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xiaoxiao0301

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求助cif文件中两个B类错误的解决方法 已有1人参与

Alert level B
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O4     -   H4A    ...     Please Check
PLAT601_ALERT_2_B Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .        107 Ang3
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1楼 2014-10-23 13:39:48
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匿名

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2楼2014-10-23 14:50:51
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xiaoxiao0301

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lich666 at 2014-10-23 14:50:51
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O4     -   H4A    ...     Please Check
O4上的氢没有氢键的受体，你氢键有点问题，仔细检查下结构。
PLAT601_ALERT_2_B Structure Contains Solvent Accessible ...

O4上的氢没有氢键的受体，可是我不管怎么加氢都有这个问题问题。我也用platon的squeeze计算下空洞的体积，可是体积好小。

Highest peak    2.33  at  0.4799  0.0947  0.6217  [  2.09 A from H4A ]
这个数值有问题。如果有原子没指认，那怎么办？
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3楼2014-10-23 15:14:45
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匿名

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4楼2014-10-23 17:26:32
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xiaoxiao0301

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lich666 at 2014-10-23 17:26:32
估计这个Q峰是个原子，你可以找人看看。要不你发给我邮箱我给你看看，wangff666@126.com...

哦，那我找人看看，谢谢你了
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5楼2014-10-24 09:49:33
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