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铁虫 (初入文坛)

[交流] 向高人请教,关于构建系统发育树的,谢谢! 已有9人参与

你们好,我的16s rDNA测序好,我拿反向序列(通用1492R)去ezbiocloud中去比对(选择3’至5’比对)显示相似性是97%,然后我挑了两个同属的和若干个不同属的菌在一起构建系统发育树,但结果显示该菌株与其他菌的bootstrap值很低 完全不在一个分支上,请问这是怎么回事?求高人指教 谢谢你们!
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BinBinzjb

铁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
会不会是你序列弄反了啊?你下载的序列可能是5‘到3’,而你目的序列是3‘到5',这样在一起比对时,差异就很大,就会导致形成2个大分枝。
守得了黑夜
8楼2014-11-04 11:21:59
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13611899123

铁虫 (初入文坛)

忘了说了,对不起,我没什么分,所以。。。。哎-
2楼2014-10-30 19:36:02
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13611899123

铁虫 (初入文坛)

做出来就和这个图一样。。。
向高人请教,关于构建系统发育树的,谢谢!
123.png

3楼2014-10-30 22:06:19
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轻风CYg

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个我也搞不懂啊!有点高端!

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-10-31 07:32:00
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