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cham208

木虫 (正式写手)

[求助] CIF有B类错误,求帮忙修改已有1人参与

很早前的一个晶体,最近投稿审稿人说有B类错误,请高手帮忙修改,不胜感激!
可发我邮箱:fxdmlzm@163.com

错误如下:
PLAT029_ALERT_3_B   _diffrn_measured_fraction_theta_full Low ....... 0.959 Note
PLAT222_ALERT_3_B   Large Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 8.8 Ratio
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  • 2014-03-27 10:43:44, 649.27 K

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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by forever1706 at 2014-03-28 19:16:35
老歪博, 请教你一个问题: 一个晶体正常解完了, 在哪里看分辨率.数据测试和还原是负责测试的老师做的.....

晶体如果是你自己测的,当然你可以设置最合适的分表率。如果是别人测的,你解析结构,XPREP后会产生prp文件,可以查看prp文件,可以看到衍射数据的分表率以及对应的数据完整度、重复度以及Rint值等。
老歪博
10楼2014-03-28 19:27:01
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普通回帖

ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

少一个hkl文件,没有办法精修。估计是需要使用omit -3 50.2命令,Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 8.8 Ratio可能是有氢原子需要dfix
2楼2014-03-27 16:16:31
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cham208

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ljmmarise at 2014-03-27 16:16:31
少一个hkl文件,没有办法精修。估计是需要使用omit -3 50.2命令,Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 8.8 Ratio可能是有氢原子需要dfix

我找不到hkl文件了,还有其它办法吗?多谢
3楼2014-03-27 16:42:04
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cham208: 金币+50, 有帮助 2014-03-27 19:38:53
需要找到数据文件hkl文件和fcf文件等,在ins文件中加入适当的命令,进行精修。有可能去掉这2个B类问题。
老歪博
4楼2014-03-27 18:32:03
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cham208

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by p452_1 at 2014-03-27 18:32:03
需要找到数据文件hkl文件和fcf文件等,在ins文件中加入适当的命令,进行精修。有可能去掉这2个B类问题。

我hkl文件找不到了,还有其他办法吗?
5楼2014-03-27 19:38:40
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
cham208: 金币+50, ★★★很有帮助 2014-03-28 18:25:34
cham208: 金币+100, ★★★很有帮助, 非常感谢,已将论文返回,期待好远!!! 2014-04-27 11:31:19
引用回帖:
5楼: Originally posted by cham208 at 2014-03-27 19:38:40
我hkl文件找不到了,还有其他办法吗?...

很可惜,你找不到原始数据文件了。但是,如果你不是纯粹发表结构,搭配一些性质发表,其实只要你能够给这2个B类问题以合理的解释,幸运的话应该会接受发表。
一般对第二个问题的合理解释是:This alert is due to the fact that hydrogen atom thermal parameters were actually refined instead of being fixed at a multiplier of the nonhydrogen atom to which it is
covalently bonded. Some of the hydrogen isotropic thermal parameters refined to low (but positive) values.
一般对第一个问题的合理解释,because their coverage was between 95% and 96% at a resolution of 0.83 Å. The alert B “ threshold”
value is 95.9% at this resolution. 这相当于说在允许发表的分辨率0.83时,数据的完整度只能够达到95%到96%之间。即使重收数据也不会提高完整度。我不知道你的情况是否属于这种。写在这里仅供你参考。
老歪博
6楼2014-03-28 06:48:54
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cham208

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by p452_1 at 2014-03-28 06:48:54
很可惜,你找不到原始数据文件了。但是,如果你不是纯粹发表结构,搭配一些性质发表,其实只要你能够给这2个B类问题以合理的解释,幸运的话应该会接受发表。
一般对第二个问题的合理解释是:This alert is due to ...

3个比较简单的晶体加一些性能,投Journal of coordination chemistry,审稿意见是小修,没有提太大问题。
关于CIF的B类错误意见是:“ In P17, checkCIF report, there is a level “B” alert, if it is not allowed, please modify it as better as possible. ”
麻烦帮我再分析一下,谢谢!
7楼2014-03-28 18:25:16
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forever1706

禁虫 (知名作家)

引用回帖:
6楼: Originally posted by p452_1 at 2014-03-28 06:48:54
很可惜,你找不到原始数据文件了。但是,如果你不是纯粹发表结构,搭配一些性质发表,其实只要你能够给这2个B类问题以合理的解释,幸运的话应该会接受发表。
一般对第二个问题的合理解释是:This alert is due to ...

老歪博, 请教你一个问题: 一个晶体正常解完了, 在哪里看分辨率.数据测试和还原是负责测试的老师做的..
8楼2014-03-28 19:16:35
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by cham208 at 2014-03-28 18:25:16
3个比较简单的晶体加一些性能,投Journal of coordination chemistry,审稿意见是小修,没有提太大问题。
关于CIF的B类错误意见是:“ In P17, checkCIF report, there is a level “B” alert, if it is not all ...

看你说的这个审稿意见,似乎没有太大问题。你只需要比较礼貌的合乎逻辑的回答这个问题就可以过关。
首先你需要陈述的事实是这2个“B” alert不影响结构的正确性,从而不影响你对结构和性质的解释。然后你再比较客观地解释一下你已经努力了,但是改进不了这2个“B” alert,再泛泛陈述一下它们产生的原因。
注意简洁,不要画蛇添足,应该就可以接受了。

预祝你成功!
老歪博
9楼2014-03-28 19:21:13
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