邮箱,请查收。
10楼2015-07-03 08:44:15
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